Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5P4

COL4A3BP, Collagen type IV alpha-3-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 624 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A3BPQ9Y5P4 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
COL4A3BPQ9Y5P4 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
COL4A3BPQ9Y5P4 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
COL4A3BPQ9Y5P4 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
COL4A3BPQ9Y5P4 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
COL4A3BPQ9Y5P4 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
COL4A3BPQ9Y5P4 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
COL4A3BPQ9Y5P4 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
COL4A3BPQ9Y5P4 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
COL4A3BPQ9Y5P4 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
COL4A3BPQ9Y5P4 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
COL4A3BPQ9Y5P4 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
COL4A3BPQ9Y5P4 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
COL4A3BPQ9Y5P4 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
COL4A3BPQ9Y5P4 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
COL4A3BPQ9Y5P4 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
COL4A3BPQ9Y5P4 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
COL4A3BPQ9Y5P4 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
COL4A3BPQ9Y5P4 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
COL4A3BPQ9Y5P4 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
COL4A3BPQ9Y5P4 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
COL4A3BPQ9Y5P4 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
COL4A3BPQ9Y5P4 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
COL4A3BPQ9Y5P4 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
COL4A3BPQ9Y5P4 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
COL4A3BPQ9Y5P4 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
COL4A3BPQ9Y5P4 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
COL4A3BPQ9Y5P4 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
COL4A3BPQ9Y5P4 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
COL4A3BPQ9Y5P4 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
COL4A3BPQ9Y5P4 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
COL4A3BPQ9Y5P4 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
COL4A3BPQ9Y5P4 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
COL4A3BPQ9Y5P4 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
COL4A3BPQ9Y5P4 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
COL4A3BPQ9Y5P4 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
COL4A3BPQ9Y5P4 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
COL4A3BPQ9Y5P4 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
COL4A3BPQ9Y5P4 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
COL4A3BPQ9Y5P4 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
COL4A3BPQ9Y5P4 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
COL4A3BPQ9Y5P4 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
COL4A3BPQ9Y5P4 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
COL4A3BPQ9Y5P4 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
COL4A3BPQ9Y5P4 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
COL4A3BPQ9Y5P4 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
COL4A3BPQ9Y5P4 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
COL4A3BPQ9Y5P4 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
COL4A3BPQ9Y5P4 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
COL4A3BPQ9Y5P4 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
COL4A3BPQ9Y5P4 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
COL4A3BPQ9Y5P4 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
COL4A3BPQ9Y5P4 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
COL4A3BPQ9Y5P4 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
COL4A3BPQ9Y5P4 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
COL4A3BPQ9Y5P4 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
COL4A3BPQ9Y5P4 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
COL4A3BPQ9Y5P4 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
COL4A3BPQ9Y5P4 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
COL4A3BPQ9Y5P4 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
COL4A3BPQ9Y5P4 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
COL4A3BPQ9Y5P4 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
COL4A3BPQ9Y5P4 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
COL4A3BPQ9Y5P4 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
COL4A3BPQ9Y5P4 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
COL4A3BPQ9Y5P4 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
COL4A3BPQ9Y5P4 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
COL4A3BPQ9Y5P4 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
COL4A3BPQ9Y5P4 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
COL4A3BPQ9Y5P4 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
COL4A3BPQ9Y5P4 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
COL4A3BPQ9Y5P4 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
COL4A3BPQ9Y5P4 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
COL4A3BPQ9Y5P4 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
COL4A3BPQ9Y5P4 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
COL4A3BPQ9Y5P4 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
COL4A3BPQ9Y5P4 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
COL4A3BPQ9Y5P4 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
COL4A3BPQ9Y5P4 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
COL4A3BPQ9Y5P4 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
COL4A3BPQ9Y5P4 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
COL4A3BPQ9Y5P4 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
COL4A3BPQ9Y5P4 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
COL4A3BPQ9Y5P4 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
COL4A3BPQ9Y5P4 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
COL4A3BPQ9Y5P4 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
COL4A3BPQ9Y5P4 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
COL4A3BPQ9Y5P4 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
COL4A3BPQ9Y5P4 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
COL4A3BPQ9Y5P4 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
COL4A3BPQ9Y5P4 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
COL4A3BPQ9Y5P4 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
COL4A3BPQ9Y5P4 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
COL4A3BPQ9Y5P4 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
COL4A3BPQ9Y5P4 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
COL4A3BPQ9Y5P4 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
COL4A3BPQ9Y5P4 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
COL4A3BPQ9Y5P4 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
COL4A3BPQ9Y5P4 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
COL4A3BPQ9Y5P4 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms