Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

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Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 ALG13-202ENST00000371979 2770 ntTSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
CACNA1SQ13698 DEFB1-201ENST00000297439 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
CACNA1SQ13698 OR11H13P-201ENST00000359695 979 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
CACNA1SQ13698 GAS5-202ENST00000414075 413 ntTSL 2 BASIC7.62□□□□□ -1.19
CACNA1SQ13698 AC092865.4-201ENST00000477936 615 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
CACNA1SQ13698 AC010343.3-202ENST00000510327 619 ntTSL 3 BASIC7.62□□□□□ -1.19
CACNA1SQ13698 SUMO2P7-201ENST00000511179 285 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
CACNA1SQ13698 AC092490.1-202ENST00000540299 809 ntTSL 3 BASIC7.62□□□□□ -1.19
CACNA1SQ13698 MYL6-213ENST00000549017 502 ntTSL 3 BASIC7.62□□□□□ -1.19
CACNA1SQ13698 THSD4-AS1-201ENST00000561571 554 ntTSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
CACNA1SQ13698 AP005119.1-201ENST00000580956 292 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
CACNA1SQ13698 LINC01533-201ENST00000585739 616 ntTSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
CACNA1SQ13698 LINC01999-201ENST00000592917 646 ntTSL 2 BASIC7.62□□□□□ -1.19
CACNA1SQ13698 CT45A1-201ENST00000594117 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
CACNA1SQ13698 AC010463.2-201ENST00000597592 661 ntTSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
CACNA1SQ13698 MIR6793-201ENST00000612376 63 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
CACNA1SQ13698 WDR75-207ENST00000631047 270 ntTSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
CACNA1SQ13698 HSD17B13-201ENST00000302219 2269 ntTSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
CACNA1SQ13698 RPS2P45-201ENST00000469997 2057 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
CACNA1SQ13698 NRCAM-205ENST00000413765 6406 ntTSL 2 BASIC7.62□□□□□ -1.19
CACNA1SQ13698 RAB11A-201ENST00000261890 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
CACNA1SQ13698 AC012254.3-201ENST00000591183 2117 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
CACNA1SQ13698 SLC5A1-204ENST00000543737 4752 ntTSL 2 BASIC7.62□□□□□ -1.19
CACNA1SQ13698 RBM12-203ENST00000374114 6662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
CACNA1SQ13698 AC117409.1-201ENST00000470499 1310 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
CACNA1SQ13698 ZNF385D-AS1-201ENST00000412369 705 ntTSL 3 BASIC7.62□□□□□ -1.19
CACNA1SQ13698 GSTM2-205ENST00000414179 982 ntTSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
CACNA1SQ13698 RPL35AP3-201ENST00000414680 288 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
CACNA1SQ13698 SLC8A1-AS1-202ENST00000417875 344 ntTSL 2 BASIC7.62□□□□□ -1.19
CACNA1SQ13698 NMD3P2-201ENST00000421815 761 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
CACNA1SQ13698 RPL36AP39-201ENST00000445859 318 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
CACNA1SQ13698 TNFRSF17-201ENST00000053243 994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
CACNA1SQ13698 TEX49-202ENST00000548380 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
CACNA1SQ13698 LINC01579-205ENST00000556447 791 ntTSL 4 BASIC7.62□□□□□ -1.19
CACNA1SQ13698 AC106037.2-201ENST00000578583 447 ntTSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
CACNA1SQ13698 MIR5095-201ENST00000578844 88 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
CACNA1SQ13698 AL513314.2-202ENST00000617077 536 ntTSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
CACNA1SQ13698 AL513314.2-201ENST00000621440 545 ntTSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
CACNA1SQ13698 ANKRD46-204ENST00000519597 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
CACNA1SQ13698 AC096582.3-201ENST00000636578 3716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
CACNA1SQ13698 XPO1-202ENST00000404992 4105 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.61□□□□□ -1.19
CACNA1SQ13698 PDE4DIP-204ENST00000369351 4922 ntTSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
CACNA1SQ13698 LARP1B-201ENST00000326639 4891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
CACNA1SQ13698 OSBPL9-205ENST00000447887 2940 ntTSL 2 BASIC7.61□□□□□ -1.19
CACNA1SQ13698 OR2F1-203ENST00000641412 4829 ntAPPRIS P1 BASIC7.61□□□□□ -1.19
CACNA1SQ13698 EEF1A1P24-201ENST00000451469 1378 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
CACNA1SQ13698 DLC1-202ENST00000316609 1837 ntTSL 2 BASIC7.61□□□□□ -1.19
CACNA1SQ13698 NCKAP1L-201ENST00000293373 9016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
CACNA1SQ13698 POM121L2-202ENST00000444565 3108 ntAPPRIS P2 BASIC7.61□□□□□ -1.19
CACNA1SQ13698 SSX3-201ENST00000298396 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
