Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6Q9

NCOA3, Nuclear receptor coactivator 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,424 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA3Q9Y6Q9 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
NCOA3Q9Y6Q9 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
NCOA3Q9Y6Q9 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
NCOA3Q9Y6Q9 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
NCOA3Q9Y6Q9 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
NCOA3Q9Y6Q9 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC27.59■■■□□ 2.01
NCOA3Q9Y6Q9 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
NCOA3Q9Y6Q9 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
NCOA3Q9Y6Q9 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
NCOA3Q9Y6Q9 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
NCOA3Q9Y6Q9 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
NCOA3Q9Y6Q9 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
NCOA3Q9Y6Q9 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
NCOA3Q9Y6Q9 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
NCOA3Q9Y6Q9 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
NCOA3Q9Y6Q9 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
NCOA3Q9Y6Q9 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
NCOA3Q9Y6Q9 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
NCOA3Q9Y6Q9 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
NCOA3Q9Y6Q9 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
NCOA3Q9Y6Q9 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
NCOA3Q9Y6Q9 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
NCOA3Q9Y6Q9 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
NCOA3Q9Y6Q9 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC27.58■■■□□ 2.01
NCOA3Q9Y6Q9 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
NCOA3Q9Y6Q9 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC27.58■■■□□ 2.01
NCOA3Q9Y6Q9 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
NCOA3Q9Y6Q9 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
NCOA3Q9Y6Q9 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
NCOA3Q9Y6Q9 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
NCOA3Q9Y6Q9 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
NCOA3Q9Y6Q9 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
NCOA3Q9Y6Q9 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
NCOA3Q9Y6Q9 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
NCOA3Q9Y6Q9 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
NCOA3Q9Y6Q9 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
NCOA3Q9Y6Q9 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
NCOA3Q9Y6Q9 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
NCOA3Q9Y6Q9 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2
NCOA3Q9Y6Q9 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2
NCOA3Q9Y6Q9 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2
NCOA3Q9Y6Q9 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
NCOA3Q9Y6Q9 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
NCOA3Q9Y6Q9 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
NCOA3Q9Y6Q9 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NCOA3Q9Y6Q9 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NCOA3Q9Y6Q9 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NCOA3Q9Y6Q9 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NCOA3Q9Y6Q9 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NCOA3Q9Y6Q9 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
NCOA3Q9Y6Q9 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
NCOA3Q9Y6Q9 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
NCOA3Q9Y6Q9 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
NCOA3Q9Y6Q9 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NCOA3Q9Y6Q9 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
NCOA3Q9Y6Q9 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NCOA3Q9Y6Q9 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NCOA3Q9Y6Q9 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NCOA3Q9Y6Q9 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
NCOA3Q9Y6Q9 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NCOA3Q9Y6Q9 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NCOA3Q9Y6Q9 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NCOA3Q9Y6Q9 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NCOA3Q9Y6Q9 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC27.56■■■□□ 2
NCOA3Q9Y6Q9 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
NCOA3Q9Y6Q9 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC27.56■■■□□ 2
NCOA3Q9Y6Q9 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC27.56■■■□□ 2
NCOA3Q9Y6Q9 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
NCOA3Q9Y6Q9 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NCOA3Q9Y6Q9 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NCOA3Q9Y6Q9 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
NCOA3Q9Y6Q9 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NCOA3Q9Y6Q9 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
NCOA3Q9Y6Q9 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
NCOA3Q9Y6Q9 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC27.55■■■□□ 2
NCOA3Q9Y6Q9 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
NCOA3Q9Y6Q9 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
NCOA3Q9Y6Q9 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
NCOA3Q9Y6Q9 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
NCOA3Q9Y6Q9 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NCOA3Q9Y6Q9 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
NCOA3Q9Y6Q9 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
NCOA3Q9Y6Q9 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NCOA3Q9Y6Q9 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.55■■■□□ 2
NCOA3Q9Y6Q9 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
NCOA3Q9Y6Q9 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
NCOA3Q9Y6Q9 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NCOA3Q9Y6Q9 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC27.55■■■□□ 2
NCOA3Q9Y6Q9 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NCOA3Q9Y6Q9 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
NCOA3Q9Y6Q9 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NCOA3Q9Y6Q9 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC27.55■■■□□ 2
NCOA3Q9Y6Q9 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
NCOA3Q9Y6Q9 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC27.54■■■□□ 2
NCOA3Q9Y6Q9 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
NCOA3Q9Y6Q9 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
NCOA3Q9Y6Q9 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
NCOA3Q9Y6Q9 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
NCOA3Q9Y6Q9 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
NCOA3Q9Y6Q9 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms