Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 EBF2-204ENST00000535548 1017 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
RTL8BQ17RB0 VEPH1-219ENST00000537559 992 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
RTL8BQ17RB0 AC025419.1-203ENST00000540652 726 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
RTL8BQ17RB0 AC005833.3-202ENST00000544741 770 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
RTL8BQ17RB0 AC009729.1-201ENST00000548873 1133 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
RTL8BQ17RB0 MIR9-3HG-211ENST00000561037 779 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
RTL8BQ17RB0 LINC01476-202ENST00000584262 635 ntTSL 4 BASIC5.13□□□□□ -1.59
RTL8BQ17RB0 ODF4-202ENST00000584943 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
RTL8BQ17RB0 AL021368.3-201ENST00000607119 578 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
RTL8BQ17RB0 AC006924.1-201ENST00000610750 559 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
RTL8BQ17RB0 MALAT1-209ENST00000616691 587 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
RTL8BQ17RB0 VIPR1-AS1-221ENST00000626992 602 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
RTL8BQ17RB0 AC063952.1-203ENST00000634410 658 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
RTL8BQ17RB0 MEF2C-225ENST00000625585 3467 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
RTL8BQ17RB0 ADGRF5-201ENST00000265417 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
RTL8BQ17RB0 ZNF711-202ENST00000360700 4844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
RTL8BQ17RB0 KRR1-201ENST00000229214 10118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
RTL8BQ17RB0 AC110373.1-201ENST00000505994 3505 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
RTL8BQ17RB0 SCML2-202ENST00000398048 1334 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
RTL8BQ17RB0 LINC01205-201ENST00000489670 1331 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
RTL8BQ17RB0 ZNF969P-201ENST00000510345 2341 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
RTL8BQ17RB0 AF121898.1-201ENST00000440763 1860 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
RTL8BQ17RB0 RAD23B-202ENST00000416373 3835 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
RTL8BQ17RB0 ZNF184-202ENST00000377419 2899 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.13□□□□□ -1.59
RTL8BQ17RB0 LINC01951-201ENST00000377300 1925 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
RTL8BQ17RB0 ANK3-216ENST00000503366 5792 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
RTL8BQ17RB0 ANO4-202ENST00000392979 3909 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
RTL8BQ17RB0 CASC15-201ENST00000444265 1497 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
RTL8BQ17RB0 MECOM-209ENST00000472280 3593 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
RTL8BQ17RB0 AC092692.1-201ENST00000623625 2595 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
RTL8BQ17RB0 ALG13-203ENST00000394780 4133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
RTL8BQ17RB0 SEC22A-201ENST00000309934 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
RTL8BQ17RB0 PPP1R9A-206ENST00000433360 5369 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
RTL8BQ17RB0 PEAK1-202ENST00000558305 4644 ntTSL 4 BASIC5.12□□□□□ -1.59
RTL8BQ17RB0 VEZF1-204ENST00000584396 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
RTL8BQ17RB0 USP9YP3-201ENST00000434481 1766 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
RTL8BQ17RB0 RUFY3-202ENST00000381006 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
RTL8BQ17RB0 AC009404.1-201ENST00000420330 3090 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
RTL8BQ17RB0 ANK3-201ENST00000280772 16874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
RTL8BQ17RB0 SOX5-216ENST00000546136 6975 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
RTL8BQ17RB0 FAM83B-201ENST00000306858 3167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
RTL8BQ17RB0 C1orf162-201ENST00000343534 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
RTL8BQ17RB0 SNORD35A-201ENST00000363389 86 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
RTL8BQ17RB0 AL591503.1-201ENST00000366224 477 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
RTL8BQ17RB0 RSPO3-202ENST00000368317 1290 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
RTL8BQ17RB0 SMARCE1P6-201ENST00000398372 1216 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
RTL8BQ17RB0 MIR1266-201ENST00000408125 84 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
RTL8BQ17RB0 SLC3A1-203ENST00000409294 792 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
RTL8BQ17RB0 GPN3P1-201ENST00000423883 535 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
RTL8BQ17RB0 AC073257.1-201ENST00000432474 523 ntTSL 4 BASIC5.12□□□□□ -1.59
