Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 AL022319.1-201ENST00000458183 1167 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
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IFT88Q13099 SH3GLB1-202ENST00000482504 1199 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
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IFT88Q13099 NBPF14-210ENST00000621066 3670 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
IFT88Q13099 OSBPL9-206ENST00000453295 2842 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
IFT88Q13099 LINC00240-204ENST00000607607 5607 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
IFT88Q13099 ORC4-214ENST00000535373 6710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
IFT88Q13099 TMEM217-202ENST00000356757 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
IFT88Q13099 CX3CR1-201ENST00000358309 3151 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
IFT88Q13099 AC007744.1-201ENST00000607540 2289 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
IFT88Q13099 ADAM29-203ENST00000445694 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
IFT88Q13099 DGKB-203ENST00000403951 6917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
IFT88Q13099 CDC27P2-201ENST00000425026 1922 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
IFT88Q13099 TOX3-202ENST00000407228 3124 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
IFT88Q13099 PCGF5-204ENST00000543648 7144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
IFT88Q13099 SH3D19-201ENST00000304527 5273 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
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