Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEP4

C17orf47, Uncharacterized protein C17orf47, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C17orf47Q8NEP4 LINC02457-201ENST00000552992 596 ntTSL 4 BASIC5.95□□□□□ -1.46
C17orf47Q8NEP4 AL157871.4-201ENST00000557226 385 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
C17orf47Q8NEP4 AC084782.2-201ENST00000561934 839 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
C17orf47Q8NEP4 AC018558.5-201ENST00000565840 952 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
C17orf47Q8NEP4 MT1CP-201ENST00000567054 174 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
C17orf47Q8NEP4 LINC01855-201ENST00000585520 396 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
C17orf47Q8NEP4 AC006262.3-201ENST00000597337 258 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
C17orf47Q8NEP4 MIR6813-201ENST00000621638 56 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
C17orf47Q8NEP4 AC089999.3-201ENST00000622440 577 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
C17orf47Q8NEP4 AL353684.1-201ENST00000622677 1120 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
C17orf47Q8NEP4 AC105749.1-201ENST00000631338 2008 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
C17orf47Q8NEP4 AC132825.8-201ENST00000640783 297 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
C17orf47Q8NEP4 ERCC6L-202ENST00000373657 4344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
C17orf47Q8NEP4 RIPK1-202ENST00000380409 3864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
C17orf47Q8NEP4 ZNF605-204ENST00000392321 6156 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
C17orf47Q8NEP4 OR6N2-202ENST00000641131 3455 ntAPPRIS P1 BASIC5.95□□□□□ -1.46
C17orf47Q8NEP4 FAM216B-202ENST00000537894 3300 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.95□□□□□ -1.46
C17orf47Q8NEP4 MLH3-202ENST00000380968 7819 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
C17orf47Q8NEP4 AC124312.1-201ENST00000551312 1325 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
C17orf47Q8NEP4 MR1-209ENST00000617803 7584 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
C17orf47Q8NEP4 TSPAN14-207ENST00000429989 16183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
C17orf47Q8NEP4 ENKUR-201ENST00000331161 3382 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
C17orf47Q8NEP4 SGMS2-203ENST00000394686 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
C17orf47Q8NEP4 LINC01613-201ENST00000561476 2780 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
C17orf47Q8NEP4 ZNF227-201ENST00000313040 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
C17orf47Q8NEP4 CLEC9A-201ENST00000355819 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
C17orf47Q8NEP4 AC009779.8-201ENST00000641684 4384 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
C17orf47Q8NEP4 IPO8-209ENST00000544829 3212 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
C17orf47Q8NEP4 COMMD2-203ENST00000473414 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
C17orf47Q8NEP4 TRIM38-201ENST00000357085 9413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
C17orf47Q8NEP4 MELK-210ENST00000543751 2400 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
C17orf47Q8NEP4 BABAM2-206ENST00000379632 1752 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
C17orf47Q8NEP4 PSMD10-206ENST00000372296 878 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
C17orf47Q8NEP4 IGLV3-16-201ENST00000390311 385 ntAPPRIS P1 BASIC5.94□□□□□ -1.46
C17orf47Q8NEP4 IGHV6-1-201ENST00000390593 415 ntAPPRIS P1 BASIC5.94□□□□□ -1.46
C17orf47Q8NEP4 GNAT3-201ENST00000398291 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
C17orf47Q8NEP4 RN7SKP281-201ENST00000410472 352 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
C17orf47Q8NEP4 AL451081.1-201ENST00000413159 245 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
C17orf47Q8NEP4 LINC01811-201ENST00000415991 594 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
C17orf47Q8NEP4 AC106900.1-201ENST00000418620 456 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
C17orf47Q8NEP4 SETP9-201ENST00000423837 832 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
C17orf47Q8NEP4 LINC00352-201ENST00000425800 552 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
C17orf47Q8NEP4 GTF3AP6-201ENST00000432585 986 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
C17orf47Q8NEP4 AC073062.1-201ENST00000434509 455 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
C17orf47Q8NEP4 AC013410.1-201ENST00000436223 1232 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
C17orf47Q8NEP4 EMC3-AS1-205ENST00000438698 534 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
C17orf47Q8NEP4 PIK3IP1-AS1-201ENST00000440456 554 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
C17orf47Q8NEP4 AL021937.4-201ENST00000444848 444 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
C17orf47Q8NEP4 AC007383.1-201ENST00000445875 636 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
