Protein–RNA interactions for Protein: P24928

POLR2A, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,970 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2AP24928 AC092824.1-201ENST00000483524 576 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
POLR2AP24928 AC131182.1-201ENST00000509184 657 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
POLR2AP24928 MTCO3P42-201ENST00000509488 518 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
POLR2AP24928 MTCO3P39-201ENST00000514812 518 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
POLR2AP24928 LINC01033-204ENST00000523194 715 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
POLR2AP24928 OR4A13P-201ENST00000529316 942 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
POLR2AP24928 C8orf59-206ENST00000545322 491 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
POLR2AP24928 BICD1-206ENST00000551086 423 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
POLR2AP24928 AC005288.1-201ENST00000582842 860 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
POLR2AP24928 AC027229.1-201ENST00000583887 253 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
POLR2AP24928 AL645933.2-201ENST00000606743 1207 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
POLR2AP24928 STATH-208ENST00000615994 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
POLR2AP24928 ZC3H13-201ENST00000242848 8018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
POLR2AP24928 SERPINA9-204ENST00000424550 1462 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
POLR2AP24928 NR5A2-206ENST00000544748 4775 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
POLR2AP24928 LINC00343-202ENST00000415294 1320 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
POLR2AP24928 TIA1-201ENST00000282574 3823 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
POLR2AP24928 IRF6-201ENST00000367021 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
POLR2AP24928 AL590763.1-201ENST00000398297 1545 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
POLR2AP24928 TSHR-201ENST00000298171 4400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
POLR2AP24928 BTG4-203ENST00000525791 1394 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
POLR2AP24928 AC005332.9-201ENST00000620266 2921 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
POLR2AP24928 RAP1GDS1-202ENST00000339360 2092 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
POLR2AP24928 KMT2A-213ENST00000534358 16602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
POLR2AP24928 RBM12-203ENST00000374114 6662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
POLR2AP24928 KCNA2-214ENST00000640774 6673 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
POLR2AP24928 BORCS7-ASMT-201ENST00000299353 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
POLR2AP24928 PHYHIPL-201ENST00000373878 3569 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
POLR2AP24928 TRIQK-206ENST00000518748 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
POLR2AP24928 MITF-206ENST00000394351 1956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
POLR2AP24928 ZNF682-201ENST00000358523 2161 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
POLR2AP24928 CRYGS-201ENST00000307944 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
POLR2AP24928 SNORA64.1-201ENST00000362600 132 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
POLR2AP24928 RN7SKP77-201ENST00000363261 353 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
POLR2AP24928 SVBP-202ENST00000372522 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
POLR2AP24928 MIR541-201ENST00000401360 84 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
POLR2AP24928 SMC4P1-201ENST00000414479 527 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
POLR2AP24928 EEF1A1P29-201ENST00000416082 1096 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
POLR2AP24928 AL359853.3-201ENST00000423879 544 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
POLR2AP24928 AC099654.1-201ENST00000442649 407 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
POLR2AP24928 NDUFA5P12-201ENST00000503796 343 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
POLR2AP24928 LINC01580-201ENST00000555255 561 ntTSL 4 BASIC7.29□□□□□ -1.24
POLR2AP24928 AC009054.1-201ENST00000568140 427 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
POLR2AP24928 AL353804.2-201ENST00000603360 347 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
POLR2AP24928 RN7SL544P-201ENST00000617232 284 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
POLR2AP24928 AL035661.1-201ENST00000620459 1144 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
POLR2AP24928 RN7SL763P-201ENST00000620922 284 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
POLR2AP24928 MARK2P4-201ENST00000503381 2380 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
POLR2AP24928 CEBPZOS-204ENST00000402297 3158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
POLR2AP24928 NHLRC2-201ENST00000369301 11051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
POLR2AP24928 AC024651.2-201ENST00000562480 2098 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
POLR2AP24928 AC241584.2-201ENST00000637142 2090 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
POLR2AP24928 AC117409.1-201ENST00000470499 1310 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
POLR2AP24928 PLCH1-AS1-201ENST00000475196 1308 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
POLR2AP24928 TENM4-201ENST00000278550 14000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
POLR2AP24928 GCNA-201ENST00000373695 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
POLR2AP24928 CPS1-212ENST00000619804 1542 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
POLR2AP24928 CTNND1-222ENST00000529919 4780 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
POLR2AP24928 CFI-205ENST00000512148 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
POLR2AP24928 CREM-217ENST00000439705 2306 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
POLR2AP24928 AC010624.4-201ENST00000597606 1351 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
POLR2AP24928 UGT2B25P-201ENST00000511504 1586 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
POLR2AP24928 CSMD2-210ENST00000619121 13430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
POLR2AP24928 ADH4-209ENST00000508393 2151 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
POLR2AP24928 TTTY2-201ENST00000417072 3168 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
POLR2AP24928 LINC01108-201ENST00000427276 3152 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
POLR2AP24928 TTTY2B-201ENST00000450591 3168 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
POLR2AP24928 AC013470.2-202ENST00000635746 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
POLR2AP24928 AC007485.2-201ENST00000623493 1667 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
POLR2AP24928 AL442071.1-201ENST00000289890 558 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
POLR2AP24928 PLCG2-201ENST00000359376 3819 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
POLR2AP24928 MTND3P20-201ENST00000407663 186 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
POLR2AP24928 LINC02246-202ENST00000418954 717 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
POLR2AP24928 RPL36P18-201ENST00000419316 318 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
POLR2AP24928 LINC00310-202ENST00000419881 910 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
POLR2AP24928 AC245047.1-201ENST00000433276 873 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
POLR2AP24928 LINC02528-202ENST00000434437 535 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
POLR2AP24928 AC023481.1-201ENST00000435368 938 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
POLR2AP24928 CASC6-201ENST00000437768 733 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
POLR2AP24928 YWHAEP1-201ENST00000453697 763 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
POLR2AP24928 C21orf62-202ENST00000479548 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
POLR2AP24928 EFCAB10-203ENST00000480514 740 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
POLR2AP24928 AC106894.1-201ENST00000511735 451 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
POLR2AP24928 PDE4D-225ENST00000515835 590 ntTSL 4 BASIC7.28□□□□□ -1.24
POLR2AP24928 LINC01234-204ENST00000550905 589 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
POLR2AP24928 LINC01476-202ENST00000584262 635 ntTSL 4 BASIC7.28□□□□□ -1.24
POLR2AP24928 TADA2A-212ENST00000620367 1043 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
POLR2AP24928 AL137067.2-201ENST00000621202 131 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
POLR2AP24928 NRXN3-201ENST00000281127 8504 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
POLR2AP24928 CLEC12B-202ENST00000396502 3029 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
POLR2AP24928 ARG1-203ENST00000368087 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
POLR2AP24928 AC008560.1-201ENST00000510585 1766 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
POLR2AP24928 OAT-201ENST00000368845 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
POLR2AP24928 TGFBR3-202ENST00000370399 4550 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
POLR2AP24928 AC114401.1-201ENST00000484222 2084 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
POLR2AP24928 HLTF-201ENST00000310053 5317 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
POLR2AP24928 AL450423.1-201ENST00000615176 1857 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
POLR2AP24928 ZNF229-204ENST00000614049 4507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
POLR2AP24928 KCNMA1-266ENST00000639601 11920 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
POLR2AP24928 PYROXD1-201ENST00000240651 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.6 ms