Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 TAB2-AS1-201ENST00000424421 730 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
SIX1Q15475 SOCS5P1-201ENST00000440415 949 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
SIX1Q15475 PA2G4P1-201ENST00000442248 1197 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
SIX1Q15475 BMS1P11-201ENST00000442351 885 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
SIX1Q15475 CRYZL1-217ENST00000445393 824 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
SIX1Q15475 AL133319.1-201ENST00000447848 777 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
SIX1Q15475 BMS1P9-201ENST00000457640 885 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
SIX1Q15475 PFN2-209ENST00000481275 560 ntTSL 4 BASIC6.38□□□□□ -1.39
SIX1Q15475 GM2AP2-201ENST00000491764 562 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
SIX1Q15475 MRPS5P3-201ENST00000515577 166 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
SIX1Q15475 AC025871.2-201ENST00000522589 511 ntTSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
SIX1Q15475 AC016405.1-202ENST00000524348 758 ntTSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
SIX1Q15475 AP003028.1-203ENST00000525832 444 ntTSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
SIX1Q15475 CHEK2P2-201ENST00000554701 672 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
SIX1Q15475 DAAM1-208ENST00000556135 582 ntTSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
SIX1Q15475 HMGN1P26-201ENST00000558737 303 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
SIX1Q15475 NIFKP4-201ENST00000567275 1192 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
SIX1Q15475 MRPS21P9-201ENST00000571150 257 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
SIX1Q15475 SMAGP-208ENST00000605627 577 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
SIX1Q15475 AC073218.2-202ENST00000605962 617 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
SIX1Q15475 AC004921.1-201ENST00000608884 733 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
SIX1Q15475 U91328.4-201ENST00000608919 517 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
SIX1Q15475 AC022106.1-201ENST00000612834 766 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
SIX1Q15475 OR1N2-202ENST00000616791 993 ntAPPRIS P2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
SIX1Q15475 Metazoa_SRP.77-201ENST00000616915 252 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
SIX1Q15475 RSU1P2-204ENST00000619977 1240 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
SIX1Q15475 DYNC2LI1-210ENST00000605786 1346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
SIX1Q15475 CAMSAP2-201ENST00000236925 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
SIX1Q15475 ZNF192P1-201ENST00000440790 1628 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
SIX1Q15475 FRMD3-207ENST00000621208 5064 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
SIX1Q15475 AC024587.1-201ENST00000505925 2157 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
SIX1Q15475 AC104024.1-201ENST00000428142 2201 ntTSL 2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
SIX1Q15475 ZNF675-201ENST00000359788 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
SIX1Q15475 GPR155-206ENST00000614352 7321 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
SIX1Q15475 KCNIP4-202ENST00000382148 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
SIX1Q15475 HHLA2-211ENST00000619531 2548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
SIX1Q15475 RNF6-202ENST00000381570 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
SIX1Q15475 GPATCH2-202ENST00000366935 5851 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
SIX1Q15475 KIAA2012-205ENST00000541917 3543 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
SIX1Q15475 FBXO25-204ENST00000382824 10386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
SIX1Q15475 AC021092.1-201ENST00000592946 3199 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
SIX1Q15475 RASGRP1-203ENST00000450598 2296 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
SIX1Q15475 SLC26A5-205ENST00000393723 2174 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
SIX1Q15475 LINC01470-202ENST00000506723 2193 ntTSL 2 BASIC6.37□□□□□ -1.39
SIX1Q15475 JAKMIP2-205ENST00000507386 5915 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
SIX1Q15475 CHD2-208ENST00000626874 7764 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
SIX1Q15475 OFD1P15Y-201ENST00000411536 1392 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
SIX1Q15475 LINC00282-202ENST00000627246 4008 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC6.37□□□□□ -1.39
SIX1Q15475 SCML2-202ENST00000398048 1334 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
SIX1Q15475 STS-201ENST00000217961 6521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
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SIX1Q15475 AL162739.1-201ENST00000450606 307 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
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SIX1Q15475 AC107982.2-201ENST00000577360 463 ntTSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
SIX1Q15475 LINC02112-203ENST00000606169 419 ntTSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
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SIX1Q15475 LTA4H-209ENST00000552789 2025 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
SIX1Q15475 AC113146.2-201ENST00000560743 1961 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
SIX1Q15475 CHD2-215ENST00000628375 3202 ntTSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
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SIX1Q15475 PUM1-206ENST00000426105 4043 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
SIX1Q15475 LINC01224-203ENST00000596283 2766 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
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SIX1Q15475 SLC2A14-221ENST00000616981 3366 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
SIX1Q15475 LZIC-203ENST00000400903 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
SIX1Q15475 NAV1-201ENST00000367295 11645 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
SIX1Q15475 FAM135A-202ENST00000361499 5042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
SIX1Q15475 PCDH15-213ENST00000395445 5917 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
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SIX1Q15475 ZNF300P1-202ENST00000520773 3115 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
SIX1Q15475 CCDC150-202ENST00000409270 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
SIX1Q15475 SPATA31D5P-202ENST00000527857 4863 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
SIX1Q15475 TCF12-214ENST00000559710 1314 ntTSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
SIX1Q15475 TIMM21-201ENST00000169551 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
SIX1Q15475 DDX1-208ENST00000621973 2183 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
SIX1Q15475 OR7A10-201ENST00000248058 930 ntAPPRIS P1 BASIC6.36□□□□□ -1.39
SIX1Q15475 ICE2-201ENST00000261520 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
SIX1Q15475 SMR3B-201ENST00000304915 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
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