Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

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Length 1,447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 PIRT-201ENST00000580256 3810 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.66□□□□□ -1.02
PTCH1Q13635 DIAPH3-206ENST00000465066 2735 ntTSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
PTCH1Q13635 SYNPO2-203ENST00000434046 3588 ntTSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
PTCH1Q13635 ARHGAP5-206ENST00000539826 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
PTCH1Q13635 SLC8A1-204ENST00000405269 2965 ntTSL 5 BASIC8.65□□□□□ -1.02
PTCH1Q13635 Z83820.1-201ENST00000456978 1499 ntBASIC8.65□□□□□ -1.02
PTCH1Q13635 DSC1-201ENST00000257197 4271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
PTCH1Q13635 UBAP2-201ENST00000360802 4284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.65□□□□□ -1.02
PTCH1Q13635 HMCN2-206ENST00000624552 15610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.65□□□□□ -1.02
PTCH1Q13635 SNORA74A-201ENST00000364089 198 ntBASIC8.65□□□□□ -1.02
PTCH1Q13635 RNA5SP132-201ENST00000364725 118 ntBASIC8.65□□□□□ -1.02
PTCH1Q13635 AL050335.1-201ENST00000396909 869 ntBASIC8.65□□□□□ -1.02
PTCH1Q13635 LSM5-203ENST00000409782 649 ntTSL 5 BASIC8.65□□□□□ -1.02
PTCH1Q13635 GNRH1-202ENST00000421054 470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
PTCH1Q13635 NANOGP4-201ENST00000427230 913 ntBASIC8.65□□□□□ -1.02
PTCH1Q13635 AL512593.1-201ENST00000444758 779 ntBASIC8.65□□□□□ -1.02
PTCH1Q13635 AC006482.1-201ENST00000448898 273 ntTSL 3 BASIC8.65□□□□□ -1.02
PTCH1Q13635 RN7SL860P-201ENST00000473738 223 ntBASIC8.65□□□□□ -1.02
PTCH1Q13635 AC010343.3-202ENST00000510327 619 ntTSL 3 BASIC8.65□□□□□ -1.02
PTCH1Q13635 SUMO2P7-201ENST00000511179 285 ntBASIC8.65□□□□□ -1.02
PTCH1Q13635 AC092593.2-201ENST00000513866 913 ntBASIC8.65□□□□□ -1.02
PTCH1Q13635 MYL6-213ENST00000549017 502 ntTSL 3 BASIC8.65□□□□□ -1.02
PTCH1Q13635 AC009054.1-201ENST00000568140 427 ntTSL 3 BASIC8.65□□□□□ -1.02
PTCH1Q13635 AC013731.1-201ENST00000604340 883 ntBASIC8.65□□□□□ -1.02
PTCH1Q13635 AL645933.2-201ENST00000606743 1207 ntBASIC8.65□□□□□ -1.02
PTCH1Q13635 PDE4DIP-205ENST00000369354 8262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
PTCH1Q13635 C1orf27-202ENST00000367470 3754 ntTSL 5 BASIC8.65□□□□□ -1.02
PTCH1Q13635 KBTBD3-201ENST00000526793 3751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
PTCH1Q13635 USP6-201ENST00000250066 7976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
PTCH1Q13635 ZNF160-208ENST00000599056 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
PTCH1Q13635 VANGL1-204ENST00000369510 8647 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
PTCH1Q13635 KAT7-201ENST00000259021 9644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
PTCH1Q13635 ZNF33A-204ENST00000458705 6084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
PTCH1Q13635 ZNF192P1-201ENST00000440790 1628 ntTSL 5 BASIC8.65□□□□□ -1.02
PTCH1Q13635 FGA-201ENST00000302053 3678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.65□□□□□ -1.02
PTCH1Q13635 ASH1L-202ENST00000392403 10979 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.65□□□□□ -1.03
PTCH1Q13635 PCBP1-AS1-210ENST00000416395 2451 ntTSL 2 BASIC8.65□□□□□ -1.03
PTCH1Q13635 SPTAN1-222ENST00000630804 7812 ntTSL 5 BASIC8.65□□□□□ -1.03
PTCH1Q13635 SSPO-201ENST00000378016 15589 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.65□□□□□ -1.03
PTCH1Q13635 MEP1B-204ENST00000581447 2308 ntTSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.03
PTCH1Q13635 AP002833.3-201ENST00000625075 2265 ntBASIC8.64□□□□□ -1.03
PTCH1Q13635 ZNFX1-202ENST00000371752 7212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.64□□□□□ -1.03
PTCH1Q13635 AC021205.3-201ENST00000609680 1709 ntTSL 3 BASIC8.64□□□□□ -1.03
PTCH1Q13635 OR2AE1-201ENST00000316368 1071 ntAPPRIS P1 BASIC8.64□□□□□ -1.03
PTCH1Q13635 ZNF28-201ENST00000339844 650 ntTSL 4 BASIC8.64□□□□□ -1.03
PTCH1Q13635 MIR375-201ENST00000362103 64 ntBASIC8.64□□□□□ -1.03
PTCH1Q13635 SAMD13-206ENST00000394834 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.64□□□□□ -1.03
PTCH1Q13635 RN7SKP216-201ENST00000411050 312 ntBASIC8.64□□□□□ -1.03
PTCH1Q13635 AC008164.1-201ENST00000423925 564 ntTSL 4 BASIC8.64□□□□□ -1.03
PTCH1Q13635 DEFA9P-201ENST00000433042 285 ntBASIC8.64□□□□□ -1.03
PTCH1Q13635 GAPDHP23-201ENST00000444823 993 ntBASIC8.64□□□□□ -1.03
PTCH1Q13635 FO393408.1-201ENST00000458577 582 ntTSL 5 BASIC8.64□□□□□ -1.03
PTCH1Q13635 AC010343.2-201ENST00000510162 224 ntBASIC8.64□□□□□ -1.03
PTCH1Q13635 TMEM159-205ENST00000572599 713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.64□□□□□ -1.03
PTCH1Q13635 AC099850.2-201ENST00000577660 557 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.64□□□□□ -1.03
PTCH1Q13635 MIR4776-2-201ENST00000580204 80 ntBASIC8.64□□□□□ -1.03
PTCH1Q13635 AC015818.6-201ENST00000584274 634 ntBASIC8.64□□□□□ -1.03
PTCH1Q13635 AC118658.2-201ENST00000618697 459 ntBASIC8.64□□□□□ -1.03
PTCH1Q13635 AL357562.1-201ENST00000624911 609 ntBASIC8.64□□□□□ -1.03
PTCH1Q13635 AC021079.1-201ENST00000625268 907 ntTSL 3 BASIC8.64□□□□□ -1.03
PTCH1Q13635 AC092375.1-202ENST00000639452 404 ntTSL 3 BASIC8.64□□□□□ -1.03
PTCH1Q13635 SECISBP2L-201ENST00000261847 6779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
PTCH1Q13635 AC060780.1-202ENST00000590740 5084 ntTSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
PTCH1Q13635 BCO2-214ENST00000532593 1647 ntTSL 2 BASIC8.64□□□□□ -1.03
PTCH1Q13635 AC100858.3-201ENST00000533516 1605 ntTSL 5 BASIC8.64□□□□□ -1.03
PTCH1Q13635 GAN-202ENST00000568107 15244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
PTCH1Q13635 NPHP1-203ENST00000393272 2752 ntTSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
PTCH1Q13635 ZSWIM5P3-201ENST00000511265 2743 ntBASIC8.64□□□□□ -1.03
PTCH1Q13635 AC105114.1-201ENST00000624795 1862 ntBASIC8.64□□□□□ -1.03
PTCH1Q13635 C14orf166-201ENST00000261700 7075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
PTCH1Q13635 NRK-201ENST00000243300 8062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
PTCH1Q13635 ASTN2-AS1-201ENST00000418250 1756 ntTSL 2 BASIC8.64□□□□□ -1.03
PTCH1Q13635 CCDC190-202ENST00000367911 1395 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC8.64□□□□□ -1.03
PTCH1Q13635 AC009095.1-201ENST00000388909 1326 ntTSL 5 BASIC8.64□□□□□ -1.03
PTCH1Q13635 LINC00343-202ENST00000415294 1320 ntTSL 5 BASIC8.64□□□□□ -1.03
PTCH1Q13635 DEFB118-201ENST00000253381 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
PTCH1Q13635 WFDC11-201ENST00000324384 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
PTCH1Q13635 OR6K2-201ENST00000359610 975 ntAPPRIS P1 BASIC8.63□□□□□ -1.03
PTCH1Q13635 SMARCA2-207ENST00000382186 955 ntTSL 3 BASIC8.63□□□□□ -1.03
PTCH1Q13635 RNASE11-202ENST00000398009 1034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.63□□□□□ -1.03
PTCH1Q13635 MAGI2-AS3-204ENST00000426835 738 ntTSL 3 BASIC8.63□□□□□ -1.03
PTCH1Q13635 AC004039.1-201ENST00000431165 502 ntTSL 5 BASIC8.63□□□□□ -1.03
PTCH1Q13635 ZNF619P1-201ENST00000446539 752 ntBASIC8.63□□□□□ -1.03
PTCH1Q13635 COPS8P2-201ENST00000473228 627 ntBASIC8.63□□□□□ -1.03
PTCH1Q13635 PRB1-202ENST00000500254 775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
PTCH1Q13635 SNORA70.20-201ENST00000516848 126 ntBASIC8.63□□□□□ -1.03
PTCH1Q13635 RNA5SP34-201ENST00000516887 130 ntBASIC8.63□□□□□ -1.03
PTCH1Q13635 RPA2P3-201ENST00000533268 770 ntBASIC8.63□□□□□ -1.03
PTCH1Q13635 RNASE11-208ENST00000555841 886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
PTCH1Q13635 AC012050.1-201ENST00000558185 472 ntTSL 3 BASIC8.63□□□□□ -1.03
PTCH1Q13635 AC022916.4-201ENST00000585646 475 ntTSL 3 BASIC8.63□□□□□ -1.03
PTCH1Q13635 ZNF208-204ENST00000599916 740 ntTSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
PTCH1Q13635 AC104695.2-201ENST00000605056 775 ntBASIC8.63□□□□□ -1.03
PTCH1Q13635 IGLV10-54-202ENST00000640991 351 ntTSL 5 BASIC8.63□□□□□ -1.03
PTCH1Q13635 FRMD3-207ENST00000621208 5064 ntTSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
PTCH1Q13635 ACOT13-201ENST00000230048 4047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
PTCH1Q13635 ECT2L-203ENST00000423192 4319 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.63□□□□□ -1.03
PTCH1Q13635 TMEFF2-203ENST00000409056 3364 ntTSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
PTCH1Q13635 AP2B1-215ENST00000616681 3267 ntTSL 2 BASIC8.63□□□□□ -1.03
PTCH1Q13635 DAZ1-201ENST00000382510 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
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