Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2X7

GIT1, ARF GTPase-activating protein GIT1, humanhuman

Predictions only

Length 761 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIT1Q9Y2X7 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GIT1Q9Y2X7 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GIT1Q9Y2X7 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GIT1Q9Y2X7 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GIT1Q9Y2X7 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
GIT1Q9Y2X7 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GIT1Q9Y2X7 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GIT1Q9Y2X7 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
GIT1Q9Y2X7 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GIT1Q9Y2X7 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GIT1Q9Y2X7 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GIT1Q9Y2X7 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GIT1Q9Y2X7 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GIT1Q9Y2X7 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GIT1Q9Y2X7 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
GIT1Q9Y2X7 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GIT1Q9Y2X7 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GIT1Q9Y2X7 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GIT1Q9Y2X7 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GIT1Q9Y2X7 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GIT1Q9Y2X7 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GIT1Q9Y2X7 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
GIT1Q9Y2X7 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GIT1Q9Y2X7 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GIT1Q9Y2X7 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GIT1Q9Y2X7 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GIT1Q9Y2X7 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GIT1Q9Y2X7 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
GIT1Q9Y2X7 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
GIT1Q9Y2X7 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GIT1Q9Y2X7 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GIT1Q9Y2X7 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
GIT1Q9Y2X7 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GIT1Q9Y2X7 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
GIT1Q9Y2X7 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GIT1Q9Y2X7 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GIT1Q9Y2X7 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GIT1Q9Y2X7 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC21.32■■□□□ 1
GIT1Q9Y2X7 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
GIT1Q9Y2X7 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
GIT1Q9Y2X7 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GIT1Q9Y2X7 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GIT1Q9Y2X7 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
GIT1Q9Y2X7 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
GIT1Q9Y2X7 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
GIT1Q9Y2X7 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GIT1Q9Y2X7 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC21.32■■□□□ 1
GIT1Q9Y2X7 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GIT1Q9Y2X7 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
GIT1Q9Y2X7 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GIT1Q9Y2X7 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GIT1Q9Y2X7 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC21.31■■□□□ 1
GIT1Q9Y2X7 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GIT1Q9Y2X7 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GIT1Q9Y2X7 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
GIT1Q9Y2X7 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
GIT1Q9Y2X7 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GIT1Q9Y2X7 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
GIT1Q9Y2X7 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
GIT1Q9Y2X7 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
GIT1Q9Y2X7 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
GIT1Q9Y2X7 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC21.31■■□□□ 1
GIT1Q9Y2X7 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
GIT1Q9Y2X7 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
GIT1Q9Y2X7 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GIT1Q9Y2X7 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
GIT1Q9Y2X7 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GIT1Q9Y2X7 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GIT1Q9Y2X7 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
GIT1Q9Y2X7 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GIT1Q9Y2X7 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
GIT1Q9Y2X7 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC21.3■■□□□ 1
GIT1Q9Y2X7 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GIT1Q9Y2X7 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
GIT1Q9Y2X7 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
GIT1Q9Y2X7 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
GIT1Q9Y2X7 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
GIT1Q9Y2X7 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
GIT1Q9Y2X7 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
GIT1Q9Y2X7 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GIT1Q9Y2X7 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GIT1Q9Y2X7 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GIT1Q9Y2X7 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GIT1Q9Y2X7 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GIT1Q9Y2X7 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
GIT1Q9Y2X7 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GIT1Q9Y2X7 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GIT1Q9Y2X7 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GIT1Q9Y2X7 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GIT1Q9Y2X7 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
GIT1Q9Y2X7 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
GIT1Q9Y2X7 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
GIT1Q9Y2X7 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GIT1Q9Y2X7 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GIT1Q9Y2X7 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC21.29■■□□□ 1
GIT1Q9Y2X7 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC21.29■■□□□ 1
GIT1Q9Y2X7 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GIT1Q9Y2X7 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GIT1Q9Y2X7 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GIT1Q9Y2X7 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.8 ms