Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH9

ERVV-2, Endogenous retrovirus group V member 2 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-2B6SEH9 LNPK-212ENST00000544803 7647 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
ERVV-2B6SEH9 STK4-207ENST00000499879 6161 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
ERVV-2B6SEH9 OR56B1-201ENST00000317121 2075 ntAPPRIS P1 BASIC8□□□□□ -1.13
ERVV-2B6SEH9 OR11H13P-201ENST00000359695 979 ntBASIC8□□□□□ -1.13
ERVV-2B6SEH9 SNORA43.1-201ENST00000364863 140 ntBASIC8□□□□□ -1.13
ERVV-2B6SEH9 SSR1P1-201ENST00000407630 814 ntBASIC8□□□□□ -1.13
ERVV-2B6SEH9 AL354890.1-201ENST00000413730 346 ntBASIC8□□□□□ -1.13
ERVV-2B6SEH9 RPL35AP3-201ENST00000414680 288 ntBASIC8□□□□□ -1.13
ERVV-2B6SEH9 RPS7P8-201ENST00000418311 581 ntBASIC8□□□□□ -1.13
ERVV-2B6SEH9 AL512637.1-201ENST00000439523 1231 ntBASIC8□□□□□ -1.13
ERVV-2B6SEH9 AC016908.1-201ENST00000442571 1219 ntBASIC8□□□□□ -1.13
ERVV-2B6SEH9 ZNF619P1-201ENST00000446539 752 ntBASIC8□□□□□ -1.13
ERVV-2B6SEH9 CASP12-206ENST00000446862 1196 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
ERVV-2B6SEH9 GAS5-218ENST00000448718 565 ntTSL 2 BASIC8□□□□□ -1.13
ERVV-2B6SEH9 AL359265.3-201ENST00000456125 579 ntTSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
ERVV-2B6SEH9 RN7SL717P-201ENST00000478343 297 ntBASIC8□□□□□ -1.13
ERVV-2B6SEH9 SETP21-201ENST00000514799 892 ntBASIC8□□□□□ -1.13
ERVV-2B6SEH9 AC091979.1-201ENST00000517595 706 ntTSL 2 BASIC8□□□□□ -1.13
ERVV-2B6SEH9 TMEM97P2-201ENST00000517841 403 ntBASIC8□□□□□ -1.13
ERVV-2B6SEH9 AC040970.1-202ENST00000517908 505 ntTSL 3 BASIC8□□□□□ -1.13
ERVV-2B6SEH9 COX6C-209ENST00000523016 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
ERVV-2B6SEH9 AP003037.1-201ENST00000537594 267 ntTSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
ERVV-2B6SEH9 ANKRD49-206ENST00000540349 573 ntTSL 4 BASIC8□□□□□ -1.13
ERVV-2B6SEH9 AC090022.1-201ENST00000546569 311 ntBASIC8□□□□□ -1.13
ERVV-2B6SEH9 AP001007.3-201ENST00000560744 356 ntTSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
ERVV-2B6SEH9 COX6CP7-201ENST00000597056 208 ntBASIC8□□□□□ -1.13
ERVV-2B6SEH9 RNA5SP440-201ENST00000612665 119 ntBASIC8□□□□□ -1.13
ERVV-2B6SEH9 AP005431.1-201ENST00000618479 319 ntBASIC8□□□□□ -1.13
ERVV-2B6SEH9 CDC7-201ENST00000234626 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
ERVV-2B6SEH9 GOLT1B-201ENST00000229314 3227 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
ERVV-2B6SEH9 TRRAP-207ENST00000628380 12644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
ERVV-2B6SEH9 AL136531.3-201ENST00000624378 3658 ntBASIC8□□□□□ -1.13
ERVV-2B6SEH9 EIF4A2-205ENST00000440191 1889 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
ERVV-2B6SEH9 PDE1A-204ENST00000410103 2000 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
ERVV-2B6SEH9 NOX4-214ENST00000532825 2039 ntTSL 2 BASIC8□□□□□ -1.13
ERVV-2B6SEH9 C9-201ENST00000263408 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
ERVV-2B6SEH9 GABRB2-209ENST00000612710 2470 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
ERVV-2B6SEH9 ZNF329-203ENST00000597186 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
ERVV-2B6SEH9 RPS29-202ENST00000396020 7062 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
ERVV-2B6SEH9 LINC02086-202ENST00000492522 2091 ntTSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
ERVV-2B6SEH9 RSAD2-201ENST00000382040 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
ERVV-2B6SEH9 FGA-201ENST00000302053 3678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.99□□□□□ -1.13
ERVV-2B6SEH9 AC009166.2-201ENST00000624410 2833 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
ERVV-2B6SEH9 AL512624.2-201ENST00000621705 2566 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
ERVV-2B6SEH9 MATR3-215ENST00000510056 3040 ntTSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
ERVV-2B6SEH9 MCFD2-202ENST00000409105 4210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
ERVV-2B6SEH9 MMS22L-201ENST00000275053 8643 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.99□□□□□ -1.13
ERVV-2B6SEH9 PTK2-201ENST00000340930 4414 ntTSL 2 BASIC7.99□□□□□ -1.13
ERVV-2B6SEH9 RNA5SP242-201ENST00000364171 118 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
ERVV-2B6SEH9 FAM66C-201ENST00000372173 678 ntTSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
ERVV-2B6SEH9 MID1-205ENST00000380785 6092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.99□□□□□ -1.13
ERVV-2B6SEH9 CEACAM7-202ENST00000401731 1236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.99□□□□□ -1.13
ERVV-2B6SEH9 AL096829.1-201ENST00000413677 457 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
ERVV-2B6SEH9 AC007389.1-203ENST00000414811 556 ntTSL 4 BASIC7.99□□□□□ -1.13
ERVV-2B6SEH9 AL355355.1-201ENST00000442900 793 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
ERVV-2B6SEH9 AL445466.1-201ENST00000448432 357 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
ERVV-2B6SEH9 GEMIN2P1-201ENST00000454246 752 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
ERVV-2B6SEH9 AL122020.1-201ENST00000472287 459 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
ERVV-2B6SEH9 RN7SL177P-201ENST00000476596 299 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
ERVV-2B6SEH9 IGHVIII-67-4-201ENST00000524281 296 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
ERVV-2B6SEH9 ZNF322P1-201ENST00000568013 1209 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
ERVV-2B6SEH9 AC011443.1-201ENST00000599484 365 ntTSL 3 BASIC7.99□□□□□ -1.13
ERVV-2B6SEH9 AL117336.3-201ENST00000603160 1107 ntTSL 3 BASIC7.99□□□□□ -1.13
ERVV-2B6SEH9 AC244517.3-201ENST00000616254 1235 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
ERVV-2B6SEH9 AC096861.1-201ENST00000616652 240 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
ERVV-2B6SEH9 ZNF292-202ENST00000369577 10610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
ERVV-2B6SEH9 STK32A-202ENST00000397936 5393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
ERVV-2B6SEH9 ZFY-202ENST00000383052 5113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
ERVV-2B6SEH9 NACA-203ENST00000454682 6629 ntTSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
ERVV-2B6SEH9 ZNF107-201ENST00000344930 5174 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
ERVV-2B6SEH9 LINC01741-201ENST00000427173 1666 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
ERVV-2B6SEH9 RBM48-202ENST00000481551 4093 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
ERVV-2B6SEH9 GDA-209ENST00000545168 5362 ntTSL 2 BASIC7.98□□□□□ -1.13
ERVV-2B6SEH9 AC010401.2-201ENST00000575137 4934 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
ERVV-2B6SEH9 MNS1-201ENST00000260453 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
ERVV-2B6SEH9 AC068490.1-202ENST00000637384 3185 ntTSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
ERVV-2B6SEH9 AC025263.1-201ENST00000501387 2538 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
ERVV-2B6SEH9 PHYHIPL-201ENST00000373878 3569 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
ERVV-2B6SEH9 SCYL3-201ENST00000367770 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
ERVV-2B6SEH9 AL359551.1-201ENST00000442726 2900 ntTSL 2 BASIC7.98□□□□□ -1.13
ERVV-2B6SEH9 AC010894.3-202ENST00000412835 1405 ntTSL 2 BASIC7.98□□□□□ -1.13
ERVV-2B6SEH9 RBPJP7-201ENST00000442803 1447 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
ERVV-2B6SEH9 RBPJP5-201ENST00000449433 1447 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
ERVV-2B6SEH9 TMC7-202ENST00000421369 4499 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
ERVV-2B6SEH9 DSCAM-203ENST00000617870 6176 ntTSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
ERVV-2B6SEH9 OR2B6-201ENST00000244623 942 ntAPPRIS P1 BASIC7.98□□□□□ -1.13
ERVV-2B6SEH9 KRTAP23-1-201ENST00000334160 211 ntAPPRIS P1 BASIC7.98□□□□□ -1.13
ERVV-2B6SEH9 LINC02094-201ENST00000437646 520 ntTSL 2 BASIC7.98□□□□□ -1.13
ERVV-2B6SEH9 LINC00534-203ENST00000523406 812 ntTSL 3 BASIC7.98□□□□□ -1.13
ERVV-2B6SEH9 AC092865.1-201ENST00000544395 1023 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
ERVV-2B6SEH9 LINC01146-207ENST00000557339 397 ntTSL 3 BASIC7.98□□□□□ -1.13
ERVV-2B6SEH9 ADAMTS7P4-205ENST00000560651 453 ntTSL 3 BASIC7.98□□□□□ -1.13
ERVV-2B6SEH9 AC233702.7-202ENST00000582941 211 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
ERVV-2B6SEH9 AL512624.1-201ENST00000613638 469 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
ERVV-2B6SEH9 AC022467.1-201ENST00000614738 749 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
ERVV-2B6SEH9 OR7A1P-202ENST00000641542 1158 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
ERVV-2B6SEH9 NSUN4-208ENST00000498008 3867 ntTSL 2 BASIC7.98□□□□□ -1.13
ERVV-2B6SEH9 MME-203ENST00000460393 5622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
ERVV-2B6SEH9 EYA3-204ENST00000436342 5943 ntTSL 2 BASIC7.98□□□□□ -1.13
ERVV-2B6SEH9 PLCB4-202ENST00000378473 5619 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.2 ms