Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 EGFEM1P-205ENST00000483846 2327 ntTSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
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TRAF1Q13077 CCDC150-202ENST00000409270 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
TRAF1Q13077 AC037459.2-201ENST00000514980 4076 ntTSL 2 BASIC7.37□□□□□ -1.23
TRAF1Q13077 TGFBR3-207ENST00000525962 3927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
TRAF1Q13077 ADTRP-203ENST00000414691 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
TRAF1Q13077 TTC3-201ENST00000354749 9084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
TRAF1Q13077 AC073365.1-203ENST00000641055 1992 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
TRAF1Q13077 AC007359.1-202ENST00000419158 2939 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
TRAF1Q13077 AC008175.1-201ENST00000446299 2939 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
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TRAF1Q13077 AC005828.3-201ENST00000583552 591 ntTSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
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TRAF1Q13077 DSC1-201ENST00000257197 4271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
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TRAF1Q13077 NCOA3-202ENST00000371998 4668 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
TRAF1Q13077 LZTFL1-201ENST00000296135 4073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
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TRAF1Q13077 LINC01002-237ENST00000634025 555 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
TRAF1Q13077 LINC02341-202ENST00000637462 1295 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
TRAF1Q13077 OR8G5-202ENST00000641707 1156 ntAPPRIS P1 BASIC7.36□□□□□ -1.23
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TRAF1Q13077 TMC1-201ENST00000297784 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
TRAF1Q13077 LINC01138-208ENST00000639159 1521 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
TRAF1Q13077 DOCK11P1-201ENST00000553480 5932 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
TRAF1Q13077 AC034229.2-201ENST00000566945 2508 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
TRAF1Q13077 ANKRD31-203ENST00000506364 6207 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
TRAF1Q13077 NAPG-201ENST00000322897 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
TRAF1Q13077 GCNT2-203ENST00000379597 4525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
TRAF1Q13077 ERC2-214ENST00000612797 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
TRAF1Q13077 TMTC3-201ENST00000266712 7203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
TRAF1Q13077 DCTN5-201ENST00000300087 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
TRAF1Q13077 ANKS1B-207ENST00000546960 1383 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
TRAF1Q13077 AC123912.3-201ENST00000600907 1367 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
TRAF1Q13077 KRT39-201ENST00000355612 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
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