CACNA1SQ13698 SNORA74A-201ENST00000364089 198 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
CACNA1SQ13698 AL445238.1-204ENST00000400311 463 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
CACNA1SQ13698 Z98742.1-201ENST00000419801 632 ntTSL 3 BASIC7.61□□□□□ -1.19
CACNA1SQ13698 AC127526.2-201ENST00000426436 775 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
CACNA1SQ13698 LINC01798-204ENST00000433396 682 ntTSL 3 BASIC7.61□□□□□ -1.19
CACNA1SQ13698 AC002504.1-201ENST00000438281 691 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
CACNA1SQ13698 AC016395.1-201ENST00000444086 465 ntTSL 3 BASIC7.61□□□□□ -1.19
CACNA1SQ13698 AC013549.1-201ENST00000454086 566 ntTSL 3 BASIC7.61□□□□□ -1.19
CACNA1SQ13698 OR52I1-202ENST00000530443 2961 ntAPPRIS P1 BASIC7.61□□□□□ -1.19
CACNA1SQ13698 OR5AP2-201ENST00000544374 1006 ntAPPRIS P1 BASIC7.61□□□□□ -1.19
CACNA1SQ13698 AL356801.1-201ENST00000559320 294 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
CACNA1SQ13698 AC138907.7-201ENST00000568972 358 ntTSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
CACNA1SQ13698 AC130371.1-201ENST00000577023 230 ntTSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
CACNA1SQ13698 AC099850.2-201ENST00000577660 557 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.61□□□□□ -1.19
CACNA1SQ13698 MIR3189-201ENST00000578735 73 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
CACNA1SQ13698 AC008536.1-201ENST00000602872 669 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
CACNA1SQ13698 AP000864.1-201ENST00000609424 650 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
CACNA1SQ13698 GABRA3-204ENST00000535043 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
CACNA1SQ13698 MCM8-205ENST00000610722 7486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
CACNA1SQ13698 MAP3K7CL-209ENST00000399947 2003 ntTSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
CACNA1SQ13698 ERVFRD-1-201ENST00000472091 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
CACNA1SQ13698 VTA1-202ENST00000367630 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
CACNA1SQ13698 CEACAM1-207ENST00000403444 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
CACNA1SQ13698 Z93929.1-201ENST00000418200 1475 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
CACNA1SQ13698 OLFM3-202ENST00000370103 3255 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
CACNA1SQ13698 GRIN2A-202ENST00000396573 14450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
CACNA1SQ13698 CUL1-204ENST00000617797 2508 ntTSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
CACNA1SQ13698 TOP2B-201ENST00000264331 5358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
CACNA1SQ13698 ADA2-201ENST00000262607 3925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
CACNA1SQ13698 ZNF107-206ENST00000620827 5685 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC7.61□□□□□ -1.19
CACNA1SQ13698 DMTF1-204ENST00000413276 3548 ntTSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
CACNA1SQ13698 A2ML1-201ENST00000299698 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
CACNA1SQ13698 MYPN-201ENST00000354393 4596 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
CACNA1SQ13698 NUP107-201ENST00000229179 6457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
CACNA1SQ13698 SSH2-204ENST00000540801 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.6□□□□□ -1.19
CACNA1SQ13698 NCOR1-204ENST00000395851 7950 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
CACNA1SQ13698 RN7SKP59-201ENST00000410520 314 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
CACNA1SQ13698 RN7SKP293-201ENST00000411389 296 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
CACNA1SQ13698 ABCA12-203ENST00000412081 485 ntTSL 2 BASIC7.6□□□□□ -1.19
CACNA1SQ13698 C9orf147-201ENST00000412934 584 ntTSL 3 BASIC7.6□□□□□ -1.19
CACNA1SQ13698 RPL35AP31-201ENST00000418340 337 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
CACNA1SQ13698 CCNB1IP1P1-201ENST00000428976 839 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
CACNA1SQ13698 AL445466.1-201ENST00000448432 357 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
CACNA1SQ13698 AL136982.3-201ENST00000454709 688 ntTSL 3 BASIC7.6□□□□□ -1.19
CACNA1SQ13698 SIAH1P1-201ENST00000479411 923 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
CACNA1SQ13698 IGKV1D-22-201ENST00000518953 324 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
CACNA1SQ13698 AC027026.1-201ENST00000532323 742 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
CACNA1SQ13698 AC007569.1-202ENST00000547282 303 ntTSL 3 BASIC7.6□□□□□ -1.19
CACNA1SQ13698 AL163195.3-202ENST00000555283 578 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC7.6□□□□□ -1.19
CACNA1SQ13698 AC090651.1-201ENST00000567865 634 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
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