Protein–RNA interactions for Protein: Q13428

TCOF1, Treacle protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCOF1Q13428 AC127024.4-201ENST00000585212 308 ntTSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
TCOF1Q13428 AL645933.2-201ENST00000606743 1207 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
TCOF1Q13428 MIR6793-201ENST00000612376 63 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
TCOF1Q13428 AC024255.1-201ENST00000614376 102 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
TCOF1Q13428 ARCN1-202ENST00000359415 4038 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
TCOF1Q13428 CBLB-205ENST00000407712 1493 ntTSL 2 BASIC9.32□□□□□ -0.92
TCOF1Q13428 RAB30-214ENST00000534141 3746 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
TCOF1Q13428 AC011369.2-201ENST00000624423 1567 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
TCOF1Q13428 PAPD4-203ENST00000428308 2204 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.31□□□□□ -0.92
TCOF1Q13428 BPESC1-201ENST00000418282 3522 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
TCOF1Q13428 AC119674.1-202ENST00000641333 1860 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
TCOF1Q13428 OSBPL9-205ENST00000447887 2940 ntTSL 2 BASIC9.31□□□□□ -0.92
TCOF1Q13428 FGFR2-218ENST00000478859 3990 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
TCOF1Q13428 EBLN2-201ENST00000533473 1679 ntAPPRIS P1 BASIC9.31□□□□□ -0.92
TCOF1Q13428 SNW1-204ENST00000554775 1687 ntTSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
TCOF1Q13428 RBPJ-201ENST00000342295 5860 ntTSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
TCOF1Q13428 SELE-203ENST00000367775 3389 ntTSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
TCOF1Q13428 PIGN-238ENST00000639758 4239 ntTSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
TCOF1Q13428 SPATA4-201ENST00000280191 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
TCOF1Q13428 LIX1L-AS1-202ENST00000412239 570 ntTSL 2 BASIC9.31□□□□□ -0.92
TCOF1Q13428 EEF1B2P8-201ENST00000414101 671 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
TCOF1Q13428 HAO2-IT1-201ENST00000419144 311 ntTSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
TCOF1Q13428 NANOGP4-201ENST00000427230 913 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
TCOF1Q13428 SEPT14P12-201ENST00000442280 560 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
TCOF1Q13428 AL445466.1-201ENST00000448432 357 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
TCOF1Q13428 AL137005.1-201ENST00000452944 719 ntTSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
TCOF1Q13428 OR4A40P-201ENST00000533878 948 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
TCOF1Q13428 AC092121.1-201ENST00000569452 202 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
TCOF1Q13428 AL021368.3-201ENST00000607119 578 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
TCOF1Q13428 AC118658.2-201ENST00000618697 459 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
TCOF1Q13428 HLTF-201ENST00000310053 5317 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
TCOF1Q13428 CPSF6-202ENST00000435070 6616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
TCOF1Q13428 PDE4DIP-205ENST00000369354 8262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
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TCOF1Q13428 AC011815.2-201ENST00000618230 2021 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
TCOF1Q13428 KCNJ10-207ENST00000638868 3883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
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TCOF1Q13428 CAPRIN1-209ENST00000530820 3454 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
TCOF1Q13428 NREP-206ENST00000447165 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
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TCOF1Q13428 F5-201ENST00000367796 7039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
TCOF1Q13428 AL136531.3-201ENST00000624378 3658 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
TCOF1Q13428 PTPRT-205ENST00000373193 12681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
TCOF1Q13428 OR7D4-202ENST00000641244 4968 ntAPPRIS P1 BASIC9.29□□□□□ -0.92
TCOF1Q13428 CTNND1-234ENST00000532844 6012 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
TCOF1Q13428 GRIA4-212ENST00000530497 5059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
TCOF1Q13428 AC104024.1-201ENST00000428142 2201 ntTSL 2 BASIC9.29□□□□□ -0.92
TCOF1Q13428 LYPD6B-201ENST00000280115 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
TCOF1Q13428 OR4K5-201ENST00000315915 1078 ntAPPRIS P1 BASIC9.29□□□□□ -0.92
TCOF1Q13428 TMSB4XP2-201ENST00000335179 210 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
TCOF1Q13428 RNA5SP478-201ENST00000364657 115 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
TCOF1Q13428 AC064862.4-201ENST00000442180 334 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
TCOF1Q13428 AC016027.4-201ENST00000450866 277 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
TCOF1Q13428 RN7SL165P-201ENST00000477476 291 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
TCOF1Q13428 RNA5SP400-201ENST00000517155 111 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
TCOF1Q13428 AP000648.1-201ENST00000529682 397 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
TCOF1Q13428 LINC02411-203ENST00000546180 959 ntTSL 4 BASIC9.29□□□□□ -0.92
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