Protein–RNA interactions for Protein: Q2M329

CCDC96, Coiled-coil domain-containing protein 96, humanhuman

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Length 555 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC96Q2M329 MIR6721-201ENST00000617181 87 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
CCDC96Q2M329 PPP3CB-AS1-213ENST00000620302 501 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
CCDC96Q2M329 LINC01002-237ENST00000634025 555 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
CCDC96Q2M329 AC111152.1-202ENST00000635848 339 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
CCDC96Q2M329 KLHL5-202ENST00000261426 3300 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
CCDC96Q2M329 PUM2-201ENST00000319801 6002 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
CCDC96Q2M329 ADA2-206ENST00000449907 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.21
CCDC96Q2M329 AC009120.2-204ENST00000621548 2032 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
CCDC96Q2M329 GCNT2-203ENST00000379597 4525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
CCDC96Q2M329 OSBPL9-203ENST00000428468 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
CCDC96Q2M329 NFX1-201ENST00000318524 3513 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
CCDC96Q2M329 SPANXN5-201ENST00000375511 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
CCDC96Q2M329 LINGO2-202ENST00000379992 3044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
CCDC96Q2M329 ADTRP-203ENST00000414691 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
CCDC96Q2M329 SCOC-204ENST00000394205 1964 ntTSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
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CCDC96Q2M329 LINC00891-201ENST00000627173 4113 ntTSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
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CCDC96Q2M329 MSANTD2-204ENST00000526629 3086 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
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CCDC96Q2M329 XRCC5-201ENST00000392132 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
CCDC96Q2M329 MAP3K7CL-209ENST00000399947 2003 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
CCDC96Q2M329 USP50-203ENST00000532404 1386 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
CCDC96Q2M329 SPAG9-209ENST00000510283 4949 ntTSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
CCDC96Q2M329 ADPRM-201ENST00000379774 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
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CCDC96Q2M329 AC084816.1-201ENST00000413794 565 ntTSL 4 BASIC7.51□□□□□ -1.21
CCDC96Q2M329 NUTM2A-AS1-203ENST00000413961 501 ntTSL 3 BASIC7.51□□□□□ -1.21
CCDC96Q2M329 MTND2P12-201ENST00000417560 1252 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
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CCDC96Q2M329 GAPDHP59-201ENST00000435908 267 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
CCDC96Q2M329 LINC01291-203ENST00000435984 565 ntTSL 3 BASIC7.51□□□□□ -1.21
CCDC96Q2M329 CYP3A5-203ENST00000439761 1075 ntTSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
CCDC96Q2M329 CXCR2P1-202ENST00000443392 1074 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
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CCDC96Q2M329 SPANXB1-201ENST00000449283 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
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CCDC96Q2M329 IBTK-210ENST00000610980 5195 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
CCDC96Q2M329 CPED1-201ENST00000310396 5340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
CCDC96Q2M329 KIAA1328-202ENST00000586135 1863 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
CCDC96Q2M329 MIR621-201ENST00000384919 96 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
CCDC96Q2M329 MIR188-201ENST00000385034 86 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
CCDC96Q2M329 VN1R12P-201ENST00000403778 876 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
CCDC96Q2M329 AL713922.1-201ENST00000416477 747 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
CCDC96Q2M329 AL139415.1-201ENST00000424862 352 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
CCDC96Q2M329 AC092162.2-201ENST00000438143 532 ntTSL 4 BASIC7.5□□□□□ -1.21
CCDC96Q2M329 SMIM30-204ENST00000441359 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
CCDC96Q2M329 CCDC13-AS1-202ENST00000446950 554 ntTSL 4 BASIC7.5□□□□□ -1.21
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CCDC96Q2M329 GBA3-201ENST00000503442 1232 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
CCDC96Q2M329 LINC01386-201ENST00000506196 440 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
CCDC96Q2M329 ALG9-IT1-201ENST00000531305 684 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
CCDC96Q2M329 AC069234.2-202ENST00000535720 583 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
CCDC96Q2M329 AL357153.3-201ENST00000553982 611 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
CCDC96Q2M329 AC005632.2-201ENST00000564271 828 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
CCDC96Q2M329 AC018761.4-201ENST00000585742 272 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
CCDC96Q2M329 LINC00635-219ENST00000608506 482 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
CCDC96Q2M329 Metazoa_SRP.35-201ENST00000611402 288 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
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