Protein–RNA interactions for Protein: Q12980

NPRL3, GATOR complex protein NPRL3, humanhuman

Predictions only

Length 569 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPRL3Q12980 BX679664.2-201ENST00000439282 283 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
NPRL3Q12980 OR13K1P-201ENST00000444577 975 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
NPRL3Q12980 AL022237.1-201ENST00000446663 358 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
NPRL3Q12980 AL161722.1-201ENST00000446972 1032 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
NPRL3Q12980 SPTSSB-202ENST00000497137 880 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
NPRL3Q12980 AC093895.1-201ENST00000506480 821 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
NPRL3Q12980 RFPL4AP3-201ENST00000515267 345 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
NPRL3Q12980 AC022973.3-201ENST00000521014 467 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
NPRL3Q12980 AP003469.1-202ENST00000521884 478 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
NPRL3Q12980 IGHVIII-11-1-201ENST00000522733 267 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
NPRL3Q12980 OR4A40P-201ENST00000533878 948 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
NPRL3Q12980 LDHC-203ENST00000535809 757 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
NPRL3Q12980 LDHC-205ENST00000537486 583 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
NPRL3Q12980 AL162632.2-201ENST00000553933 399 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
NPRL3Q12980 AC015727.1-201ENST00000572792 512 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
NPRL3Q12980 AL133410.1-201ENST00000574939 546 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
NPRL3Q12980 TVP23B-209ENST00000581733 1258 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
NPRL3Q12980 RPL12P48-201ENST00000605620 304 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
NPRL3Q12980 CT45A6-202ENST00000620654 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
NPRL3Q12980 MRPL57P1-201ENST00000621486 265 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
NPRL3Q12980 AC106782.7-201ENST00000624024 418 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
NPRL3Q12980 AC133555.5-201ENST00000624430 418 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
NPRL3Q12980 AP000550.3-201ENST00000637734 379 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
NPRL3Q12980 RALGAPA1-202ENST00000382366 6328 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
NPRL3Q12980 BPIFC-201ENST00000300399 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
NPRL3Q12980 CD84-208ENST00000534968 7885 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
NPRL3Q12980 RFC1-201ENST00000349703 4859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
NPRL3Q12980 OR4K13-202ENST00000641664 5980 ntAPPRIS P1 BASIC5.96□□□□□ -1.46
NPRL3Q12980 TMEM200A-202ENST00000392429 5017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
NPRL3Q12980 PHC3-214ENST00000494943 5030 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
NPRL3Q12980 CYP3A5-201ENST00000222982 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
NPRL3Q12980 SLC35A5-201ENST00000261034 2444 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
NPRL3Q12980 C4orf26-201ENST00000311623 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
NPRL3Q12980 PCDH18-202ENST00000412923 5102 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
NPRL3Q12980 MCM3AP-AS1-204ENST00000432735 2302 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
NPRL3Q12980 AC112255.1-201ENST00000624070 2493 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
NPRL3Q12980 AC011455.2-201ENST00000599320 3336 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
NPRL3Q12980 AC005725.1-201ENST00000577346 2607 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
NPRL3Q12980 RNF217-201ENST00000359704 1784 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
NPRL3Q12980 B3GNT5-206ENST00000465010 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
NPRL3Q12980 ZSCAN4-201ENST00000318203 2246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
NPRL3Q12980 OSBPL9-206ENST00000453295 2842 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
NPRL3Q12980 ZNF329-201ENST00000358067 3290 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
NPRL3Q12980 PGBD4-201ENST00000397766 6612 ntAPPRIS P1 BASIC5.95□□□□□ -1.46
NPRL3Q12980 REG1A-201ENST00000233735 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
NPRL3Q12980 ZNF610-202ENST00000327920 1855 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
NPRL3Q12980 RNA5SP152-201ENST00000365184 110 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
NPRL3Q12980 CAV1-204ENST00000393470 598 ntTSL 4 BASIC5.95□□□□□ -1.46
NPRL3Q12980 LDHAP5-201ENST00000394996 622 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
