Protein–RNA interactions for Protein: P48230

TM4SF4, Transmembrane 4 L6 family member 4, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM4SF4P48230 SEPT7P6-201ENST00000469999 1143 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
TM4SF4P48230 AC245041.2-201ENST00000479781 376 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
TM4SF4P48230 AC022415.1-202ENST00000486612 523 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
TM4SF4P48230 AC026826.1-201ENST00000493002 361 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
TM4SF4P48230 AC008680.1-201ENST00000523398 283 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
TM4SF4P48230 AC109466.1-202ENST00000523648 748 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
TM4SF4P48230 AP005639.1-201ENST00000526939 192 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
TM4SF4P48230 CTNNA3-205ENST00000545309 555 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
TM4SF4P48230 AL139022.1-201ENST00000556127 486 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
TM4SF4P48230 TM6SF1-207ENST00000565774 1020 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
TM4SF4P48230 AC090403.1-202ENST00000582108 833 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
TM4SF4P48230 ZNF208-204ENST00000599916 740 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
TM4SF4P48230 AL513218.1-201ENST00000606527 391 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
TM4SF4P48230 IGLV10-54-202ENST00000640991 351 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
TM4SF4P48230 PROX1-AS1-202ENST00000433082 5266 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
TM4SF4P48230 EGFEM1P-205ENST00000483846 2327 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
TM4SF4P48230 MYCBP2-212ENST00000612956 1542 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
TM4SF4P48230 MAGT1-201ENST00000358075 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
TM4SF4P48230 IGSF11-201ENST00000354673 3206 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
TM4SF4P48230 USF3-201ENST00000316407 13708 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
TM4SF4P48230 CCDC190-202ENST00000367911 1395 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
TM4SF4P48230 ZNF549-204ENST00000602149 5505 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
TM4SF4P48230 ANKRD46-204ENST00000519597 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
TM4SF4P48230 ANO6-201ENST00000320560 5975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
TM4SF4P48230 DCC-215ENST00000581580 3517 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
TM4SF4P48230 SPATA31C2-201ENST00000324915 3777 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
TM4SF4P48230 SPATA31A1-201ENST00000377647 4256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
TM4SF4P48230 DNM1L-201ENST00000266481 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
TM4SF4P48230 MAPK10-261ENST00000641050 3109 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
TM4SF4P48230 CYP8B1-201ENST00000316161 3974 ntAPPRIS P1 BASIC7.29□□□□□ -1.24
TM4SF4P48230 C6orf89-204ENST00000480824 6861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
TM4SF4P48230 OR4C1P-202ENST00000641065 1569 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
TM4SF4P48230 MAGEB16-204ENST00000399989 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
TM4SF4P48230 ZNF836-201ENST00000322146 2811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
TM4SF4P48230 AC009404.1-201ENST00000420330 3090 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
TM4SF4P48230 EXD1-201ENST00000314992 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
TM4SF4P48230 GFPT1-201ENST00000357308 8703 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
TM4SF4P48230 ZNF484-203ENST00000395505 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
TM4SF4P48230 SYTL4-203ENST00000372981 4847 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
TM4SF4P48230 SZT2-210ENST00000634258 11045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
TM4SF4P48230 AC087501.5-201ENST00000607496 2374 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
TM4SF4P48230 MRPS36-201ENST00000256441 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
TM4SF4P48230 THAP9-201ENST00000302236 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
TM4SF4P48230 OR8U1-201ENST00000302270 930 ntAPPRIS P1 BASIC7.29□□□□□ -1.24
TM4SF4P48230 AL589994.1-201ENST00000404962 340 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
TM4SF4P48230 ZSCAN12P1-201ENST00000406489 419 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
TM4SF4P48230 RN7SKP161-201ENST00000411110 305 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
TM4SF4P48230 RPL12P43-201ENST00000420608 499 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
TM4SF4P48230 AC093155.2-201ENST00000420734 937 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
TM4SF4P48230 AC007064.3-201ENST00000422608 359 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
TM4SF4P48230 MIS18A-AS1-201ENST00000453549 769 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
TM4SF4P48230 HESX1-202ENST00000473921 757 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
TM4SF4P48230 AC093827.1-201ENST00000480094 861 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
TM4SF4P48230 LINC00632-202ENST00000498732 746 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
TM4SF4P48230 OLR1-210ENST00000544577 924 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
TM4SF4P48230 AC010547.6-201ENST00000571789 193 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
TM4SF4P48230 CT45A1-201ENST00000594117 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
TM4SF4P48230 AL157899.1-201ENST00000604110 936 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
TM4SF4P48230 KATNBL1P1-201ENST00000605192 748 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
TM4SF4P48230 AC025171.4-201ENST00000607250 1047 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
TM4SF4P48230 AC018690.1-201ENST00000608144 626 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
TM4SF4P48230 ST6GALNAC3-203ENST00000621530 617 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
TM4SF4P48230 AC120057.5-201ENST00000623840 154 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
TM4SF4P48230 OXSM-209ENST00000626005 309 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
TM4SF4P48230 ASAH1-224ENST00000636269 685 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
TM4SF4P48230 RBMY1F-201ENST00000303766 1887 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
TM4SF4P48230 ZNF445-202ENST00000425708 10052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
TM4SF4P48230 AC026316.3-201ENST00000497988 3097 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
TM4SF4P48230 PLEKHA5-201ENST00000299275 4238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
TM4SF4P48230 TMPRSS11F-201ENST00000356291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
TM4SF4P48230 SPARCL1-205ENST00000503414 2520 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
TM4SF4P48230 ZEB1-201ENST00000320985 5423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
TM4SF4P48230 AFF2-203ENST00000370457 3952 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
TM4SF4P48230 RIOK2-202ENST00000508447 2149 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
TM4SF4P48230 KIAA0040-202ENST00000444639 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
TM4SF4P48230 CLEC7A-205ENST00000353231 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
TM4SF4P48230 AC034111.1-201ENST00000562143 3770 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
TM4SF4P48230 CNTN4-AS1-201ENST00000442749 1640 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
TM4SF4P48230 DTNA-228ENST00000597674 1732 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
TM4SF4P48230 ADGRF5-202ENST00000283296 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
TM4SF4P48230 OR4M1-201ENST00000315957 1116 ntAPPRIS P1 BASIC7.28□□□□□ -1.24
TM4SF4P48230 RNU1-19P-201ENST00000363306 165 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
TM4SF4P48230 MIR7-1-201ENST00000384871 110 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
TM4SF4P48230 AC005323.2-201ENST00000399342 583 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
TM4SF4P48230 PRELID1P2-201ENST00000407805 396 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
TM4SF4P48230 LSM5-203ENST00000409782 649 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
TM4SF4P48230 VWC2L-IT1-201ENST00000416430 467 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
TM4SF4P48230 Z98742.1-201ENST00000419801 632 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
TM4SF4P48230 LINC00310-202ENST00000419881 910 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
TM4SF4P48230 AC010967.1-201ENST00000421575 489 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
TM4SF4P48230 PSMC1P2-201ENST00000423961 1204 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
TM4SF4P48230 Z68868.1-201ENST00000429048 544 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
TM4SF4P48230 AL392003.1-201ENST00000434394 243 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
TM4SF4P48230 OR3D1P-201ENST00000438288 955 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
TM4SF4P48230 LINC01449-201ENST00000440213 1220 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
TM4SF4P48230 SEPT14P12-201ENST00000442280 560 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
TM4SF4P48230 CCDC17-203ENST00000445048 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
TM4SF4P48230 AC025181.1-201ENST00000477507 416 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
TM4SF4P48230 AC092865.4-201ENST00000477936 615 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
TM4SF4P48230 ATG10-AS1-201ENST00000504846 648 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.7 ms