C17orf47Q8NEP4 AL158835.1-204ENST00000449693 371 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
C17orf47Q8NEP4 AC092925.1-201ENST00000470739 493 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
C17orf47Q8NEP4 ANAPC10-213ENST00000512680 505 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
C17orf47Q8NEP4 ZFAND1-204ENST00000517588 633 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
C17orf47Q8NEP4 AP003100.1-201ENST00000524772 832 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
C17orf47Q8NEP4 DEFB134-202ENST00000526438 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
C17orf47Q8NEP4 AC103843.1-201ENST00000527318 682 ntTSL 4 BASIC5.94□□□□□ -1.46
C17orf47Q8NEP4 AC023905.1-201ENST00000559799 1178 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
C17orf47Q8NEP4 CNEP1R1-204ENST00000562576 656 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
C17orf47Q8NEP4 RAB27A-212ENST00000569493 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
C17orf47Q8NEP4 TVP23B-209ENST00000581733 1258 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
C17orf47Q8NEP4 AC025809.1-201ENST00000585336 560 ntTSL 4 BASIC5.94□□□□□ -1.46
C17orf47Q8NEP4 NDUFB9P1-201ENST00000604683 510 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
C17orf47Q8NEP4 AC011891.2-201ENST00000604949 397 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
C17orf47Q8NEP4 IGKV2OR2-1-201ENST00000605129 304 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
C17orf47Q8NEP4 AC244100.4-201ENST00000617747 388 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
C17orf47Q8NEP4 LINC02341-201ENST00000637043 824 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
C17orf47Q8NEP4 ACACA-240ENST00000617649 7912 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
C17orf47Q8NEP4 DOCK11P1-201ENST00000553480 5932 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
C17orf47Q8NEP4 ITGA1-201ENST00000282588 10757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
C17orf47Q8NEP4 OR12D2-207ENST00000642051 1496 ntAPPRIS P1 BASIC5.94□□□□□ -1.46
C17orf47Q8NEP4 LINC00939-201ENST00000502479 4972 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
C17orf47Q8NEP4 MLLT10-217ENST00000631589 4955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
C17orf47Q8NEP4 NDUFS1-201ENST00000233190 11819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
C17orf47Q8NEP4 DPY19L1P1-201ENST00000417811 2594 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
C17orf47Q8NEP4 WDR72-208ENST00000614174 4224 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
C17orf47Q8NEP4 LINC01822-201ENST00000435682 2098 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
C17orf47Q8NEP4 LMO3-202ENST00000320122 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
C17orf47Q8NEP4 LCOR-201ENST00000286067 4542 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
C17orf47Q8NEP4 HMBOX1-206ENST00000519047 1551 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
C17orf47Q8NEP4 CNTN1-204ENST00000547849 3125 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
C17orf47Q8NEP4 CHN1-204ENST00000409597 1445 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
C17orf47Q8NEP4 CCAR1-201ENST00000265872 4683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
C17orf47Q8NEP4 CCDC18-AS1-205ENST00000421202 2973 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
C17orf47Q8NEP4 KLHL4-201ENST00000373114 2445 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
C17orf47Q8NEP4 CNIH1-201ENST00000216416 4793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
C17orf47Q8NEP4 ITGB1-201ENST00000302278 3640 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
C17orf47Q8NEP4 NOP10-201ENST00000328848 554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
C17orf47Q8NEP4 PAGE2B-201ENST00000374971 493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
C17orf47Q8NEP4 AF127936.1-201ENST00000435315 695 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
C17orf47Q8NEP4 AC013403.1-201ENST00000436954 263 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
C17orf47Q8NEP4 OR2L9P-201ENST00000444456 913 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
C17orf47Q8NEP4 AC234771.2-201ENST00000445718 597 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
C17orf47Q8NEP4 AC074286.1-201ENST00000452002 544 ntTSL 4 BASIC5.93□□□□□ -1.46
C17orf47Q8NEP4 MIR4432HG-202ENST00000453476 703 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
C17orf47Q8NEP4 NDUFB3-204ENST00000454214 547 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
C17orf47Q8NEP4 AL035443.1-201ENST00000456631 304 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
C17orf47Q8NEP4 CCNJP2-201ENST00000457810 1163 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
C17orf47Q8NEP4 SSBP1-205ENST00000465582 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
C17orf47Q8NEP4 AC022415.1-202ENST00000486612 523 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
C17orf47Q8NEP4 RPL17P2-201ENST00000491913 451 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.5 ms