NPRL3Q12980 CYP2AC1P-201ENST00000407830 1173 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
NPRL3Q12980 UBE2F-204ENST00000409953 924 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
NPRL3Q12980 CYP4F30P-202ENST00000420048 405 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
NPRL3Q12980 SPATA20P1-201ENST00000423089 438 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
NPRL3Q12980 AL034379.1-201ENST00000423216 253 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
NPRL3Q12980 AL121759.1-202ENST00000425746 387 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
NPRL3Q12980 AL606534.4-201ENST00000427176 792 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
NPRL3Q12980 AC095038.1-201ENST00000429248 1591 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
NPRL3Q12980 ZNF735-201ENST00000429565 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
NPRL3Q12980 LINC01832-201ENST00000446520 553 ntTSL 4 BASIC5.95□□□□□ -1.46
NPRL3Q12980 AC103563.5-201ENST00000455643 364 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
NPRL3Q12980 RN7SL267P-201ENST00000485107 261 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
NPRL3Q12980 AC022415.1-202ENST00000486612 523 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
NPRL3Q12980 AC018709.1-201ENST00000509111 700 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
NPRL3Q12980 AC139491.5-201ENST00000510029 920 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
NPRL3Q12980 AC010442.1-201ENST00000515583 816 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
NPRL3Q12980 PKIA-AS1-202ENST00000522302 2011 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
NPRL3Q12980 TBCA-209ENST00000522370 435 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
NPRL3Q12980 PVT1-214ENST00000522875 922 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
NPRL3Q12980 COX6C-210ENST00000524245 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
NPRL3Q12980 VDAC2-214ENST00000543351 1424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
NPRL3Q12980 LINC02413-201ENST00000549914 723 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
NPRL3Q12980 HMGN1P26-201ENST00000558737 303 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
NPRL3Q12980 AC116158.2-201ENST00000559544 553 ntTSL 4 BASIC5.95□□□□□ -1.46
NPRL3Q12980 AC004023.1-201ENST00000561473 1744 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
NPRL3Q12980 AC103876.1-202ENST00000561498 369 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
NPRL3Q12980 OR4H6P-201ENST00000563771 921 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
NPRL3Q12980 AC004034.1-201ENST00000573260 510 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
NPRL3Q12980 AC016383.1-201ENST00000582700 714 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
NPRL3Q12980 AC135178.4-201ENST00000585275 548 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
NPRL3Q12980 AC005546.1-201ENST00000591837 391 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
NPRL3Q12980 AC022001.1-201ENST00000605193 268 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
NPRL3Q12980 AC135068.11-201ENST00000636378 921 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
NPRL3Q12980 OR5H15-202ENST00000641450 1229 ntAPPRIS P1 BASIC5.95□□□□□ -1.46
NPRL3Q12980 CEP128-202ENST00000281129 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
NPRL3Q12980 CAPRIN2-202ENST00000395805 4156 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
NPRL3Q12980 AC127164.1-201ENST00000548738 4196 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
NPRL3Q12980 AC074141.1-201ENST00000588129 2995 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
NPRL3Q12980 AC109811.1-201ENST00000512833 2807 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
NPRL3Q12980 SH2D1B-201ENST00000367929 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
NPRL3Q12980 FLJ12825-201ENST00000515617 3942 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
NPRL3Q12980 HCG18-237ENST00000444126 4605 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
NPRL3Q12980 ALMS1-IT1-201ENST00000441587 2107 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
NPRL3Q12980 CDH13-209ENST00000567109 8042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
NPRL3Q12980 SGO2-201ENST00000357799 4214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
NPRL3Q12980 WASHC4-202ENST00000332180 5812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
NPRL3Q12980 BIN2P1-201ENST00000504996 1530 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
NPRL3Q12980 TGFBR1-208ENST00000550253 1538 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
NPRL3Q12980 KIAA1109-201ENST00000264501 15896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
NPRL3Q12980 AC008080.4-201ENST00000420185 1589 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
NPRL3Q12980 LINC01684-203ENST00000453784 2908 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105 ms