Protein–RNA interactions for Protein: O95484

CLDN9, Claudin-9, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN9O95484 BFSP2-AS1-201ENST00000515542 894 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
CLDN9O95484 AC107909.1-201ENST00000523226 595 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CLDN9O95484 AC135983.3-201ENST00000528049 1226 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
CLDN9O95484 AC078789.1-201ENST00000547084 477 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CLDN9O95484 AC025031.1-201ENST00000552634 562 ntTSL 4 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CLDN9O95484 PWRN1-208ENST00000567647 561 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CLDN9O95484 AC134312.6-201ENST00000568587 444 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CLDN9O95484 AC025283.1-201ENST00000572039 734 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
CLDN9O95484 DYNLL1P1-201ENST00000595442 269 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
CLDN9O95484 AP003789.1-201ENST00000617737 605 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
CLDN9O95484 DRG1-207ENST00000629688 309 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CLDN9O95484 OR5A2-202ENST00000641361 6655 ntAPPRIS P1 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CLDN9O95484 CX3CR1-201ENST00000358309 3151 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CLDN9O95484 SLC2A14-203ENST00000431042 3458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
CLDN9O95484 FCGR1B-209ENST00000616817 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CLDN9O95484 LINC02141-201ENST00000568279 6586 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
CLDN9O95484 GBP3-202ENST00000370481 3067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
CLDN9O95484 AL035665.1-201ENST00000428495 1669 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CLDN9O95484 AL355377.1-201ENST00000621125 1653 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
CLDN9O95484 PUM2-202ENST00000338086 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
CLDN9O95484 RIPK1-202ENST00000380409 3864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
CLDN9O95484 ST7-203ENST00000393443 2360 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
CLDN9O95484 FAR2-201ENST00000182377 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
CLDN9O95484 ZNF177-202ENST00000589262 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
CLDN9O95484 LGSN-204ENST00000622415 1612 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
CLDN9O95484 LINC01205-201ENST00000489670 1331 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
CLDN9O95484 RUNX1T1-234ENST00000521553 1346 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
CLDN9O95484 TXNRD1-212ENST00000526390 3808 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
CLDN9O95484 VEZF1-204ENST00000584396 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
CLDN9O95484 BCORP1-202ENST00000441139 3461 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
CLDN9O95484 AL359091.1-201ENST00000449048 1734 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
CLDN9O95484 BX322639.1-201ENST00000609841 6590 ntTSL 4 BASIC6.03□□□□□ -1.44
CLDN9O95484 HELZ-207ENST00000580168 6279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
CLDN9O95484 CYLD-210ENST00000566206 3104 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
CLDN9O95484 BPIFA2-201ENST00000253362 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
CLDN9O95484 BPIFA2-202ENST00000354932 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
CLDN9O95484 C2orf88-202ENST00000396974 998 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
CLDN9O95484 SULT6B1-201ENST00000407963 902 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
CLDN9O95484 MRPL35-203ENST00000409180 651 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
CLDN9O95484 AC104777.1-202ENST00000413247 774 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
CLDN9O95484 DHFRP2-201ENST00000414224 547 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
CLDN9O95484 AC005162.1-201ENST00000416513 389 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
CLDN9O95484 UBQLN1P1-207ENST00000441056 1169 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
CLDN9O95484 OR2L9P-201ENST00000444456 913 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
CLDN9O95484 AC104457.2-201ENST00000446055 467 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
CLDN9O95484 COX4I1P2-201ENST00000447446 547 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
CLDN9O95484 AL031275.1-201ENST00000457405 418 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
CLDN9O95484 RPL12P31-201ENST00000478433 450 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
CLDN9O95484 AC112496.1-201ENST00000497961 562 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
CLDN9O95484 KHDC1P1-201ENST00000511053 508 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
CLDN9O95484 MEF2C-AS1-211ENST00000514092 501 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
CLDN9O95484 NEDD8-203ENST00000524927 653 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
CLDN9O95484 CYCSP25-201ENST00000525280 316 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
CLDN9O95484 AC069234.2-202ENST00000535720 583 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
CLDN9O95484 AC124891.1-201ENST00000536322 519 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
CLDN9O95484 TDGP1-201ENST00000543961 1229 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
CLDN9O95484 DAAM1-208ENST00000556135 582 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
CLDN9O95484 AC009145.2-201ENST00000562685 377 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
CLDN9O95484 AC103810.5-201ENST00000581622 560 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
CLDN9O95484 LINC01916-201ENST00000582028 559 ntTSL 4 BASIC6.03□□□□□ -1.44
CLDN9O95484 MIR212-201ENST00000586026 110 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
CLDN9O95484 ZNF43-209ENST00000598288 560 ntTSL 4 BASIC6.03□□□□□ -1.44
CLDN9O95484 AC112491.1-201ENST00000602890 248 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
CLDN9O95484 MUC1-221ENST00000610359 1101 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
CLDN9O95484 AC010998.3-201ENST00000613871 631 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
CLDN9O95484 MUC1-227ENST00000615517 951 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
CLDN9O95484 AC005899.6-201ENST00000620729 297 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
CLDN9O95484 LINC01676-209ENST00000623043 896 ntTSL 4 BASIC6.03□□□□□ -1.44
CLDN9O95484 UQCC1-208ENST00000397554 3638 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
CLDN9O95484 AC005225.5-201ENST00000623547 2225 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
CLDN9O95484 LINC00700-201ENST00000413603 2097 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
CLDN9O95484 POLR1D-218ENST00000636817 4592 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
CLDN9O95484 LRRN3-201ENST00000308478 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.44
CLDN9O95484 RNF145-206ENST00000519865 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.44
CLDN9O95484 PIGA-216ENST00000637296 2113 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
CLDN9O95484 ORC4-214ENST00000535373 6710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
CLDN9O95484 AC092724.1-201ENST00000624623 3397 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
CLDN9O95484 NPIPB8-202ENST00000529716 2058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
CLDN9O95484 RPL17-C18orf32-203ENST00000584895 1440 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
CLDN9O95484 ABCB11-201ENST00000263817 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
CLDN9O95484 CLEC4D-201ENST00000299665 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
CLDN9O95484 SGIP1-201ENST00000237247 3997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
CLDN9O95484 TMEM202-201ENST00000341689 1012 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
CLDN9O95484 OR5B21-201ENST00000360374 931 ntAPPRIS P1 BASIC6.02□□□□□ -1.45
CLDN9O95484 ZNF669-202ENST00000366500 489 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
CLDN9O95484 PAGE2B-201ENST00000374971 493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
CLDN9O95484 AC003045.1-201ENST00000398779 713 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
CLDN9O95484 RNU4-64P-201ENST00000410795 131 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
CLDN9O95484 RN7SKP121-201ENST00000410842 305 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
CLDN9O95484 NR1I3-208ENST00000412844 989 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
CLDN9O95484 AL138828.1-204ENST00000413745 898 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
CLDN9O95484 GAPDHP19-201ENST00000431768 1005 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
CLDN9O95484 AL049594.1-201ENST00000432834 805 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
CLDN9O95484 AC016582.1-203ENST00000433142 502 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
CLDN9O95484 SOCS5P1-201ENST00000440415 949 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
CLDN9O95484 AL021937.4-201ENST00000444848 444 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
CLDN9O95484 POU5F1P5-201ENST00000445059 658 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
CLDN9O95484 AC011625.1-201ENST00000455442 526 ntTSL 4 BASIC6.02□□□□□ -1.45
CLDN9O95484 AC073594.1-201ENST00000462065 364 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
CLDN9O95484 RN7SL39P-201ENST00000462264 297 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.2 ms