Protein–RNA interactions for Protein: P24723

PRKCH, Protein kinase C eta type, humanhuman

Predictions only

Length 683 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCHP24723 RPL19P11-201ENST00000495944 589 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
PRKCHP24723 NPM1P27-201ENST00000502784 830 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
PRKCHP24723 AC135457.1-201ENST00000503553 664 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
PRKCHP24723 AC112184.1-201ENST00000505179 312 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
PRKCHP24723 RNA5SP441-201ENST00000516809 88 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
PRKCHP24723 AC011853.1-201ENST00000518911 454 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
PRKCHP24723 AL133399.1-201ENST00000527476 298 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
PRKCHP24723 AC005363.1-201ENST00000530779 351 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
PRKCHP24723 LINC00944-204ENST00000544499 366 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
PRKCHP24723 AL161752.1-201ENST00000557721 263 ntTSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
PRKCHP24723 AC011468.1-201ENST00000569091 675 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
PRKCHP24723 AC026471.4-201ENST00000569291 449 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
PRKCHP24723 AC006305.2-201ENST00000589617 552 ntTSL 4 BASIC6.66□□□□□ -1.34
PRKCHP24723 AC245128.3-201ENST00000594721 748 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
PRKCHP24723 AC097467.3-216ENST00000599555 1293 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
PRKCHP24723 BUB1P1-201ENST00000603541 607 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
PRKCHP24723 IGKV2OR2-1-201ENST00000605129 304 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
PRKCHP24723 U1.41-201ENST00000617626 165 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
PRKCHP24723 AC005277.2-201ENST00000617898 390 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
PRKCHP24723 AC073592.6-201ENST00000624271 415 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
PRKCHP24723 AL359094.1-201ENST00000627944 566 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
PRKCHP24723 CASC19-274ENST00000642018 970 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
PRKCHP24723 BDNF-203ENST00000395978 3988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
PRKCHP24723 AP004289.1-201ENST00000436307 2205 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
PRKCHP24723 CNTN3-201ENST00000263665 4948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
PRKCHP24723 PMS2-203ENST00000382321 1386 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
PRKCHP24723 TMC1-201ENST00000297784 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
PRKCHP24723 FOXJ3-204ENST00000372572 5352 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
PRKCHP24723 MEF2C-249ENST00000637481 6088 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
PRKCHP24723 LCP2-201ENST00000046794 4678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
PRKCHP24723 NIT2-201ENST00000394140 7289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
PRKCHP24723 AC006213.6-201ENST00000623722 4179 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
PRKCHP24723 SMG1P5-202ENST00000529428 4219 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
PRKCHP24723 SMG1P2-201ENST00000566127 4221 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
PRKCHP24723 ACPP-202ENST00000351273 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
PRKCHP24723 ZNF532-222ENST00000591083 5324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
PRKCHP24723 AC006511.3-201ENST00000624929 1783 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
PRKCHP24723 MYO3B-203ENST00000409044 5448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
PRKCHP24723 BTK-209ENST00000618050 2417 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
PRKCHP24723 LINC02249-202ENST00000562624 4260 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
PRKCHP24723 TRPM7-201ENST00000313478 10400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
PRKCHP24723 PLSCR2-201ENST00000336685 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
PRKCHP24723 PRPS1-202ENST00000372419 628 ntTSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
PRKCHP24723 SNORA70H-201ENST00000383910 135 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
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PRKCHP24723 LINC00463-201ENST00000413501 1147 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
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PRKCHP24723 CLYBL-AS2-201ENST00000430125 695 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
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PRKCHP24723 RN7SL552P-201ENST00000462094 276 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
PRKCHP24723 LINC02025-201ENST00000488348 360 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
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PRKCHP24723 AL078601.3-201ENST00000573303 535 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
PRKCHP24723 IGFL2-AS1-206ENST00000601263 446 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
PRKCHP24723 AL713998.2-201ENST00000604538 1198 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
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PRKCHP24723 uc_338.31-201ENST00000615595 186 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
PRKCHP24723 MIR6071-201ENST00000616741 78 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
PRKCHP24723 AC004836.1-201ENST00000623032 634 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
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PRKCHP24723 TAF12-202ENST00000373824 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
PRKCHP24723 LINC00939-201ENST00000502479 4972 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
PRKCHP24723 OR2G6-202ENST00000641501 5840 ntAPPRIS P1 BASIC6.65□□□□□ -1.35
PRKCHP24723 NLGN4X-202ENST00000381092 3750 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.35
PRKCHP24723 GBP1-201ENST00000370473 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
PRKCHP24723 TGIF1-211ENST00000548489 1536 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.35
PRKCHP24723 CNTN1-204ENST00000547849 3125 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
PRKCHP24723 CNOT4-205ENST00000423368 3297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
PRKCHP24723 BBOX1-205ENST00000529202 1725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
PRKCHP24723 LINC01751-201ENST00000569178 1770 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
PRKCHP24723 MTPAP-201ENST00000263063 5601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
PRKCHP24723 CREB5-201ENST00000357727 8532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
PRKCHP24723 ZNF329-203ENST00000597186 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
PRKCHP24723 AC010328.1-201ENST00000596769 4060 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
PRKCHP24723 SGMS2-203ENST00000394686 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
PRKCHP24723 CLEC4E-201ENST00000299663 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
PRKCHP24723 BTN3A2-203ENST00000396934 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
PRKCHP24723 SLCO1C1-207ENST00000540354 2529 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
PRKCHP24723 FASLG-201ENST00000340030 917 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
PRKCHP24723 DEFB126-201ENST00000382398 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
PRKCHP24723 TRAV1-2-201ENST00000390423 402 ntAPPRIS P1 BASIC6.64□□□□□ -1.35
PRKCHP24723 PPARG-204ENST00000397000 1122 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
PRKCHP24723 YWHAZP6-201ENST00000399764 738 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
PRKCHP24723 RNA5SP198-201ENST00000410376 127 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
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