Protein–RNA interactions for Protein: Q92575

UBXN4, UBX domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4Q92575 AL451142.1-201ENST00000375867 775 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
UBXN4Q92575 TRAV6-201ENST00000390428 404 ntAPPRIS P1 BASIC7.53□□□□□ -1.2
UBXN4Q92575 AP004243.1-202ENST00000398983 969 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
UBXN4Q92575 AL353151.1-201ENST00000402406 604 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
UBXN4Q92575 MIR1231-201ENST00000408101 92 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
UBXN4Q92575 PPP1R17-202ENST00000409146 569 ntTSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
UBXN4Q92575 C1D-203ENST00000409302 772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
UBXN4Q92575 AC010082.1-201ENST00000411797 546 ntTSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
UBXN4Q92575 MTCO3P4-201ENST00000419236 787 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
UBXN4Q92575 AC104698.1-201ENST00000435671 276 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
UBXN4Q92575 AL355355.1-201ENST00000442900 793 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
UBXN4Q92575 AC016903.1-201ENST00000444017 588 ntTSL 4 BASIC7.53□□□□□ -1.2
UBXN4Q92575 LINC01431-203ENST00000452395 505 ntTSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
UBXN4Q92575 AC114755.1-201ENST00000453101 868 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
UBXN4Q92575 H3F3AP5-201ENST00000475267 429 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
UBXN4Q92575 LINC02006-201ENST00000488210 524 ntTSL 4 BASIC7.53□□□□□ -1.2
UBXN4Q92575 AC090568.1-201ENST00000509499 856 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
UBXN4Q92575 AC026700.1-201ENST00000512074 544 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
UBXN4Q92575 AC087672.3-201ENST00000519323 738 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
UBXN4Q92575 AC025524.2-202ENST00000523042 535 ntTSL 4 BASIC7.53□□□□□ -1.2
UBXN4Q92575 AP003086.2-201ENST00000534168 437 ntTSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
UBXN4Q92575 AC007424.1-205ENST00000552615 579 ntTSL 4 BASIC7.53□□□□□ -1.2
UBXN4Q92575 AC023908.2-201ENST00000558616 318 ntTSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
UBXN4Q92575 AL109741.3-201ENST00000561748 592 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
UBXN4Q92575 AC009113.2-201ENST00000563182 403 ntTSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
UBXN4Q92575 AL049838.1-201ENST00000563647 981 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
UBXN4Q92575 AC007496.2-201ENST00000564801 547 ntTSL 4 BASIC7.53□□□□□ -1.2
UBXN4Q92575 AC087292.1-201ENST00000573371 512 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
UBXN4Q92575 MIR3137-201ENST00000577367 75 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
UBXN4Q92575 SNORA70D-201ENST00000578836 135 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
UBXN4Q92575 LINC01892-201ENST00000579141 507 ntTSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
UBXN4Q92575 AC005410.2-201ENST00000580270 463 ntTSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
UBXN4Q92575 AC087575.1-201ENST00000585087 229 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
UBXN4Q92575 AP001120.4-201ENST00000590231 108 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
UBXN4Q92575 AL035417.2-201ENST00000603887 796 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
UBXN4Q92575 AC012511.1-201ENST00000608140 449 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
UBXN4Q92575 AL445647.2-201ENST00000615170 130 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
UBXN4Q92575 AP2B1-222ENST00000628168 192 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
UBXN4Q92575 AC016582.3-206ENST00000636547 207 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
UBXN4Q92575 AC011346.1-204ENST00000638089 1210 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
UBXN4Q92575 TRIP12-201ENST00000283943 9874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
UBXN4Q92575 CPS1-204ENST00000451903 4770 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
UBXN4Q92575 ZNF329-203ENST00000597186 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
UBXN4Q92575 FCHSD2-201ENST00000311172 4340 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
UBXN4Q92575 TRPC4-207ENST00000426868 2709 ntTSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
UBXN4Q92575 NUP43-201ENST00000340413 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
UBXN4Q92575 ADH1B-201ENST00000305046 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
UBXN4Q92575 ZNF484-202ENST00000375495 2867 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
UBXN4Q92575 TPH1-201ENST00000250018 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
UBXN4Q92575 CPED1-201ENST00000310396 5340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
