Protein–RNA interactions for Protein: Q15306

IRF4, Interferon regulatory factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF4Q15306 TVP23B-209ENST00000581733 1258 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
IRF4Q15306 AP005136.2-201ENST00000583253 1049 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
IRF4Q15306 AC090415.2-201ENST00000584078 374 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
IRF4Q15306 AL008723.3-201ENST00000608926 449 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
IRF4Q15306 AL080312.2-201ENST00000613001 630 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
IRF4Q15306 PABPC1P8-201ENST00000452851 2086 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
IRF4Q15306 BRAFP1-201ENST00000445336 2703 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
IRF4Q15306 CFAP57-208ENST00000610710 4162 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
IRF4Q15306 KAT7-203ENST00000435742 3638 ntTSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
IRF4Q15306 SLC14A1-208ENST00000586142 2846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
IRF4Q15306 RIPK1-202ENST00000380409 3864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
IRF4Q15306 ADCY10-205ENST00000545172 4966 ntTSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
IRF4Q15306 PPP4R1L-209ENST00000497138 4680 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
IRF4Q15306 ANKRD12-201ENST00000262126 11288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.4
IRF4Q15306 TANC2-202ENST00000424789 11721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
IRF4Q15306 GPATCH2L-201ENST00000261530 14007 ntTSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
IRF4Q15306 FAM216B-202ENST00000537894 3300 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.27□□□□□ -1.41
IRF4Q15306 HOMEZ-203ENST00000561013 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
IRF4Q15306 MTAP-210ENST00000580900 7557 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
IRF4Q15306 FAM13C-219ENST00000621119 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
IRF4Q15306 BNC1-202ENST00000569704 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
IRF4Q15306 MKL2-202ENST00000571589 8799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
IRF4Q15306 IGF2BP3-201ENST00000258729 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
IRF4Q15306 GDA-209ENST00000545168 5362 ntTSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
IRF4Q15306 POLR2B-202ENST00000381227 4108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
IRF4Q15306 CASP10-205ENST00000360132 5814 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
IRF4Q15306 BABAM2-206ENST00000379632 1752 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
IRF4Q15306 P2RY14-202ENST00000424796 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
IRF4Q15306 ATMIN-204ENST00000564241 4803 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
IRF4Q15306 INTS12-211ENST00000618810 1502 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
IRF4Q15306 OR4N2-201ENST00000315947 924 ntAPPRIS P1 BASIC6.27□□□□□ -1.41
IRF4Q15306 STAG3L4-201ENST00000352103 530 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
IRF4Q15306 RNA5SP433-201ENST00000364491 114 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
IRF4Q15306 TRAV8-4-201ENST00000390438 469 ntAPPRIS P1 BASIC6.27□□□□□ -1.41
IRF4Q15306 SMARCE1P6-201ENST00000398372 1216 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
IRF4Q15306 PPP1R7-203ENST00000401987 820 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
IRF4Q15306 SNORA11.3-201ENST00000408471 128 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
IRF4Q15306 RN7SKP121-201ENST00000410842 305 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
IRF4Q15306 AL512622.1-201ENST00000414106 481 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
IRF4Q15306 VNN3-205ENST00000417437 1117 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
IRF4Q15306 AL133329.1-201ENST00000437466 478 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
IRF4Q15306 LINC01449-201ENST00000440213 1220 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
IRF4Q15306 AL583839.2-201ENST00000443716 641 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
IRF4Q15306 AC139712.3-201ENST00000443926 639 ntTSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
IRF4Q15306 AL590004.3-202ENST00000445883 451 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
IRF4Q15306 OR52I1-201ENST00000450052 1050 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
IRF4Q15306 RN7SL326P-201ENST00000477493 296 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
IRF4Q15306 AC109454.2-201ENST00000503470 520 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
IRF4Q15306 AC105919.1-201ENST00000507203 393 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
