Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Length 750 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 AC068759.1-201ENST00000447709 470 ntTSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
CCDC142Q17RM4 L29074.1-201ENST00000456072 534 ntTSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
CCDC142Q17RM4 AC068196.1-201ENST00000456895 833 ntTSL 3 BASIC6.92□□□□□ -1.3
CCDC142Q17RM4 SSBP1-205ENST00000465582 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
CCDC142Q17RM4 SOX2-OT-210ENST00000487240 751 ntTSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
CCDC142Q17RM4 RPL24-206ENST00000495401 478 ntTSL 2 BASIC6.92□□□□□ -1.3
CCDC142Q17RM4 H3F3AP3-201ENST00000497682 407 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
CCDC142Q17RM4 AC096746.1-201ENST00000501965 1042 ntTSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
CCDC142Q17RM4 CTNNA3-205ENST00000545309 555 ntTSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
CCDC142Q17RM4 AC121758.1-202ENST00000556917 658 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
CCDC142Q17RM4 AC004381.1-201ENST00000565498 351 ntTSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
CCDC142Q17RM4 MT1CP-201ENST00000567054 174 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
CCDC142Q17RM4 FGF1-213ENST00000610990 3802 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.92□□□□□ -1.3
CCDC142Q17RM4 AL589743.6-201ENST00000611025 117 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
CCDC142Q17RM4 U1.41-201ENST00000617626 165 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
CCDC142Q17RM4 AL122023.1-201ENST00000622847 530 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
CCDC142Q17RM4 SNHG5-219ENST00000623910 631 ntTSL 2 BASIC6.92□□□□□ -1.3
CCDC142Q17RM4 AC022919.1-201ENST00000624979 626 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
CCDC142Q17RM4 TTN-AS1-268ENST00000629094 604 ntTSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
CCDC142Q17RM4 LINC01435-220ENST00000630847 714 ntTSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
CCDC142Q17RM4 NDUFS1-205ENST00000449699 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.92□□□□□ -1.3
CCDC142Q17RM4 ZNF107-206ENST00000620827 5685 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC6.92□□□□□ -1.3
CCDC142Q17RM4 ERLIN2-201ENST00000276461 6073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
CCDC142Q17RM4 CASC19-228ENST00000641414 1684 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
CCDC142Q17RM4 ZEB2-244ENST00000638007 9140 ntTSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
CCDC142Q17RM4 CD96-201ENST00000283285 4324 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
CCDC142Q17RM4 TTI1-202ENST00000373448 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
CCDC142Q17RM4 EEF1A1P12-201ENST00000443590 1346 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
CCDC142Q17RM4 TEX11-202ENST00000374320 2224 ntTSL 2 BASIC6.92□□□□□ -1.3
CCDC142Q17RM4 MEF2C-202ENST00000424173 6336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
CCDC142Q17RM4 SPHKAP-201ENST00000344657 6804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
CCDC142Q17RM4 ATP13A4-204ENST00000400270 1458 ntTSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
CCDC142Q17RM4 IL2RA-203ENST00000379959 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
CCDC142Q17RM4 OR51E1-201ENST00000396952 3612 ntAPPRIS P1 BASIC6.91□□□□□ -1.3
CCDC142Q17RM4 API5P1-201ENST00000424316 1510 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
CCDC142Q17RM4 STAG2-202ENST00000371144 4281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
CCDC142Q17RM4 ADAL-201ENST00000389651 1559 ntTSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
CCDC142Q17RM4 ARPP21-204ENST00000412048 2506 ntTSL 2 BASIC6.91□□□□□ -1.3
CCDC142Q17RM4 MT4-201ENST00000219162 294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
CCDC142Q17RM4 IL36B-201ENST00000259213 1186 ntTSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
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CCDC142Q17RM4 AC211433.1-202ENST00000434256 1187 ntTSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
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CCDC142Q17RM4 MR1-209ENST00000617803 7584 ntTSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
CCDC142Q17RM4 SCML2-202ENST00000398048 1334 ntTSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
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CCDC142Q17RM4 ADAMTS9-AS2-203ENST00000481312 1970 ntTSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
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CCDC142Q17RM4 B3GALT5-203ENST00000380620 13170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
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CCDC142Q17RM4 ZNF490-201ENST00000311437 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
CCDC142Q17RM4 PTPRO-208ENST00000542557 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
CCDC142Q17RM4 TCF4-278ENST00000636400 8343 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
CCDC142Q17RM4 CD200R1-201ENST00000295863 1692 ntTSL 2 BASIC6.9□□□□□ -1.3
CCDC142Q17RM4 SORBS1-203ENST00000354106 3015 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
CCDC142Q17RM4 STIL-201ENST00000337817 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
CCDC142Q17RM4 BBOX1-205ENST00000529202 1725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
CCDC142Q17RM4 TPMT-201ENST00000309983 3181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
CCDC142Q17RM4 BNC1-202ENST00000569704 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
CCDC142Q17RM4 ZNF138-204ENST00000437743 2574 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
CCDC142Q17RM4 MIA3-201ENST00000340535 2735 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
CCDC142Q17RM4 CFHR3-203ENST00000391985 1043 ntTSL 2 BASIC6.9□□□□□ -1.3
CCDC142Q17RM4 MIR1275-201ENST00000408770 80 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
CCDC142Q17RM4 ALDH7A1P4-201ENST00000412255 178 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
CCDC142Q17RM4 AL034347.1-201ENST00000420766 835 ntTSL 3 BASIC6.9□□□□□ -1.3
CCDC142Q17RM4 AC002127.1-201ENST00000421305 225 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
CCDC142Q17RM4 GPN3P1-201ENST00000423883 535 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
CCDC142Q17RM4 GTF3AP6-201ENST00000432585 986 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
CCDC142Q17RM4 AL451136.1-201ENST00000435399 325 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
CCDC142Q17RM4 GAPDHP59-201ENST00000435908 267 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
CCDC142Q17RM4 CLNS1AP1-201ENST00000435954 682 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
CCDC142Q17RM4 AL353768.1-201ENST00000439872 487 ntTSL 3 BASIC6.9□□□□□ -1.3
CCDC142Q17RM4 LINC00867-203ENST00000445161 580 ntTSL 2 BASIC6.9□□□□□ -1.3
CCDC142Q17RM4 KBTBD8-202ENST00000460576 984 ntTSL 2 BASIC6.9□□□□□ -1.3
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