Protein–RNA interactions for Protein: Q12830

BPTF, Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF, humanhuman

Predictions only

Length 3,046 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPTFQ12830 AL355075.2-201ENST00000555435 478 ntTSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
BPTFQ12830 AC009113.2-201ENST00000563182 403 ntTSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
BPTFQ12830 AC142086.4-201ENST00000568904 650 ntTSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
BPTFQ12830 Metazoa_SRP.94-201ENST00000612609 250 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
BPTFQ12830 MEIS1-202ENST00000398506 3530 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
BPTFQ12830 MARF1-202ENST00000540441 7105 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
BPTFQ12830 ZEB2-236ENST00000636471 9583 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
BPTFQ12830 CENPC-201ENST00000273853 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
BPTFQ12830 LIPG-201ENST00000261292 10441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
BPTFQ12830 FO082842.1-201ENST00000423552 1370 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
BPTFQ12830 C17orf105-201ENST00000449302 3753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
BPTFQ12830 ATP2B4-203ENST00000357681 8968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
BPTFQ12830 METTL9-211ENST00000615720 2890 ntTSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
BPTFQ12830 CACNA1D-203ENST00000422281 6414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
BPTFQ12830 USP9YP3-201ENST00000434481 1766 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
BPTFQ12830 ZNF43-202ENST00000357491 5249 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.42
BPTFQ12830 KIAA0319-206ENST00000616673 5315 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
BPTFQ12830 MIR23A-201ENST00000385245 73 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
BPTFQ12830 AC007568.1-201ENST00000422912 471 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
BPTFQ12830 AC130360.1-201ENST00000425489 1117 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
BPTFQ12830 OR2L9P-201ENST00000444456 913 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
BPTFQ12830 C21orf62-202ENST00000479548 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
BPTFQ12830 LINC02218-201ENST00000503267 529 ntTSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.42
BPTFQ12830 AC114956.1-201ENST00000504277 512 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
BPTFQ12830 RNA5SP418-201ENST00000515951 117 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
BPTFQ12830 HDAC2-AS2-217ENST00000523087 493 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
BPTFQ12830 IGHV1-14-201ENST00000523391 241 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
BPTFQ12830 AC130365.2-201ENST00000525882 1201 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
BPTFQ12830 OR4H6P-201ENST00000563771 921 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
BPTFQ12830 LINC00309-201ENST00000431020 3307 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
BPTFQ12830 ATP9A-201ENST00000311637 7437 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
BPTFQ12830 ZBTB26-202ENST00000373656 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
BPTFQ12830 ZNF462-204ENST00000441147 4691 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
BPTFQ12830 HAT1-201ENST00000264108 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
BPTFQ12830 CACNA1C-220ENST00000399655 13433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
BPTFQ12830 LCT-201ENST00000264162 6279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
BPTFQ12830 LINC00347-202ENST00000594461 2371 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
BPTFQ12830 NCOR1-202ENST00000395848 3106 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
BPTFQ12830 OR9K1P-201ENST00000326513 941 ntBASIC6.15□□□□□ -1.43
BPTFQ12830 AC002553.3-201ENST00000453002 341 ntBASIC6.15□□□□□ -1.43
BPTFQ12830 RN7SL104P-201ENST00000498686 293 ntBASIC6.15□□□□□ -1.43
BPTFQ12830 ULK4P1-201ENST00000564495 875 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
BPTFQ12830 OXSM-209ENST00000626005 309 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.43
BPTFQ12830 MUC3A-203ENST00000483366 9944 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.43
BPTFQ12830 TNFSF4-201ENST00000281834 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
BPTFQ12830 ARHGEF9-201ENST00000253401 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
BPTFQ12830 WDR72-203ENST00000557913 5900 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.43
BPTFQ12830 PDZRN4-203ENST00000539469 3041 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
