Protein–RNA interactions for Protein: C9J069

C9orf172, Uncharacterized protein C9orf172, humanhuman

Predictions only

Length 976 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf172C9J069 FCGR3B-202ENST00000367964 2143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
C9orf172C9J069 SNORA10B-201ENST00000384458 133 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
C9orf172C9J069 RPL17P50-201ENST00000396131 546 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
C9orf172C9J069 MIR4435-2HG-203ENST00000409569 514 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
C9orf172C9J069 CYP3A43-205ENST00000415413 990 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
C9orf172C9J069 CLYBL-AS1-201ENST00000416009 621 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
C9orf172C9J069 RPL12P43-201ENST00000420608 499 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
C9orf172C9J069 USP9YP9-201ENST00000429406 715 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
C9orf172C9J069 AC000111.3-201ENST00000433478 193 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
C9orf172C9J069 SUMO2P8-201ENST00000434672 286 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
C9orf172C9J069 NQO1-204ENST00000439109 924 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
C9orf172C9J069 CYP3A5-203ENST00000439761 1075 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
C9orf172C9J069 AL359771.1-201ENST00000441809 379 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
C9orf172C9J069 HGF-206ENST00000444829 1184 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
C9orf172C9J069 NEURL1-AS1-201ENST00000447820 439 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
C9orf172C9J069 AC136489.1-203ENST00000450246 736 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
C9orf172C9J069 MIR4422HG-201ENST00000451250 638 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
C9orf172C9J069 PROX1-AS1-203ENST00000451396 476 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
C9orf172C9J069 SUMO2P10-201ENST00000452006 288 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
C9orf172C9J069 AC005304.1-201ENST00000457609 405 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
C9orf172C9J069 AC108751.4-201ENST00000462931 1001 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
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C9orf172C9J069 RPL7P9-201ENST00000468715 747 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
C9orf172C9J069 ARNTL2-AS1-201ENST00000500498 804 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
C9orf172C9J069 HMGB1P3-201ENST00000502802 616 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
C9orf172C9J069 AC079768.1-201ENST00000503181 711 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
C9orf172C9J069 EIF4E-204ENST00000504432 1132 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
C9orf172C9J069 LINC02271-202ENST00000506379 596 ntTSL 4 BASIC7.29□□□□□ -1.24
C9orf172C9J069 AC110716.1-201ENST00000506934 607 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
C9orf172C9J069 AC145146.2-202ENST00000508118 326 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
C9orf172C9J069 AC113385.1-201ENST00000511468 563 ntTSL 4 BASIC7.29□□□□□ -1.24
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C9orf172C9J069 TBCA-203ENST00000517679 545 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
C9orf172C9J069 IGHVIII-11-1-201ENST00000522733 267 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
C9orf172C9J069 AC079598.4-201ENST00000549647 265 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
C9orf172C9J069 AL352979.2-201ENST00000556988 366 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
C9orf172C9J069 DYNLRB2-204ENST00000562982 492 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
C9orf172C9J069 AC010333.1-201ENST00000563116 563 ntTSL 4 BASIC7.29□□□□□ -1.24
C9orf172C9J069 AC068724.2-201ENST00000565685 532 ntTSL 4 BASIC7.29□□□□□ -1.24
C9orf172C9J069 TEFM-204ENST00000580840 2109 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
C9orf172C9J069 SLC14A2-AS1-203ENST00000592286 528 ntTSL 4 BASIC7.29□□□□□ -1.24
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C9orf172C9J069 FAM13C-215ENST00000614220 3388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
C9orf172C9J069 PUM1-204ENST00000373747 5375 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
C9orf172C9J069 UBXN8-201ENST00000265616 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
C9orf172C9J069 TOM1L1-220ENST00000575333 1849 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
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C9orf172C9J069 AC025569.1-202ENST00000548687 5903 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
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C9orf172C9J069 MAT1A-201ENST00000372213 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
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C9orf172C9J069 ZNF200-201ENST00000396868 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
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C9orf172C9J069 SNTG1-207ENST00000522124 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
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C9orf172C9J069 FAXDC2-201ENST00000326080 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
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C9orf172C9J069 OR56B2P-201ENST00000317102 954 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
C9orf172C9J069 CTSL3P-201ENST00000354530 657 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
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C9orf172C9J069 PPIAP23-201ENST00000420099 497 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
C9orf172C9J069 DYDC1-203ENST00000421924 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
C9orf172C9J069 ARAFP1-201ENST00000422172 605 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
C9orf172C9J069 AC004448.2-201ENST00000422360 586 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
C9orf172C9J069 FABP7P1-201ENST00000424004 391 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
C9orf172C9J069 AF196972.1-201ENST00000445586 653 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
C9orf172C9J069 CASP12-206ENST00000446862 1196 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
C9orf172C9J069 CD200R1L-202ENST00000448932 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
C9orf172C9J069 LINC01755-201ENST00000455010 453 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
C9orf172C9J069 LINC00430-201ENST00000457672 597 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
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