IRF4Q15306 AC079015.1-201ENST00000521793 596 ntTSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
IRF4Q15306 NATP-201ENST00000523491 878 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
IRF4Q15306 AL133481.2-201ENST00000538322 367 ntTSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
IRF4Q15306 AC012038.2-201ENST00000553006 256 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
IRF4Q15306 ADAMTS7P4-205ENST00000560651 453 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
IRF4Q15306 AC108449.2-201ENST00000560865 552 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
IRF4Q15306 MRPS21P8-201ENST00000569196 235 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
IRF4Q15306 MIR4701-201ENST00000583094 63 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
IRF4Q15306 AL354740.1-205ENST00000586413 1230 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
IRF4Q15306 AC090227.1-201ENST00000590532 936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
IRF4Q15306 AC091167.5-201ENST00000605689 894 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
IRF4Q15306 RN7SL261P-201ENST00000613441 282 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
IRF4Q15306 MIR6778-201ENST00000617912 73 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
IRF4Q15306 SNORA11.6-201ENST00000619030 128 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
IRF4Q15306 MIR7159-201ENST00000620587 66 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
IRF4Q15306 AC025262.3-201ENST00000623666 360 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
IRF4Q15306 PCAT5-201ENST00000626667 3550 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
IRF4Q15306 LINC02388-201ENST00000550678 1975 ntTSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
IRF4Q15306 FBXW12-204ENST00000445170 1379 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
IRF4Q15306 DOCK9-216ENST00000627024 4096 ntTSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
IRF4Q15306 CSNK2A1-204ENST00000400227 1499 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
IRF4Q15306 AC104966.1-201ENST00000467010 1464 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
IRF4Q15306 TCF7L2-210ENST00000369397 3802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
IRF4Q15306 LINC01951-201ENST00000377300 1925 ntTSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
IRF4Q15306 PARD3B-213ENST00000614500 7538 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
IRF4Q15306 ZMYND11-202ENST00000381584 2709 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
IRF4Q15306 HHLA2-206ENST00000467761 2379 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
IRF4Q15306 AL162726.3-201ENST00000637606 1301 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
IRF4Q15306 OSBPL6-207ENST00000409631 3273 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
IRF4Q15306 AL591848.4-201ENST00000567832 3472 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
IRF4Q15306 AL022323.4-201ENST00000623980 13120 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
IRF4Q15306 AL133243.2-201ENST00000610331 1621 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
IRF4Q15306 LINC01043-201ENST00000565936 6897 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
IRF4Q15306 DAAM1-202ENST00000395125 5806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
IRF4Q15306 NOP10-201ENST00000328848 554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
IRF4Q15306 TSLP-201ENST00000344895 736 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
IRF4Q15306 ZNF705B-201ENST00000400120 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
IRF4Q15306 LINC01980-201ENST00000414382 543 ntTSL 4 BASIC6.26□□□□□ -1.41
IRF4Q15306 RPS7P14-201ENST00000426405 583 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
IRF4Q15306 FTO-202ENST00000431610 707 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
IRF4Q15306 MGAT2P1-201ENST00000449718 797 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
IRF4Q15306 AC128689.1-201ENST00000466206 562 ntTSL 4 BASIC6.26□□□□□ -1.41
IRF4Q15306 L3HYPDH-206ENST00000487285 700 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
IRF4Q15306 LIAS-205ENST00000509519 1005 ntTSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
IRF4Q15306 AC018607.1-201ENST00000518552 673 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
IRF4Q15306 MYL2-203ENST00000548438 664 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
IRF4Q15306 RGS6-215ENST00000554782 1110 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
IRF4Q15306 AL121579.2-201ENST00000555466 590 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
IRF4Q15306 RNASE11-208ENST00000555841 886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
IRF4Q15306 LINC01533-204ENST00000590719 435 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
IRF4Q15306 PCBP1-AS1-360ENST00000630377 598 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108.4 ms