Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ66

KRTAP4-12, Keratin-associated protein 4-12, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP4-12Q9BQ66 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 RBM4-201ENST00000310092 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 LIMS2-209ENST00000410038 1695 ntTSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 RBBP5-202ENST00000367164 4290 ntTSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 AC073957.3-201ENST00000609998 6758 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 TSPEAR-203ENST00000613245 3524 ntTSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 AGTR2-201ENST00000371906 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 GBP2-201ENST00000370466 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 AF111167.2-201ENST00000560419 4059 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 B3GALT5-202ENST00000380618 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 DICER1-214ENST00000556045 2776 ntTSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 MYOM3-202ENST00000374434 5804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 LINC00547-201ENST00000612438 3314 ntTSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 HSP90AB1-203ENST00000371646 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 CSNK1G1-209ENST00000634811 2592 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 BRCA1-201ENST00000352993 3668 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 NCF4-201ENST00000248899 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 RIC1-201ENST00000251879 4127 ntTSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 BCAS4-202ENST00000371608 6680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 CAMSAP1-202ENST00000389532 7696 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 HERC2P10-201ENST00000570209 2393 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 ABCG2-201ENST00000237612 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 KCNH4-201ENST00000264661 3920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 LINC01140-206ENST00000484933 3368 ntTSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 EGR2-202ENST00000411732 2824 ntTSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 ROR1-204ENST00000545203 5362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 BPIFA2-201ENST00000253362 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 ATOX1-201ENST00000313115 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 KRTAP23-1-201ENST00000334160 211 ntAPPRIS P1 BASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 BPIFA2-202ENST00000354932 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 RNU6-600P-201ENST00000362524 99 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 RNU6-865P-201ENST00000364772 107 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 Y_RNA.547-201ENST00000384654 119 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 RNU6-269P-201ENST00000391077 97 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 AL645927.1-201ENST00000396783 406 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 AC016739.1-201ENST00000405359 345 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 POLR2F-202ENST00000405557 560 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 AL691426.1-201ENST00000416507 509 ntTSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 AC119751.6-201ENST00000416712 186 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 AC026884.1-201ENST00000418296 457 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 AC106900.1-201ENST00000418620 456 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 ELOBP4-201ENST00000423418 296 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 GRAMD1A-203ENST00000424536 808 ntTSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 AP001628.1-201ENST00000431150 285 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 AF064858.2-201ENST00000440714 292 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 AL133387.1-201ENST00000442188 382 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 DUX4L31-201ENST00000446466 1136 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 RN7SL23P-201ENST00000484055 275 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 RPL7AP11-201ENST00000486538 799 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 RPS29P21-201ENST00000496272 170 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 RN7SL564P-201ENST00000496309 250 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 AC091180.2-201ENST00000502823 545 ntTSL 4 BASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 AL033397.2-201ENST00000508884 547 ntTSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 AC011431.1-201ENST00000512971 230 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 AC093878.1-201ENST00000515630 432 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 C11orf45-202ENST00000524878 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 MYL6-215ENST00000549566 685 ntTSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 TROAP-213ENST00000550709 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 MTND5P40-201ENST00000559945 246 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 AC023300.1-201ENST00000562561 382 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 AC142086.3-201ENST00000563896 802 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 AC010551.2-201ENST00000569200 416 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 AP003396.5-201ENST00000578216 632 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 MIR2392-201ENST00000584881 84 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 AP005264.3-201ENST00000592370 485 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 NMRK2-202ENST00000593949 869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 AC010422.5-201ENST00000597961 585 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 NMRK2-204ENST00000599576 691 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 CYCSP1-201ENST00000604815 315 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 AL121985.2-201ENST00000621192 555 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 AC100757.2-201ENST00000622316 280 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 AC244517.10-201ENST00000624396 548 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 Z82244.2-201ENST00000632196 448 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.9 ms