Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5M8

SRPRB, Signal recognition particle receptor subunit beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRPRBQ9Y5M8 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SRPRBQ9Y5M8 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SRPRBQ9Y5M8 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SRPRBQ9Y5M8 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SRPRBQ9Y5M8 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SRPRBQ9Y5M8 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SRPRBQ9Y5M8 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SRPRBQ9Y5M8 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SRPRBQ9Y5M8 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SRPRBQ9Y5M8 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SRPRBQ9Y5M8 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SRPRBQ9Y5M8 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SRPRBQ9Y5M8 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SRPRBQ9Y5M8 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SRPRBQ9Y5M8 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SRPRBQ9Y5M8 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SRPRBQ9Y5M8 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SRPRBQ9Y5M8 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SRPRBQ9Y5M8 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SRPRBQ9Y5M8 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SRPRBQ9Y5M8 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SRPRBQ9Y5M8 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SRPRBQ9Y5M8 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SRPRBQ9Y5M8 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SRPRBQ9Y5M8 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SRPRBQ9Y5M8 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SRPRBQ9Y5M8 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SRPRBQ9Y5M8 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SRPRBQ9Y5M8 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SRPRBQ9Y5M8 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SRPRBQ9Y5M8 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SRPRBQ9Y5M8 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SRPRBQ9Y5M8 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SRPRBQ9Y5M8 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SRPRBQ9Y5M8 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SRPRBQ9Y5M8 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SRPRBQ9Y5M8 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SRPRBQ9Y5M8 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SRPRBQ9Y5M8 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SRPRBQ9Y5M8 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SRPRBQ9Y5M8 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SRPRBQ9Y5M8 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SRPRBQ9Y5M8 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SRPRBQ9Y5M8 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SRPRBQ9Y5M8 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SRPRBQ9Y5M8 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SRPRBQ9Y5M8 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SRPRBQ9Y5M8 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SRPRBQ9Y5M8 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SRPRBQ9Y5M8 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SRPRBQ9Y5M8 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SRPRBQ9Y5M8 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SRPRBQ9Y5M8 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SRPRBQ9Y5M8 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SRPRBQ9Y5M8 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SRPRBQ9Y5M8 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SRPRBQ9Y5M8 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SRPRBQ9Y5M8 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SRPRBQ9Y5M8 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SRPRBQ9Y5M8 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SRPRBQ9Y5M8 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SRPRBQ9Y5M8 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SRPRBQ9Y5M8 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SRPRBQ9Y5M8 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SRPRBQ9Y5M8 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SRPRBQ9Y5M8 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SRPRBQ9Y5M8 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SRPRBQ9Y5M8 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SRPRBQ9Y5M8 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SRPRBQ9Y5M8 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SRPRBQ9Y5M8 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SRPRBQ9Y5M8 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SRPRBQ9Y5M8 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SRPRBQ9Y5M8 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SRPRBQ9Y5M8 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SRPRBQ9Y5M8 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SRPRBQ9Y5M8 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SRPRBQ9Y5M8 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SRPRBQ9Y5M8 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SRPRBQ9Y5M8 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SRPRBQ9Y5M8 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SRPRBQ9Y5M8 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SRPRBQ9Y5M8 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SRPRBQ9Y5M8 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SRPRBQ9Y5M8 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SRPRBQ9Y5M8 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SRPRBQ9Y5M8 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SRPRBQ9Y5M8 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SRPRBQ9Y5M8 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SRPRBQ9Y5M8 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SRPRBQ9Y5M8 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SRPRBQ9Y5M8 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SRPRBQ9Y5M8 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SRPRBQ9Y5M8 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SRPRBQ9Y5M8 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SRPRBQ9Y5M8 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SRPRBQ9Y5M8 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SRPRBQ9Y5M8 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SRPRBQ9Y5M8 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SRPRBQ9Y5M8 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms