Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9B4

ANKRD42, Ankyrin repeat domain-containing protein 42, humanhuman

Predictions only

Length 389 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD42Q8N9B4 AC073569.1-201ENST00000548469 667 ntTSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
ANKRD42Q8N9B4 AL049869.4-201ENST00000555669 178 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
ANKRD42Q8N9B4 FAM30C-201ENST00000561158 410 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
ANKRD42Q8N9B4 RN7SL270P-201ENST00000579643 281 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
ANKRD42Q8N9B4 Metazoa_SRP.202-201ENST00000585071 281 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
ANKRD42Q8N9B4 AC004241.3-201ENST00000611728 517 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
ANKRD42Q8N9B4 AC021422.1-201ENST00000621212 473 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
ANKRD42Q8N9B4 AC079298.2-201ENST00000623885 459 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
ANKRD42Q8N9B4 AC024475.3-203ENST00000634971 854 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
ANKRD42Q8N9B4 LINC01141-204ENST00000635564 1008 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
ANKRD42Q8N9B4 AL160396.1-201ENST00000637433 575 ntTSL 4 BASIC6.58□□□□□ -1.36
ANKRD42Q8N9B4 MSL2-202ENST00000434835 2272 ntTSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
ANKRD42Q8N9B4 PUM1-206ENST00000426105 4043 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
ANKRD42Q8N9B4 RUBCNL-205ENST00000389908 3956 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
ANKRD42Q8N9B4 RMDN2-201ENST00000234195 1985 ntTSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
ANKRD42Q8N9B4 ANKRD12-203ENST00000400020 9115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
ANKRD42Q8N9B4 LINC01520-201ENST00000441457 1487 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
ANKRD42Q8N9B4 HSP90AA2P-201ENST00000530115 2196 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
ANKRD42Q8N9B4 BMPR1B-202ENST00000394931 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
ANKRD42Q8N9B4 RPE65-201ENST00000262340 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
ANKRD42Q8N9B4 RNASEL-202ENST00000539397 4046 ntTSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
ANKRD42Q8N9B4 LINC02227-201ENST00000619068 3748 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
ANKRD42Q8N9B4 MCMDC2-204ENST00000422365 5096 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
ANKRD42Q8N9B4 LIMA1-202ENST00000394943 3669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
ANKRD42Q8N9B4 ALG13-203ENST00000394780 4133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
ANKRD42Q8N9B4 GABRA2-206ENST00000507460 5812 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
ANKRD42Q8N9B4 STMN2-201ENST00000220876 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
ANKRD42Q8N9B4 AC004852.2-201ENST00000614289 2218 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
ANKRD42Q8N9B4 PTPRD-214ENST00000540109 6210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
ANKRD42Q8N9B4 HELZ-207ENST00000580168 6279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
ANKRD42Q8N9B4 ERVH48-1-201ENST00000447535 2790 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
ANKRD42Q8N9B4 NCOA7-201ENST00000229634 2998 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
ANKRD42Q8N9B4 OR5P2-201ENST00000329434 1069 ntAPPRIS P1 BASIC6.57□□□□□ -1.36
ANKRD42Q8N9B4 BCL2A1-202ENST00000335661 809 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
ANKRD42Q8N9B4 RFPL3S-201ENST00000382084 1117 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
ANKRD42Q8N9B4 AL034403.1-201ENST00000399414 885 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
ANKRD42Q8N9B4 TYMSP1-201ENST00000407851 869 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
ANKRD42Q8N9B4 RN7SKP296-201ENST00000411185 341 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
ANKRD42Q8N9B4 LINC01704-201ENST00000414848 834 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
ANKRD42Q8N9B4 AC245140.1-201ENST00000433825 341 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
ANKRD42Q8N9B4 ST13P2-201ENST00000438916 1109 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
ANKRD42Q8N9B4 AC245517.2-201ENST00000442890 346 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
ANKRD42Q8N9B4 AL050338.1-201ENST00000445585 786 ntTSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
ANKRD42Q8N9B4 RN7SL308P-201ENST00000464971 297 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
ANKRD42Q8N9B4 AC107015.1-201ENST00000466902 747 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
ANKRD42Q8N9B4 RPL23AP64-201ENST00000469465 435 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
ANKRD42Q8N9B4 RN7SL282P-201ENST00000479676 297 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
ANKRD42Q8N9B4 AC108941.2-201ENST00000506796 716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
ANKRD42Q8N9B4 RPS20-202ENST00000518875 671 ntTSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
ANKRD42Q8N9B4 TBCA-209ENST00000522370 435 ntTSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
ANKRD42Q8N9B4 MYBL1-206ENST00000524176 2148 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
ANKRD42Q8N9B4 AC090692.1-202ENST00000525363 607 ntTSL 4 BASIC6.57□□□□□ -1.36
ANKRD42Q8N9B4 AC013549.3-201ENST00000528792 419 ntTSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
ANKRD42Q8N9B4 AP001972.1-201ENST00000529215 506 ntTSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
ANKRD42Q8N9B4 AC100768.2-201ENST00000534068 683 ntTSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
ANKRD42Q8N9B4 AC004803.1-202ENST00000545629 569 ntTSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
ANKRD42Q8N9B4 ANKRD20A5P-203ENST00000580200 566 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
ANKRD42Q8N9B4 RN7SL25P-201ENST00000583862 260 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
ANKRD42Q8N9B4 ZNF569-205ENST00000589833 762 ntTSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
ANKRD42Q8N9B4 SNX6P1-201ENST00000601728 1224 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
ANKRD42Q8N9B4 AC040174.2-201ENST00000602701 465 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
ANKRD42Q8N9B4 CARSP1-201ENST00000603171 889 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
ANKRD42Q8N9B4 AP000904.1-201ENST00000609911 951 ntTSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
ANKRD42Q8N9B4 TSPAN6-205ENST00000614008 900 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
ANKRD42Q8N9B4 AC024255.1-201ENST00000614376 102 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
ANKRD42Q8N9B4 AC243830.3-201ENST00000616810 376 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
ANKRD42Q8N9B4 MALAT1-217ENST00000620902 352 ntTSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
ANKRD42Q8N9B4 AL355860.1-201ENST00000636087 1229 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
ANKRD42Q8N9B4 CLEC6A-201ENST00000382073 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
ANKRD42Q8N9B4 TRIM49D1-203ENST00000605881 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
ANKRD42Q8N9B4 AC105235.1-201ENST00000623208 1816 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
ANKRD42Q8N9B4 RRN3P1-201ENST00000514813 3645 ntTSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
ANKRD42Q8N9B4 PSD3-202ENST00000327040 11689 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
ANKRD42Q8N9B4 SGIP1-201ENST00000237247 3997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
ANKRD42Q8N9B4 SLC24A5-204ENST00000482911 2984 ntTSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
ANKRD42Q8N9B4 ZNF724-201ENST00000418100 2764 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
ANKRD42Q8N9B4 AC092958.1-201ENST00000467198 2569 ntTSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
ANKRD42Q8N9B4 OR5B2-202ENST00000641342 2184 ntAPPRIS P1 BASIC6.57□□□□□ -1.36
ANKRD42Q8N9B4 GTDC1-204ENST00000392869 10514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
ANKRD42Q8N9B4 TAF7L-203ENST00000372907 2341 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
ANKRD42Q8N9B4 NARS2-204ENST00000528850 2137 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
ANKRD42Q8N9B4 MEF2C-225ENST00000625585 3467 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
ANKRD42Q8N9B4 AC015971.1-203ENST00000426549 1948 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
ANKRD42Q8N9B4 LEKR1-204ENST00000470811 2881 ntTSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
ANKRD42Q8N9B4 CLVS1-203ENST00000518592 2880 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
ANKRD42Q8N9B4 AC017002.4-201ENST00000604721 1525 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
ANKRD42Q8N9B4 AC007744.1-201ENST00000607540 2289 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
ANKRD42Q8N9B4 AC010401.2-201ENST00000575137 4934 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
ANKRD42Q8N9B4 AC044839.1-206ENST00000635559 1324 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
ANKRD42Q8N9B4 CYP4A22-206ENST00000619754 2351 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
ANKRD42Q8N9B4 MGST2-201ENST00000265498 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
ANKRD42Q8N9B4 HESX1-201ENST00000295934 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
ANKRD42Q8N9B4 S100A5-202ENST00000368718 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
ANKRD42Q8N9B4 OR5D16-201ENST00000378396 987 ntAPPRIS P1 BASIC6.56□□□□□ -1.36
ANKRD42Q8N9B4 RPS3AP5-201ENST00000389400 821 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
ANKRD42Q8N9B4 RPL31-206ENST00000409650 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
ANKRD42Q8N9B4 RN7SKP161-201ENST00000411110 305 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
ANKRD42Q8N9B4 OR52N3P-201ENST00000413417 934 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
ANKRD42Q8N9B4 AL050320.1-201ENST00000420044 446 ntTSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
ANKRD42Q8N9B4 AC134879.1-201ENST00000426062 394 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
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