Protein–RNA interactions for Protein: P78337

PITX1, Pituitary homeobox 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX1P78337 GBP3-202ENST00000370481 3067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
PITX1P78337 FANCD2-205ENST00000431693 2450 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
PITX1P78337 SNX13-213ENST00000611725 6817 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
PITX1P78337 RIMS1-205ENST00000414192 1787 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
PITX1P78337 SMG1-201ENST00000330588 1588 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
PITX1P78337 CEP112-201ENST00000317442 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
PITX1P78337 RNA5SP350-201ENST00000363298 111 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
PITX1P78337 SNORA43.1-201ENST00000364863 140 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
PITX1P78337 C1orf185-201ENST00000371759 915 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
PITX1P78337 ADPRM-201ENST00000379774 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
PITX1P78337 MIR433-201ENST00000384837 93 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
PITX1P78337 AL451081.1-201ENST00000413159 245 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
PITX1P78337 AC104777.1-202ENST00000413247 774 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
PITX1P78337 AL137071.1-201ENST00000422150 243 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
PITX1P78337 RPSAP65-201ENST00000429660 595 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
PITX1P78337 AL133247.1-201ENST00000435713 646 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
PITX1P78337 CLNS1AP1-201ENST00000435954 682 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
PITX1P78337 AL645936.1-201ENST00000441979 518 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
PITX1P78337 TIMM8BP2-201ENST00000445940 251 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
PITX1P78337 AC103563.5-201ENST00000455643 364 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
PITX1P78337 AC073594.1-201ENST00000462065 364 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
PITX1P78337 RN7SL165P-201ENST00000477476 291 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
PITX1P78337 USP17L23-201ENST00000506619 551 ntAPPRIS P1 BASIC6.5□□□□□ -1.37
PITX1P78337 AC010343.2-201ENST00000510162 224 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
PITX1P78337 AC022469.1-201ENST00000555291 656 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
PITX1P78337 TSSK4-207ENST00000556621 896 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
PITX1P78337 LINC00871-204ENST00000556886 866 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
PITX1P78337 HID1-AS1-201ENST00000577295 815 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
PITX1P78337 RNU4ATAC-201ENST00000580972 127 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
PITX1P78337 MIR4701-201ENST00000583094 63 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
PITX1P78337 AC020915.3-201ENST00000595301 550 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
PITX1P78337 AC011468.3-201ENST00000597886 332 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
PITX1P78337 AP000654.1-201ENST00000602510 1192 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
PITX1P78337 SMIM12P1-201ENST00000603004 274 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
PITX1P78337 AC090953.1-201ENST00000604305 1092 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
PITX1P78337 AC024589.2-201ENST00000605642 1294 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
PITX1P78337 OSTC-205ENST00000613215 876 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
PITX1P78337 CDKN2B-AS_3.1-201ENST00000617587 144 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
PITX1P78337 NBPF25P-202ENST00000619932 3827 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
PITX1P78337 POLA1-202ENST00000379068 5486 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
PITX1P78337 NBPF12-206ENST00000617844 6326 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
PITX1P78337 TPMT-201ENST00000309983 3181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
PITX1P78337 HSDL2-201ENST00000398803 2983 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
PITX1P78337 IBTK-210ENST00000610980 5195 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
PITX1P78337 MEF2C-244ENST00000636998 5936 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
PITX1P78337 LINC01138-208ENST00000639159 1521 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
PITX1P78337 OR52I2-203ENST00000641896 6591 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
PITX1P78337 USP16-201ENST00000334352 3004 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
PITX1P78337 SMC1A-202ENST00000375340 9930 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
PITX1P78337 LINC00702-203ENST00000608792 6300 ntTSL 4 BASIC6.49□□□□□ -1.37
PITX1P78337 NPIPB8-202ENST00000529716 2058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
PITX1P78337 MEF2C-210ENST00000506554 3469 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
PITX1P78337 TRAPPC3L-201ENST00000356128 2421 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
PITX1P78337 RRH-201ENST00000317735 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
PITX1P78337 ESF1-201ENST00000202816 3216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
PITX1P78337 RBMXL1-201ENST00000321792 4799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
PITX1P78337 CCAR1-201ENST00000265872 4683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
PITX1P78337 KCNIP4-202ENST00000382148 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
PITX1P78337 HDAC1P2-201ENST00000453661 1398 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
PITX1P78337 AMPD1-203ENST00000520113 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
PITX1P78337 RNU11-6P-201ENST00000391127 133 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
PITX1P78337 ZNF705B-201ENST00000400120 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
PITX1P78337 GCNT1P4-201ENST00000404096 329 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
PITX1P78337 AL139805.1-201ENST00000407837 289 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
PITX1P78337 RPS20P25-201ENST00000412447 352 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
PITX1P78337 AL353626.3-201ENST00000413399 657 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
PITX1P78337 DSCR4-IT1-201ENST00000417138 424 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
PITX1P78337 C7orf69-201ENST00000418326 675 ntTSL 4 BASIC6.49□□□□□ -1.37
PITX1P78337 AL445224.1-201ENST00000420595 737 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
PITX1P78337 AC016908.1-201ENST00000442571 1219 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
PITX1P78337 GAPDHP23-201ENST00000444823 993 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
PITX1P78337 BCAP29-207ENST00000445771 1157 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
PITX1P78337 AC004594.1-201ENST00000482375 463 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
PITX1P78337 RN7SL741P-201ENST00000482473 289 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
PITX1P78337 AC021006.1-201ENST00000489849 553 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
PITX1P78337 KDELR2-206ENST00000490996 655 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
PITX1P78337 OR7E99P-201ENST00000505750 922 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
PITX1P78337 LINC02512-201ENST00000509548 429 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
PITX1P78337 AC084125.1-201ENST00000525461 429 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
PITX1P78337 EIF4EP5-201ENST00000528228 640 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
PITX1P78337 NPIPB14P-203ENST00000532298 987 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
PITX1P78337 LRTOMT-215ENST00000538478 814 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
PITX1P78337 AC023310.2-201ENST00000553844 547 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
PITX1P78337 AC012050.1-201ENST00000558185 472 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
PITX1P78337 MRPS21P8-201ENST00000569196 235 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
PITX1P78337 RN7SL230P-201ENST00000580835 303 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
PITX1P78337 AC004921.1-201ENST00000608884 733 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
PITX1P78337 AP001885.1-201ENST00000621658 558 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
PITX1P78337 MIR6806-201ENST00000622141 64 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
PITX1P78337 RNF14-204ENST00000394519 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
PITX1P78337 PDE4B-203ENST00000371045 3982 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
PITX1P78337 ZC3H11A-201ENST00000332127 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
PITX1P78337 LCOR-201ENST00000286067 4542 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
PITX1P78337 SPEF2-202ENST00000356031 5681 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
PITX1P78337 LGI1-212ENST00000630184 2936 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
PITX1P78337 PGM3-215ENST00000616566 5905 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
PITX1P78337 SOS1-201ENST00000395038 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
PITX1P78337 ZNF112-201ENST00000337401 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
PITX1P78337 FLJ12825-201ENST00000515617 3942 ntTSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
PITX1P78337 C5orf34-201ENST00000306862 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.7 ms