BPTFQ12830 AC105235.1-201ENST00000623208 1816 ntBASIC6.15□□□□□ -1.43
BPTFQ12830 TIAL1-203ENST00000369093 5072 ntTSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.43
BPTFQ12830 RPL7L1-208ENST00000493763 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
BPTFQ12830 FBXL20-201ENST00000264658 10388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
BPTFQ12830 FANCD2-205ENST00000431693 2450 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
BPTFQ12830 AC073365.1-203ENST00000641055 1992 ntBASIC6.15□□□□□ -1.43
BPTFQ12830 THSD7B-203ENST00000413152 5846 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.43
BPTFQ12830 PHLPP2-206ENST00000568954 8317 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
BPTFQ12830 ZNF555-201ENST00000334241 8557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
BPTFQ12830 AC023490.2-201ENST00000359859 470 ntBASIC6.15□□□□□ -1.43
BPTFQ12830 AL353626.3-201ENST00000413399 657 ntBASIC6.15□□□□□ -1.43
BPTFQ12830 AL355433.1-201ENST00000422804 300 ntBASIC6.15□□□□□ -1.43
BPTFQ12830 RPL36A-206ENST00000471855 399 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.43
BPTFQ12830 AC104411.1-201ENST00000480817 320 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.43
BPTFQ12830 AC090572.3-201ENST00000519041 804 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.43
BPTFQ12830 MITF-217ENST00000531774 1074 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
BPTFQ12830 RPL36A-209ENST00000553110 429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
BPTFQ12830 ZNF791-202ENST00000446165 6412 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
BPTFQ12830 AC245060.6-201ENST00000624350 8420 ntBASIC6.15□□□□□ -1.43
BPTFQ12830 SORBS1-202ENST00000306402 5858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
BPTFQ12830 ZNF540-201ENST00000316433 3099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
BPTFQ12830 ARL14EPL-201ENST00000601302 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
BPTFQ12830 OR10G4-202ENST00000641521 3623 ntAPPRIS P1 BASIC6.14□□□□□ -1.43
BPTFQ12830 AC006213.6-201ENST00000623722 4179 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
BPTFQ12830 PHLDB2-202ENST00000393925 5543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
BPTFQ12830 PSG10P-201ENST00000501199 1500 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
BPTFQ12830 SMG1-202ENST00000446231 16115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
BPTFQ12830 TSPAN6-204ENST00000612152 3796 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
BPTFQ12830 SNORA21-201ENST00000362423 132 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
BPTFQ12830 AL606534.1-201ENST00000439562 694 ntTSL 3 BASIC6.14□□□□□ -1.43
BPTFQ12830 MIR205HG-209ENST00000458250 406 ntTSL 3 BASIC6.14□□□□□ -1.43
BPTFQ12830 DAP3-209ENST00000465375 729 ntTSL 2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
BPTFQ12830 OARD1-207ENST00000468811 819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
BPTFQ12830 RN7SL826P-201ENST00000479724 288 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
BPTFQ12830 GTF2H1-208ENST00000526630 932 ntTSL 2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
BPTFQ12830 AP001970.1-201ENST00000531681 701 ntTSL 3 BASIC6.14□□□□□ -1.43
BPTFQ12830 AC005832.1-201ENST00000544380 572 ntTSL 4 BASIC6.14□□□□□ -1.43
BPTFQ12830 AC012050.1-201ENST00000558185 472 ntTSL 3 BASIC6.14□□□□□ -1.43
BPTFQ12830 RPL10P14-201ENST00000565265 298 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
BPTFQ12830 LINC00921-201ENST00000572123 243 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
BPTFQ12830 MRO-208ENST00000588444 866 ntTSL 3 BASIC6.14□□□□□ -1.43
BPTFQ12830 POLR1D-218ENST00000636817 4592 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
BPTFQ12830 CR383656.5-201ENST00000547616 1340 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
BPTFQ12830 GTF3C3-202ENST00000409364 1736 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
BPTFQ12830 TNC-202ENST00000350763 7641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
BPTFQ12830 MAPK10-206ENST00000395161 4186 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
BPTFQ12830 COL12A1-211ENST00000615798 11579 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
BPTFQ12830 SNRPD1-201ENST00000300413 4909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
BPTFQ12830 TNRC6A-202ENST00000395799 8438 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
BPTFQ12830 MTCO1P28-201ENST00000574177 1528 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
BPTFQ12830 ATP7B-206ENST00000448424 6404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
BPTFQ12830 RASGRP3-202ENST00000403687 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
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