RTL8BQ17RB0 AC100823.1-201ENST00000442274 480 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
RTL8BQ17RB0 AL451063.1-201ENST00000450164 1133 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
RTL8BQ17RB0 RN7SL655P-201ENST00000486087 298 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
RTL8BQ17RB0 NREP-217ENST00000509025 987 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
RTL8BQ17RB0 AC093816.1-201ENST00000515076 913 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
RTL8BQ17RB0 NREP-223ENST00000515855 801 ntTSL 4 BASIC5.12□□□□□ -1.59
RTL8BQ17RB0 AC008708.1-201ENST00000517346 474 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
RTL8BQ17RB0 COX6C-210ENST00000524245 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
RTL8BQ17RB0 DEFB134-202ENST00000526438 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
RTL8BQ17RB0 SLC25A51P2-201ENST00000535708 889 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
RTL8BQ17RB0 AC080011.1-201ENST00000552378 989 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
RTL8BQ17RB0 TPRX1P1-201ENST00000557620 319 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
RTL8BQ17RB0 AC133552.4-201ENST00000576103 676 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
RTL8BQ17RB0 AC090774.2-201ENST00000584708 322 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
RTL8BQ17RB0 LINC01855-201ENST00000585520 396 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
RTL8BQ17RB0 LINC01841-201ENST00000586698 573 ntTSL 4 BASIC5.12□□□□□ -1.59
RTL8BQ17RB0 AC011516.1-201ENST00000599129 180 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
RTL8BQ17RB0 AC009237.12-201ENST00000604755 742 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
RTL8BQ17RB0 AL589182.1-201ENST00000611785 320 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
RTL8BQ17RB0 PRL-202ENST00000615510 1268 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
RTL8BQ17RB0 ZNF248-209ENST00000615949 518 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
RTL8BQ17RB0 AC068213.1-201ENST00000625124 226 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
RTL8BQ17RB0 AC005154.1-203ENST00000626245 451 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
RTL8BQ17RB0 RMDN2-201ENST00000234195 1985 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
RTL8BQ17RB0 RALGAPA1P1-201ENST00000443361 6232 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
RTL8BQ17RB0 AOX3P-204ENST00000491025 2107 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
RTL8BQ17RB0 AL353743.3-201ENST00000442109 1468 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
RTL8BQ17RB0 AC008080.4-201ENST00000420185 1589 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
RTL8BQ17RB0 SPAG6-209ENST00000538630 2376 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
RTL8BQ17RB0 SLC35A5-201ENST00000261034 2444 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
RTL8BQ17RB0 LINC02225-201ENST00000510444 4069 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
RTL8BQ17RB0 CHD6-202ENST00000373222 2477 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
RTL8BQ17RB0 LINC00907-201ENST00000585627 3324 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
RTL8BQ17RB0 NADK2-201ENST00000282512 2507 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
RTL8BQ17RB0 NAT1-210ENST00000545197 1827 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
RTL8BQ17RB0 EPB41L2-220ENST00000528282 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
RTL8BQ17RB0 THEMIS-206ENST00000630369 2786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
RTL8BQ17RB0 ZNF33B-208ENST00000613419 5843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
RTL8BQ17RB0 GUCY1B2-204ENST00000531898 1979 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
RTL8BQ17RB0 FASTKD1-204ENST00000453153 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
RTL8BQ17RB0 XRN1-201ENST00000264951 10143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
RTL8BQ17RB0 ARID4A-203ENST00000395168 4051 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
RTL8BQ17RB0 PLCB1-211ENST00000617005 6458 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
RTL8BQ17RB0 ZSCAN26-201ENST00000316606 2362 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
RTL8BQ17RB0 NBPF26-201ENST00000609741 3671 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
RTL8BQ17RB0 ACTR3C-201ENST00000252071 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
RTL8BQ17RB0 OR7A2P-201ENST00000304105 930 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
RTL8BQ17RB0 SPP1-202ENST00000360804 1196 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
RTL8BQ17RB0 TP63-205ENST00000392461 1251 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
RTL8BQ17RB0 RPL12P23-201ENST00000405880 490 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
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