Protein–RNA interactions for Protein: Q13797

ITGA9, Integrin alpha-9, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA9Q13797 DYNC2LI1-210ENST00000605786 1346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
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ITGA9Q13797 SP110-204ENST00000392048 1937 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
ITGA9Q13797 AC037459.2-201ENST00000514980 4076 ntTSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.37
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ITGA9Q13797 WDR95P-201ENST00000425638 1542 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
ITGA9Q13797 ZC3H7A-214ENST00000575984 2632 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
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ITGA9Q13797 ZNF699-203ENST00000591998 3358 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
ITGA9Q13797 NAT1-209ENST00000541942 1948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
ITGA9Q13797 RPL31P11-201ENST00000426558 1558 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
ITGA9Q13797 PRKDC-202ENST00000338368 12784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
ITGA9Q13797 ZNF311-203ENST00000377179 2730 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
ITGA9Q13797 AC011455.2-201ENST00000599320 3336 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
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