Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6D9

MAD1L1, Mitotic spindle assembly checkpoint protein MAD1, humanhuman

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAD1L1Q9Y6D9 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MAD1L1Q9Y6D9 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MAD1L1Q9Y6D9 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MAD1L1Q9Y6D9 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MAD1L1Q9Y6D9 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MAD1L1Q9Y6D9 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MAD1L1Q9Y6D9 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MAD1L1Q9Y6D9 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MAD1L1Q9Y6D9 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MAD1L1Q9Y6D9 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MAD1L1Q9Y6D9 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MAD1L1Q9Y6D9 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MAD1L1Q9Y6D9 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MAD1L1Q9Y6D9 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MAD1L1Q9Y6D9 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
MAD1L1Q9Y6D9 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MAD1L1Q9Y6D9 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
MAD1L1Q9Y6D9 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MAD1L1Q9Y6D9 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MAD1L1Q9Y6D9 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MAD1L1Q9Y6D9 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MAD1L1Q9Y6D9 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MAD1L1Q9Y6D9 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
MAD1L1Q9Y6D9 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MAD1L1Q9Y6D9 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MAD1L1Q9Y6D9 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MAD1L1Q9Y6D9 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MAD1L1Q9Y6D9 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MAD1L1Q9Y6D9 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MAD1L1Q9Y6D9 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MAD1L1Q9Y6D9 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MAD1L1Q9Y6D9 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
MAD1L1Q9Y6D9 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
MAD1L1Q9Y6D9 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
MAD1L1Q9Y6D9 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
MAD1L1Q9Y6D9 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
MAD1L1Q9Y6D9 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MAD1L1Q9Y6D9 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MAD1L1Q9Y6D9 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MAD1L1Q9Y6D9 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MAD1L1Q9Y6D9 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MAD1L1Q9Y6D9 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MAD1L1Q9Y6D9 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MAD1L1Q9Y6D9 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MAD1L1Q9Y6D9 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MAD1L1Q9Y6D9 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MAD1L1Q9Y6D9 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MAD1L1Q9Y6D9 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
MAD1L1Q9Y6D9 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MAD1L1Q9Y6D9 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MAD1L1Q9Y6D9 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MAD1L1Q9Y6D9 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MAD1L1Q9Y6D9 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MAD1L1Q9Y6D9 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MAD1L1Q9Y6D9 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MAD1L1Q9Y6D9 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MAD1L1Q9Y6D9 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MAD1L1Q9Y6D9 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MAD1L1Q9Y6D9 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MAD1L1Q9Y6D9 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MAD1L1Q9Y6D9 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MAD1L1Q9Y6D9 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MAD1L1Q9Y6D9 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MAD1L1Q9Y6D9 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MAD1L1Q9Y6D9 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MAD1L1Q9Y6D9 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MAD1L1Q9Y6D9 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MAD1L1Q9Y6D9 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MAD1L1Q9Y6D9 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
MAD1L1Q9Y6D9 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
MAD1L1Q9Y6D9 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
MAD1L1Q9Y6D9 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MAD1L1Q9Y6D9 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MAD1L1Q9Y6D9 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MAD1L1Q9Y6D9 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MAD1L1Q9Y6D9 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MAD1L1Q9Y6D9 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MAD1L1Q9Y6D9 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MAD1L1Q9Y6D9 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MAD1L1Q9Y6D9 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MAD1L1Q9Y6D9 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MAD1L1Q9Y6D9 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MAD1L1Q9Y6D9 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
MAD1L1Q9Y6D9 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MAD1L1Q9Y6D9 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MAD1L1Q9Y6D9 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MAD1L1Q9Y6D9 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MAD1L1Q9Y6D9 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MAD1L1Q9Y6D9 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MAD1L1Q9Y6D9 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MAD1L1Q9Y6D9 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MAD1L1Q9Y6D9 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
MAD1L1Q9Y6D9 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MAD1L1Q9Y6D9 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MAD1L1Q9Y6D9 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MAD1L1Q9Y6D9 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MAD1L1Q9Y6D9 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MAD1L1Q9Y6D9 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MAD1L1Q9Y6D9 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MAD1L1Q9Y6D9 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms