Protein–RNA interactions for Protein: P35452

HOXD12, Homeobox protein Hox-D12, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12P35452 MFSD8-201ENST00000296468 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
HOXD12P35452 PIGN-207ENST00000586566 3891 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
HOXD12P35452 SRFBP1-201ENST00000339397 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
HOXD12P35452 CLCN3-202ENST00000360642 3208 ntTSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.34
HOXD12P35452 POT1-AS1-204ENST00000449642 3238 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
HOXD12P35452 ZNF542P-202ENST00000467807 3209 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
HOXD12P35452 ZNF714-202ENST00000456283 6812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
HOXD12P35452 ZCCHC8-201ENST00000536306 2904 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
HOXD12P35452 OR56B1-201ENST00000317121 2075 ntAPPRIS P1 BASIC6.7□□□□□ -1.34
HOXD12P35452 DNM1L-201ENST00000266481 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
HOXD12P35452 AC140479.2-201ENST00000421567 3130 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
HOXD12P35452 LRP2-201ENST00000263816 15808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
HOXD12P35452 ANKS4B-201ENST00000311620 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
HOXD12P35452 KAT6A-202ENST00000396930 9285 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
HOXD12P35452 CATSPER2-202ENST00000381761 1758 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
HOXD12P35452 SLC3A1-206ENST00000409740 1418 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
HOXD12P35452 NOVA1-213ENST00000574031 1431 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
HOXD12P35452 AC092111.2-201ENST00000611627 1414 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
HOXD12P35452 ESRRG-201ENST00000359162 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
HOXD12P35452 MEPE-201ENST00000361056 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
HOXD12P35452 LINC00698-203ENST00000468072 1957 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
HOXD12P35452 GUCY1B2-203ENST00000493639 2871 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
HOXD12P35452 ZNF449-201ENST00000339249 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
HOXD12P35452 ALMS1-207ENST00000614410 11700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
HOXD12P35452 ATF7IP2-203ENST00000396559 3641 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
HOXD12P35452 AQP4-AS1-202ENST00000578701 2177 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
HOXD12P35452 PLA2R1-201ENST00000283243 14371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
HOXD12P35452 UQCR10-201ENST00000330029 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
HOXD12P35452 FIG4-202ENST00000368941 791 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
HOXD12P35452 TINAG-203ENST00000370869 782 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
HOXD12P35452 NOX1-203ENST00000372964 661 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
HOXD12P35452 OR7E156P-201ENST00000400303 464 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
HOXD12P35452 RPL12P23-201ENST00000405880 490 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
HOXD12P35452 FAM183A-205ENST00000410048 500 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
HOXD12P35452 AL356968.2-201ENST00000412769 1257 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
HOXD12P35452 AL035604.1-201ENST00000416481 531 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
HOXD12P35452 EIF2S2P3-201ENST00000428356 999 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
HOXD12P35452 PAICSP2-201ENST00000429118 1150 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
HOXD12P35452 AC099063.1-201ENST00000437128 324 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
HOXD12P35452 AL035706.1-201ENST00000439186 683 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
HOXD12P35452 HMGN1P2-201ENST00000445197 310 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
HOXD12P35452 AL513343.1-201ENST00000451818 792 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
HOXD12P35452 MEF2AP1-201ENST00000454867 863 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
HOXD12P35452 L29074.1-201ENST00000456072 534 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
HOXD12P35452 MTCYBP14-201ENST00000457471 715 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
HOXD12P35452 RPL24-206ENST00000495401 478 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
HOXD12P35452 ATXN3-206ENST00000502250 1259 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
HOXD12P35452 UBE2D3-217ENST00000504211 578 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
HOXD12P35452 AC092903.2-201ENST00000510244 427 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
HOXD12P35452 AC091987.1-201ENST00000517758 464 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
HOXD12P35452 CRYAB-207ENST00000527950 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
HOXD12P35452 OR4A1P-201ENST00000532342 920 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
HOXD12P35452 AC140063.1-201ENST00000541343 259 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
HOXD12P35452 TNFSF11-205ENST00000544862 818 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
HOXD12P35452 AL355838.1-201ENST00000554814 559 ntTSL 4 BASIC6.7□□□□□ -1.34
HOXD12P35452 AC016526.1-201ENST00000555465 520 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
HOXD12P35452 AL133371.1-201ENST00000555481 764 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
HOXD12P35452 LINC02319-201ENST00000555852 349 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
HOXD12P35452 AC023827.2-201ENST00000566880 1061 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
HOXD12P35452 SYPL1P2-201ENST00000582878 727 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
HOXD12P35452 LINC01435-212ENST00000601212 742 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
HOXD12P35452 QTRT1P1-201ENST00000604344 1078 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
HOXD12P35452 AC138473.1-201ENST00000605717 526 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
HOXD12P35452 AC015982.1-201ENST00000608113 465 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
HOXD12P35452 AC015574.1-205ENST00000611285 524 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
HOXD12P35452 RNASE11-211ENST00000620912 883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
HOXD12P35452 OR8D2-201ENST00000624618 1051 ntAPPRIS P1 BASIC6.7□□□□□ -1.34
HOXD12P35452 LINC01435-220ENST00000630847 714 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
HOXD12P35452 AD000090.1-201ENST00000638356 494 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
HOXD12P35452 CEP152-201ENST00000325747 4986 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
HOXD12P35452 LRRC37B-220ENST00000584368 2773 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
HOXD12P35452 MID1-202ENST00000380779 6044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
HOXD12P35452 AC112255.1-201ENST00000624070 2493 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
HOXD12P35452 ALKBH8-205ENST00000428149 4079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
HOXD12P35452 SRGAP1-206ENST00000543397 5652 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
HOXD12P35452 OR10G4-202ENST00000641521 3623 ntAPPRIS P1 BASIC6.69□□□□□ -1.34
HOXD12P35452 MLH1-206ENST00000435176 2428 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
HOXD12P35452 ABCB5-205ENST00000443026 2247 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
HOXD12P35452 CASP5-201ENST00000260315 1414 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
HOXD12P35452 ARHGEF38-201ENST00000265154 1437 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
HOXD12P35452 TSHZ2-202ENST00000371497 12187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
HOXD12P35452 FLRT3-202ENST00000378053 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
HOXD12P35452 LINC01505-203ENST00000435485 1686 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
HOXD12P35452 MMP13-201ENST00000260302 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
HOXD12P35452 IFNK-201ENST00000276943 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
HOXD12P35452 OR7A2P-201ENST00000304105 930 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
HOXD12P35452 RN7SKP47-201ENST00000365347 328 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
HOXD12P35452 CCDC148-AS1-201ENST00000412781 795 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
HOXD12P35452 RPL23AP18-201ENST00000416139 468 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
HOXD12P35452 AC096644.3-201ENST00000416788 338 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
HOXD12P35452 VNN3-205ENST00000417437 1117 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
HOXD12P35452 AL050344.1-201ENST00000424084 490 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
HOXD12P35452 OSTN-AS1-201ENST00000430375 515 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
HOXD12P35452 AKR1D1-203ENST00000432161 1236 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
HOXD12P35452 AC008063.2-201ENST00000432251 619 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
HOXD12P35452 AC007679.3-201ENST00000434035 414 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
HOXD12P35452 AC068888.2-201ENST00000435621 536 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
HOXD12P35452 NFIA-AS2-203ENST00000438559 1275 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
HOXD12P35452 AC114812.2-201ENST00000439336 663 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
HOXD12P35452 PFN1P11-201ENST00000445829 389 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.7 ms