Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4W6

AFG3L2, AFG3-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFG3L2Q9Y4W6 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
AFG3L2Q9Y4W6 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
AFG3L2Q9Y4W6 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
AFG3L2Q9Y4W6 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
AFG3L2Q9Y4W6 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
AFG3L2Q9Y4W6 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
AFG3L2Q9Y4W6 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
AFG3L2Q9Y4W6 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
AFG3L2Q9Y4W6 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
AFG3L2Q9Y4W6 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
AFG3L2Q9Y4W6 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
AFG3L2Q9Y4W6 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
AFG3L2Q9Y4W6 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
AFG3L2Q9Y4W6 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
AFG3L2Q9Y4W6 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
AFG3L2Q9Y4W6 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
AFG3L2Q9Y4W6 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
AFG3L2Q9Y4W6 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
AFG3L2Q9Y4W6 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
AFG3L2Q9Y4W6 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
AFG3L2Q9Y4W6 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
AFG3L2Q9Y4W6 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
AFG3L2Q9Y4W6 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
AFG3L2Q9Y4W6 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
AFG3L2Q9Y4W6 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
AFG3L2Q9Y4W6 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
AFG3L2Q9Y4W6 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
AFG3L2Q9Y4W6 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
AFG3L2Q9Y4W6 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
AFG3L2Q9Y4W6 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
AFG3L2Q9Y4W6 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
AFG3L2Q9Y4W6 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
AFG3L2Q9Y4W6 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
AFG3L2Q9Y4W6 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
AFG3L2Q9Y4W6 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
AFG3L2Q9Y4W6 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
AFG3L2Q9Y4W6 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
AFG3L2Q9Y4W6 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
AFG3L2Q9Y4W6 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
AFG3L2Q9Y4W6 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
AFG3L2Q9Y4W6 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
AFG3L2Q9Y4W6 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
AFG3L2Q9Y4W6 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
AFG3L2Q9Y4W6 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
AFG3L2Q9Y4W6 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
AFG3L2Q9Y4W6 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
AFG3L2Q9Y4W6 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
AFG3L2Q9Y4W6 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
AFG3L2Q9Y4W6 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
AFG3L2Q9Y4W6 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
AFG3L2Q9Y4W6 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
AFG3L2Q9Y4W6 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
AFG3L2Q9Y4W6 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
AFG3L2Q9Y4W6 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC23■■□□□ 1.27
AFG3L2Q9Y4W6 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
AFG3L2Q9Y4W6 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
AFG3L2Q9Y4W6 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
AFG3L2Q9Y4W6 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
AFG3L2Q9Y4W6 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
AFG3L2Q9Y4W6 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
AFG3L2Q9Y4W6 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
AFG3L2Q9Y4W6 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
AFG3L2Q9Y4W6 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
AFG3L2Q9Y4W6 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
AFG3L2Q9Y4W6 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
AFG3L2Q9Y4W6 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
AFG3L2Q9Y4W6 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
AFG3L2Q9Y4W6 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
AFG3L2Q9Y4W6 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
AFG3L2Q9Y4W6 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
AFG3L2Q9Y4W6 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
AFG3L2Q9Y4W6 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
AFG3L2Q9Y4W6 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
AFG3L2Q9Y4W6 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
AFG3L2Q9Y4W6 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
AFG3L2Q9Y4W6 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
AFG3L2Q9Y4W6 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
AFG3L2Q9Y4W6 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
AFG3L2Q9Y4W6 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
AFG3L2Q9Y4W6 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
AFG3L2Q9Y4W6 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
AFG3L2Q9Y4W6 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
AFG3L2Q9Y4W6 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
AFG3L2Q9Y4W6 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
AFG3L2Q9Y4W6 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
AFG3L2Q9Y4W6 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
AFG3L2Q9Y4W6 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
AFG3L2Q9Y4W6 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
AFG3L2Q9Y4W6 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
AFG3L2Q9Y4W6 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
AFG3L2Q9Y4W6 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
AFG3L2Q9Y4W6 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
AFG3L2Q9Y4W6 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
AFG3L2Q9Y4W6 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
AFG3L2Q9Y4W6 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
AFG3L2Q9Y4W6 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
AFG3L2Q9Y4W6 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
AFG3L2Q9Y4W6 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
AFG3L2Q9Y4W6 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
AFG3L2Q9Y4W6 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms