Protein–RNA interactions for Protein: Q17RW2

COL24A1, Collagen alpha-1(XXIV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,714 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL24A1Q17RW2 AC026951.1-201ENST00000559530 2459 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
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COL24A1Q17RW2 CCDC18-AS1-205ENST00000421202 2973 ntTSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
COL24A1Q17RW2 ZNF449-201ENST00000339249 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
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COL24A1Q17RW2 LINC01798-204ENST00000433396 682 ntTSL 3 BASIC7.7□□□□□ -1.18
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COL24A1Q17RW2 MOSPD2-206ENST00000497603 775 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
COL24A1Q17RW2 AC018607.1-201ENST00000518552 673 ntTSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
COL24A1Q17RW2 AC092865.1-201ENST00000544395 1023 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
COL24A1Q17RW2 AC009054.1-201ENST00000568140 427 ntTSL 3 BASIC7.7□□□□□ -1.18
COL24A1Q17RW2 AC114684.1-201ENST00000587659 352 ntTSL 3 BASIC7.7□□□□□ -1.18
COL24A1Q17RW2 AL109935.2-201ENST00000587737 395 ntTSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
COL24A1Q17RW2 RPSAP73-201ENST00000614820 330 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
COL24A1Q17RW2 AC073342.3-201ENST00000624211 193 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
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