Protein–RNA interactions for Protein: Q16656

NRF1, Nuclear respiratory factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRF1Q16656 MAPK10-287ENST00000641217 3037 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
NRF1Q16656 CDH7-201ENST00000323011 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
NRF1Q16656 ZNF578-201ENST00000421239 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
NRF1Q16656 IFRD1-216ENST00000535603 3397 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
NRF1Q16656 APBB2-230ENST00000543538 6992 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.44
NRF1Q16656 ZNF766-201ENST00000439461 6298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
NRF1Q16656 CYP3A5-201ENST00000222982 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
NRF1Q16656 AC004023.1-201ENST00000561473 1744 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
NRF1Q16656 SLC35A5-206ENST00000492406 4399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
NRF1Q16656 ZEB2-AS1-202ENST00000427278 1322 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
NRF1Q16656 SAMMSON-210ENST00000641260 1308 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
NRF1Q16656 FASTKD2-201ENST00000236980 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
NRF1Q16656 ARHGEF9-229ENST00000637040 5001 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
NRF1Q16656 SLC1A3-215ENST00000612708 3832 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
NRF1Q16656 LINC02397-201ENST00000504409 10626 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
NRF1Q16656 SERPINB7-202ENST00000398019 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
NRF1Q16656 CEACAM1-201ENST00000161559 3519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
NRF1Q16656 AL035665.1-201ENST00000428495 1669 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
NRF1Q16656 OR4D5-201ENST00000307033 1095 ntAPPRIS P1 BASIC6.02□□□□□ -1.45
NRF1Q16656 SNORD94-201ENST00000386037 137 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
NRF1Q16656 CD200R1L-201ENST00000398214 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
NRF1Q16656 OR2A2-201ENST00000408979 1051 ntAPPRIS P1 BASIC6.02□□□□□ -1.45
NRF1Q16656 U3.43-201ENST00000410734 213 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
NRF1Q16656 AL929472.1-201ENST00000417484 429 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
NRF1Q16656 SMARCE1P1-201ENST00000417747 1186 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
NRF1Q16656 AL359962.1-201ENST00000417969 303 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
NRF1Q16656 SPATA20P1-201ENST00000423089 438 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
NRF1Q16656 AL160275.1-201ENST00000423632 476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
NRF1Q16656 AC000089.1-201ENST00000424559 801 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
NRF1Q16656 AL606534.4-201ENST00000427176 792 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
NRF1Q16656 AL445623.1-201ENST00000440888 237 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
NRF1Q16656 OR13K1P-201ENST00000444577 975 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
NRF1Q16656 LINC00349-201ENST00000448748 841 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
NRF1Q16656 AC022080.2-201ENST00000452932 533 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
NRF1Q16656 RN7SL655P-201ENST00000486087 298 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
NRF1Q16656 RN7SL37P-201ENST00000490461 307 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
NRF1Q16656 AC114324.2-202ENST00000503812 134 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
NRF1Q16656 AC139713.1-202ENST00000512366 460 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
NRF1Q16656 SCARNA5-201ENST00000516201 276 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
NRF1Q16656 IGHVIII-47-1-201ENST00000518187 331 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
NRF1Q16656 AP002336.3-201ENST00000526017 367 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
NRF1Q16656 OPCML-IT2-201ENST00000533260 398 ntTSL 4 BASIC6.02□□□□□ -1.45
NRF1Q16656 ASXL1-208ENST00000555343 1034 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
NRF1Q16656 PPIAL4A-201ENST00000577856 660 ntAPPRIS P1 BASIC6.02□□□□□ -1.45
NRF1Q16656 AC119868.1-202ENST00000584741 347 ntTSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
NRF1Q16656 LINC01966-201ENST00000595809 821 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
NRF1Q16656 HNRNPA3P9-201ENST00000604913 979 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
NRF1Q16656 AC247036.1-201ENST00000605005 389 ntTSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
NRF1Q16656 CDC37L1-AS1-202ENST00000609131 235 ntTSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
NRF1Q16656 AC005858.3-201ENST00000624756 589 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
NRF1Q16656 RMDN2-AS1-207ENST00000627614 765 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
NRF1Q16656 SOX9-AS1-218ENST00000628742 733 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
NRF1Q16656 CLUHP10-201ENST00000631979 980 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
NRF1Q16656 WDR95P-201ENST00000425638 1542 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
NRF1Q16656 TGIF1-211ENST00000548489 1536 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
NRF1Q16656 TCF7L2-222ENST00000627217 3680 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
NRF1Q16656 SEC61A2-202ENST00000304267 2030 ntTSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
NRF1Q16656 SAMD3-205ENST00000457563 1877 ntTSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
NRF1Q16656 UGT2A1-206ENST00000514019 2376 ntTSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
NRF1Q16656 UPRT-207ENST00000530743 1636 ntTSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
NRF1Q16656 RYR3-202ENST00000415757 15557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
NRF1Q16656 ZNF605-204ENST00000392321 6156 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
NRF1Q16656 ZNF329-201ENST00000358067 3290 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
NRF1Q16656 CLASP2-205ENST00000461133 4814 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
NRF1Q16656 PSMC1P4-201ENST00000515236 1327 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
NRF1Q16656 MTRNR2L8-201ENST00000536684 1303 ntAPPRIS P1 BASIC6.01□□□□□ -1.45
NRF1Q16656 ZNF177-202ENST00000589262 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
NRF1Q16656 MPHOSPH9-220ENST00000606320 6351 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
NRF1Q16656 MBNL2-203ENST00000376673 4632 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
NRF1Q16656 C14orf105-201ENST00000216445 3082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
NRF1Q16656 HORMAD2-202ENST00000403975 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
NRF1Q16656 ZNF224-201ENST00000336976 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
NRF1Q16656 AL355834.1-201ENST00000556602 3965 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
NRF1Q16656 CDY3P-201ENST00000454543 1618 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
NRF1Q16656 OR5B21-201ENST00000360374 931 ntAPPRIS P1 BASIC6.01□□□□□ -1.45
NRF1Q16656 RNA5-8SP5-201ENST00000365304 152 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
NRF1Q16656 ATP5EP2-201ENST00000381026 385 ntAPPRIS P1 BASIC6.01□□□□□ -1.45
NRF1Q16656 MIR191-201ENST00000384873 92 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
NRF1Q16656 RNU11-201ENST00000387069 134 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
NRF1Q16656 OOSP1-201ENST00000398992 1270 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
NRF1Q16656 RPL5P20-201ENST00000403848 896 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
NRF1Q16656 RN7SKP205-201ENST00000410999 307 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
NRF1Q16656 RPL23AP85-201ENST00000421838 433 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
NRF1Q16656 AL157834.1-201ENST00000422744 420 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
NRF1Q16656 AL358394.1-201ENST00000422807 535 ntTSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
NRF1Q16656 AL138733.2-201ENST00000431947 804 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
NRF1Q16656 AC003989.1-201ENST00000434569 565 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
NRF1Q16656 BBIP1-205ENST00000436562 383 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
NRF1Q16656 LINC01681-201ENST00000439184 760 ntTSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
NRF1Q16656 AC004470.1-201ENST00000442155 382 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
NRF1Q16656 GAPDHP33-201ENST00000443168 1013 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
NRF1Q16656 HCG14-201ENST00000444986 413 ntTSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
NRF1Q16656 AC092967.1-201ENST00000449016 481 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
NRF1Q16656 KBTBD8-202ENST00000460576 984 ntTSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
NRF1Q16656 RN7SL393P-201ENST00000463588 296 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
NRF1Q16656 AP003385.3-201ENST00000472498 287 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
NRF1Q16656 RN7SL836P-201ENST00000476140 296 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
NRF1Q16656 RPL5P33-201ENST00000487833 905 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
NRF1Q16656 B3GNTL1P1-201ENST00000509174 289 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
NRF1Q16656 AC094105.1-201ENST00000509745 560 ntTSL 4 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75 ms