Protein–RNA interactions for Protein: P10586

PTPRF, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase F, humanhuman

Predictions only

Length 1,907 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRFP10586 SLC2A14-203ENST00000431042 3458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
PTPRFP10586 TMEM192-201ENST00000306480 10012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
PTPRFP10586 UTP4-204ENST00000563094 4183 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
PTPRFP10586 AL627309.5-201ENST00000484859 4860 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
PTPRFP10586 CACNA2D3-210ENST00000490478 3557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
PTPRFP10586 RN7SKP77-201ENST00000363261 353 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
PTPRFP10586 CAV1-204ENST00000393470 598 ntTSL 4 BASIC7.06□□□□□ -1.28
PTPRFP10586 SDHDP6-201ENST00000414693 480 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
PTPRFP10586 AC114803.1-201ENST00000417355 311 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
PTPRFP10586 LINC01880-201ENST00000446593 561 ntTSL 4 BASIC7.06□□□□□ -1.28
PTPRFP10586 AL157777.1-201ENST00000468100 304 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
PTPRFP10586 AC006499.3-201ENST00000506077 748 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
PTPRFP10586 PDE4D-225ENST00000515835 590 ntTSL 4 BASIC7.06□□□□□ -1.28
PTPRFP10586 LINC01033-204ENST00000523194 715 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
PTPRFP10586 PCED1B-AS1-203ENST00000547626 420 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
PTPRFP10586 AC103996.3-201ENST00000553477 442 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
PTPRFP10586 AC012588.1-201ENST00000583852 358 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
PTPRFP10586 AC022031.2-203ENST00000587346 565 ntTSL 4 BASIC7.06□□□□□ -1.28
PTPRFP10586 AL136131.3-201ENST00000607600 188 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
PTPRFP10586 AC022919.1-201ENST00000624979 626 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
PTPRFP10586 CRB1-211ENST00000638467 4348 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
PTPRFP10586 RAPH1-204ENST00000418114 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
PTPRFP10586 RAPH1-205ENST00000419464 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
PTPRFP10586 PLEKHA5-201ENST00000299275 4238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
PTPRFP10586 CTNNA1P1-201ENST00000515849 2728 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
PTPRFP10586 ZNF630-202ENST00000409324 2455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
PTPRFP10586 LINC02092-201ENST00000455366 2472 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
PTPRFP10586 CALCOCO2-204ENST00000448105 1916 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
PTPRFP10586 MYBL1-206ENST00000524176 2148 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
PTPRFP10586 PDZK1P1-202ENST00000425209 1350 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
PTPRFP10586 LUC7L2-201ENST00000263545 2287 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
PTPRFP10586 RRP8-201ENST00000254605 6560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
PTPRFP10586 ARCN1-202ENST00000359415 4038 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
PTPRFP10586 SORBS1-210ENST00000371246 6931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
PTPRFP10586 NCOR1-204ENST00000395851 7950 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
PTPRFP10586 IL5RA-204ENST00000418488 5521 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
PTPRFP10586 FCHSD2-203ENST00000409314 4509 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
PTPRFP10586 LRRFIP2-201ENST00000336686 3208 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
PTPRFP10586 RPL37A-210ENST00000491306 3647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
PTPRFP10586 CACNA1C-220ENST00000399655 13433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
PTPRFP10586 REP15-201ENST00000310791 1078 ntAPPRIS P1 BASIC7.05□□□□□ -1.28
PTPRFP10586 AC005323.2-201ENST00000399342 583 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
PTPRFP10586 RPL36P18-201ENST00000419316 318 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
PTPRFP10586 AC078960.1-201ENST00000422160 177 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
PTPRFP10586 AC023481.1-201ENST00000435368 938 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
PTPRFP10586 AC017074.2-201ENST00000439382 607 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
PTPRFP10586 AC011225.1-201ENST00000457751 369 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
PTPRFP10586 LINC02485-202ENST00000511899 770 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
PTPRFP10586 AC130371.1-201ENST00000577023 230 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
PTPRFP10586 AC020916.2-201ENST00000591242 360 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
PTPRFP10586 AC008280.3-201ENST00000606436 732 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
PTPRFP10586 NADK2-211ENST00000617628 744 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
PTPRFP10586 PIGX-210ENST00000639143 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
PTPRFP10586 NOX4-211ENST00000528341 1899 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
PTPRFP10586 PDE1A-204ENST00000410103 2000 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
PTPRFP10586 VPS8-207ENST00000436792 5011 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
PTPRFP10586 AC024587.1-201ENST00000505925 2157 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
PTPRFP10586 EEF1A1P24-201ENST00000451469 1378 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
PTPRFP10586 RSAD2-201ENST00000382040 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
PTPRFP10586 MUSK-206ENST00000416899 3344 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
PTPRFP10586 NRCAM-204ENST00000379028 6685 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
PTPRFP10586 GAN-202ENST00000568107 15244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
PTPRFP10586 ARMCX5-202ENST00000372742 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
PTPRFP10586 ADAM29-202ENST00000404450 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
PTPRFP10586 SLC4A8-203ENST00000453097 11824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
PTPRFP10586 PIGN-238ENST00000639758 4239 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
PTPRFP10586 AC013488.1-201ENST00000526618 1838 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
PTPRFP10586 ZRSR2-202ENST00000380308 744 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
PTPRFP10586 MIR433-201ENST00000384837 93 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
PTPRFP10586 LINC00383-201ENST00000433664 817 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
PTPRFP10586 PTMAP6-201ENST00000439110 327 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
PTPRFP10586 AC016395.1-201ENST00000444086 465 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
PTPRFP10586 RPL23AP60-201ENST00000450011 454 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
PTPRFP10586 AC093166.4-201ENST00000457867 318 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
PTPRFP10586 TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 488 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
PTPRFP10586 RPS4XP14-201ENST00000493072 781 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
PTPRFP10586 AC110056.1-201ENST00000525759 911 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
PTPRFP10586 AC006530.1-201ENST00000555980 571 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
PTPRFP10586 AC022916.4-201ENST00000585646 475 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
PTPRFP10586 ZNF37A-202ENST00000361085 8738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
PTPRFP10586 C9-201ENST00000263408 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
PTPRFP10586 AL358394.2-201ENST00000427229 3637 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
PTPRFP10586 CPED1-206ENST00000450913 2501 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
PTPRFP10586 AL161901.1-201ENST00000624954 3425 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
PTPRFP10586 AHI1-204ENST00000367800 5921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
PTPRFP10586 NBPF14-209ENST00000620240 2656 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
PTPRFP10586 WDR17-201ENST00000280190 4705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
PTPRFP10586 RAI14-228ENST00000515799 3486 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
PTPRFP10586 ZNF521-203ENST00000538137 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
PTPRFP10586 ANGPTL5-201ENST00000334289 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
PTPRFP10586 ZNF347-202ENST00000452676 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
PTPRFP10586 ADGRB3-203ENST00000546190 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
PTPRFP10586 OR4K17-203ENST00000641633 5068 ntAPPRIS P1 BASIC7.04□□□□□ -1.28
PTPRFP10586 ZNF268-201ENST00000228289 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
PTPRFP10586 RALYL-211ENST00000523850 1684 ntTSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
PTPRFP10586 SPRYD4-201ENST00000338146 10779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
PTPRFP10586 ADAM5-208ENST00000505455 1998 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
PTPRFP10586 SATB1-209ENST00000454909 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
PTPRFP10586 TSHR-201ENST00000298171 4400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
PTPRFP10586 CBLB-205ENST00000407712 1493 ntTSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 112.5 ms