UBXN4Q92575 FIGNL1-213ENST00000615084 3368 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
UBXN4Q92575 DDX18-201ENST00000263239 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
UBXN4Q92575 MTCO1P18-201ENST00000455518 1419 ntBASIC7.52□□□□□ -1.2
UBXN4Q92575 AL358913.2-201ENST00000553881 1548 ntBASIC7.52□□□□□ -1.2
UBXN4Q92575 AC090181.3-201ENST00000624777 1514 ntBASIC7.52□□□□□ -1.2
UBXN4Q92575 DNHD1-212ENST00000527990 14298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.2
UBXN4Q92575 AC239809.3-214ENST00000496508 2513 ntTSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.21
UBXN4Q92575 AP000547.3-204ENST00000588548 2523 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
UBXN4Q92575 IL31RA-202ENST00000354961 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
UBXN4Q92575 AL132640.2-201ENST00000559968 1698 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
UBXN4Q92575 Z93022.1-201ENST00000433228 1554 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
UBXN4Q92575 PCGEM1-201ENST00000454040 1590 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
UBXN4Q92575 EOGT-208ENST00000540764 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
UBXN4Q92575 MRPS31-201ENST00000323563 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
UBXN4Q92575 AMELY-201ENST00000215479 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
UBXN4Q92575 OR9K2-201ENST00000305377 1122 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
UBXN4Q92575 TRIM55-203ENST00000350034 1177 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
UBXN4Q92575 RN7SKP1-201ENST00000365525 307 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
UBXN4Q92575 RN7SKP271-201ENST00000410528 320 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
UBXN4Q92575 VN1R33P-201ENST00000411800 887 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
UBXN4Q92575 AL109935.1-201ENST00000413249 473 ntTSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
UBXN4Q92575 LINC01347-201ENST00000417964 355 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
UBXN4Q92575 CD33-203ENST00000421133 1023 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
UBXN4Q92575 EEF1GP7-201ENST00000422983 703 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
UBXN4Q92575 ELOBP4-201ENST00000423418 296 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
UBXN4Q92575 AC093422.3-201ENST00000428506 305 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
UBXN4Q92575 Z68868.1-201ENST00000429048 544 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
UBXN4Q92575 OR5AC1-201ENST00000429239 925 ntAPPRIS P1 BASIC7.52□□□□□ -1.21
UBXN4Q92575 AL451136.1-201ENST00000435399 325 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
UBXN4Q92575 CYP2C56P-201ENST00000440076 291 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
UBXN4Q92575 AC092625.1-201ENST00000442706 393 ntTSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
UBXN4Q92575 AC005808.1-201ENST00000444112 381 ntTSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.21
UBXN4Q92575 AP001469.2-201ENST00000444966 390 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
UBXN4Q92575 RPL7P14-201ENST00000449851 741 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
UBXN4Q92575 AL096803.2-201ENST00000450032 677 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
UBXN4Q92575 PSPC1P2-201ENST00000455130 225 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
UBXN4Q92575 AC009955.1-201ENST00000455896 271 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
UBXN4Q92575 AL356270.1-201ENST00000456587 522 ntTSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
UBXN4Q92575 TPT1P1-201ENST00000458495 518 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
UBXN4Q92575 C1orf105-204ENST00000460397 462 ntTSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
UBXN4Q92575 AC135721.2-201ENST00000464237 300 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
UBXN4Q92575 RN7SL414P-201ENST00000469545 294 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
UBXN4Q92575 AC007849.1-201ENST00000469794 513 ntTSL 4 BASIC7.52□□□□□ -1.21
UBXN4Q92575 HMGB1P38-201ENST00000490557 577 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
UBXN4Q92575 AC096741.2-201ENST00000510225 637 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
UBXN4Q92575 AC083967.1-201ENST00000522354 515 ntTSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
UBXN4Q92575 AL135934.1-201ENST00000527684 537 ntTSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.21
UBXN4Q92575 AP000619.1-201ENST00000540293 1000 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
UBXN4Q92575 LINC02207-201ENST00000554530 1256 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
UBXN4Q92575 HNRNPC-226ENST00000556628 1156 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.5 ms