Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6C7

LINC00312, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00312, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00312Q9Y6C7 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC00312Q9Y6C7 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC00312Q9Y6C7 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC00312Q9Y6C7 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC00312Q9Y6C7 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC00312Q9Y6C7 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC00312Q9Y6C7 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC00312Q9Y6C7 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC00312Q9Y6C7 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC00312Q9Y6C7 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC00312Q9Y6C7 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC00312Q9Y6C7 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC00312Q9Y6C7 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC00312Q9Y6C7 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC00312Q9Y6C7 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC00312Q9Y6C7 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC00312Q9Y6C7 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC00312Q9Y6C7 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC00312Q9Y6C7 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC00312Q9Y6C7 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC00312Q9Y6C7 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC00312Q9Y6C7 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC00312Q9Y6C7 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC00312Q9Y6C7 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC00312Q9Y6C7 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC00312Q9Y6C7 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC00312Q9Y6C7 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC00312Q9Y6C7 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC00312Q9Y6C7 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC00312Q9Y6C7 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC00312Q9Y6C7 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC00312Q9Y6C7 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC00312Q9Y6C7 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC00312Q9Y6C7 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC00312Q9Y6C7 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC00312Q9Y6C7 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC00312Q9Y6C7 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC00312Q9Y6C7 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC00312Q9Y6C7 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC00312Q9Y6C7 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC00312Q9Y6C7 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC00312Q9Y6C7 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC00312Q9Y6C7 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC00312Q9Y6C7 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC00312Q9Y6C7 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC00312Q9Y6C7 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
LINC00312Q9Y6C7 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
LINC00312Q9Y6C7 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
LINC00312Q9Y6C7 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
LINC00312Q9Y6C7 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
LINC00312Q9Y6C7 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
LINC00312Q9Y6C7 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
LINC00312Q9Y6C7 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LINC00312Q9Y6C7 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LINC00312Q9Y6C7 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LINC00312Q9Y6C7 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LINC00312Q9Y6C7 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LINC00312Q9Y6C7 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LINC00312Q9Y6C7 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LINC00312Q9Y6C7 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LINC00312Q9Y6C7 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LINC00312Q9Y6C7 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LINC00312Q9Y6C7 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LINC00312Q9Y6C7 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LINC00312Q9Y6C7 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LINC00312Q9Y6C7 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LINC00312Q9Y6C7 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LINC00312Q9Y6C7 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LINC00312Q9Y6C7 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LINC00312Q9Y6C7 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LINC00312Q9Y6C7 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LINC00312Q9Y6C7 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LINC00312Q9Y6C7 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LINC00312Q9Y6C7 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LINC00312Q9Y6C7 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LINC00312Q9Y6C7 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LINC00312Q9Y6C7 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LINC00312Q9Y6C7 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LINC00312Q9Y6C7 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LINC00312Q9Y6C7 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LINC00312Q9Y6C7 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LINC00312Q9Y6C7 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LINC00312Q9Y6C7 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LINC00312Q9Y6C7 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LINC00312Q9Y6C7 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LINC00312Q9Y6C7 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LINC00312Q9Y6C7 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LINC00312Q9Y6C7 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LINC00312Q9Y6C7 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LINC00312Q9Y6C7 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LINC00312Q9Y6C7 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LINC00312Q9Y6C7 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LINC00312Q9Y6C7 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LINC00312Q9Y6C7 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LINC00312Q9Y6C7 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LINC00312Q9Y6C7 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LINC00312Q9Y6C7 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LINC00312Q9Y6C7 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LINC00312Q9Y6C7 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LINC00312Q9Y6C7 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.5 ms