Protein–RNA interactions for Protein: P27815

PDE4A, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4A, humanhuman

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Length 886 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4AP27815 ATF2-203ENST00000392544 1919 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
PDE4AP27815 MTFR2-205ENST00000451457 1524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
PDE4AP27815 TM4SF1-201ENST00000305366 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
PDE4AP27815 ZNF555-201ENST00000334241 8557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
PDE4AP27815 HERC4-202ENST00000373700 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
PDE4AP27815 NAA11-201ENST00000286794 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
PDE4AP27815 ZC3H11B-202ENST00000636126 4432 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
PDE4AP27815 XRCC6P3-201ENST00000422187 1621 ntBASIC10□□□□□ -0.81
PDE4AP27815 MTF2-214ENST00000545708 4046 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
PDE4AP27815 ARHGAP24-202ENST00000395183 2740 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
PDE4AP27815 GPX8-203ENST00000503787 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
PDE4AP27815 TRPM8-201ENST00000324695 5621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
PDE4AP27815 DCLRE1C-211ENST00000396817 2761 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
PDE4AP27815 FAM13C-216ENST00000618427 3458 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
PDE4AP27815 ZNF10-201ENST00000248211 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
PDE4AP27815 RUNX1T1-249ENST00000613886 7401 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
PDE4AP27815 CXCL8-201ENST00000307407 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
PDE4AP27815 HMBOX1-211ENST00000524238 1731 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
PDE4AP27815 TIA1-201ENST00000282574 3823 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
PDE4AP27815 OR4K1-201ENST00000285600 1076 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
PDE4AP27815 DEFB105A-201ENST00000334773 330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
PDE4AP27815 MRAP-202ENST00000339944 440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
PDE4AP27815 GPN2-201ENST00000374133 715 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
PDE4AP27815 RACK1-201ENST00000376817 965 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
PDE4AP27815 CCNG1P1-201ENST00000406783 885 ntBASIC10□□□□□ -0.81
PDE4AP27815 AC008770.1-201ENST00000406892 1257 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
PDE4AP27815 AC019181.1-201ENST00000417151 310 ntBASIC10□□□□□ -0.81
PDE4AP27815 RPS10P2-201ENST00000430953 494 ntBASIC10□□□□□ -0.81
PDE4AP27815 MTND4LP10-201ENST00000435146 291 ntBASIC10□□□□□ -0.81
PDE4AP27815 AC087501.1-201ENST00000445617 715 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
PDE4AP27815 AL109945.1-201ENST00000448134 687 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
PDE4AP27815 LINC01795-201ENST00000454367 813 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
PDE4AP27815 AL354872.1-201ENST00000456361 967 ntBASIC10□□□□□ -0.81
PDE4AP27815 AC115223.1-201ENST00000466377 870 ntBASIC10□□□□□ -0.81
PDE4AP27815 RN7SL77P-201ENST00000473332 294 ntBASIC10□□□□□ -0.81
PDE4AP27815 MTCYBP18-201ENST00000501056 747 ntBASIC10□□□□□ -0.81
PDE4AP27815 CCDC11P1-201ENST00000503137 1162 ntBASIC10□□□□□ -0.81
PDE4AP27815 AC097521.1-201ENST00000505488 567 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
PDE4AP27815 LINC02064-202ENST00000507876 403 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
PDE4AP27815 ATP1B1P1-201ENST00000509767 915 ntBASIC10□□□□□ -0.81
PDE4AP27815 POLR2K-203ENST00000522439 543 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
PDE4AP27815 PRB4-203ENST00000535904 796 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
PDE4AP27815 AC006065.2-201ENST00000536978 211 ntBASIC10□□□□□ -0.81
PDE4AP27815 AC117498.2-202ENST00000549864 473 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
PDE4AP27815 DDIT3-205ENST00000552740 951 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
PDE4AP27815 AC044913.1-201ENST00000557200 430 ntBASIC10□□□□□ -0.81
PDE4AP27815 AC007375.2-201ENST00000557752 603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
PDE4AP27815 LINC02137-201ENST00000561906 644 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
PDE4AP27815 MT1L-202ENST00000566367 78 ntBASIC10□□□□□ -0.81
PDE4AP27815 AC015853.3-201ENST00000570974 478 ntTSL 4 BASIC10□□□□□ -0.81
PDE4AP27815 GATA6-AS1-201ENST00000579431 481 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
PDE4AP27815 AC090912.2-203ENST00000581177 477 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
PDE4AP27815 SMARCA2-229ENST00000634781 1106 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
PDE4AP27815 OR5T1-201ENST00000641368 1118 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
PDE4AP27815 CPSF6-202ENST00000435070 6616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
PDE4AP27815 EIF4G3-201ENST00000264211 5802 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
PDE4AP27815 FOXM1-201ENST00000342628 3475 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
PDE4AP27815 CCDC39-201ENST00000442201 3279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
PDE4AP27815 CACNB2-213ENST00000612134 3825 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
PDE4AP27815 TCL6-201ENST00000352367 3398 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
PDE4AP27815 COL6A5-201ENST00000265379 9214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
PDE4AP27815 AC068860.1-201ENST00000623701 3736 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
PDE4AP27815 ZNF585B-204ENST00000531805 2971 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
PDE4AP27815 AC132825.1-201ENST00000463573 2247 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
PDE4AP27815 CFHR5-201ENST00000256785 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
PDE4AP27815 DSG3-201ENST00000257189 5525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
PDE4AP27815 AC107983.2-201ENST00000425211 4735 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
PDE4AP27815 RIPOR2-205ENST00000510784 3381 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
PDE4AP27815 SORBS1-210ENST00000371246 6931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
PDE4AP27815 AC004672.1-201ENST00000513082 2088 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
PDE4AP27815 ICA1L-202ENST00000392237 5173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
PDE4AP27815 EDDM3A-201ENST00000326842 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
PDE4AP27815 Y_RNA.372-201ENST00000365599 102 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
PDE4AP27815 GPR52-201ENST00000367685 1088 ntAPPRIS P1 BASIC9.99□□□□□ -0.81
PDE4AP27815 RNU6-31P-201ENST00000384388 108 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
PDE4AP27815 RPL24-201ENST00000394077 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
PDE4AP27815 OR5H8-201ENST00000394191 1045 ntAPPRIS P1 BASIC9.99□□□□□ -0.81
PDE4AP27815 COX6A1P3-201ENST00000404167 293 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
PDE4AP27815 PRR21-201ENST00000408934 1170 ntAPPRIS P1 BASIC9.99□□□□□ -0.81
PDE4AP27815 LSM5-202ENST00000409292 538 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
PDE4AP27815 RNA5SP80-201ENST00000410475 111 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
PDE4AP27815 RN7SKP56-201ENST00000410513 331 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
PDE4AP27815 AC073367.1-201ENST00000421480 697 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
PDE4AP27815 LINC01445-201ENST00000426205 812 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
PDE4AP27815 LINC01850-201ENST00000429916 357 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
PDE4AP27815 RPSAP53-201ENST00000433498 862 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
PDE4AP27815 RPS28P8-201ENST00000435020 208 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
PDE4AP27815 AL441992.1-201ENST00000443631 544 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
PDE4AP27815 AL353898.1-201ENST00000444055 238 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
PDE4AP27815 AC068492.1-201ENST00000448672 469 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
PDE4AP27815 FTH1P7-201ENST00000450676 552 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
PDE4AP27815 AC013828.1-201ENST00000481845 158 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
PDE4AP27815 RPL19P13-201ENST00000483119 583 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
PDE4AP27815 VPS26AP1-201ENST00000483197 979 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
PDE4AP27815 LINC02517-201ENST00000509453 492 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
PDE4AP27815 OR7E85P-201ENST00000512164 985 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
PDE4AP27815 AC060765.1-202ENST00000518367 257 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
PDE4AP27815 UQCRB-209ENST00000523920 695 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
PDE4AP27815 OR5AK1P-201ENST00000524837 922 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
PDE4AP27815 AC090707.1-201ENST00000528795 396 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
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