Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2X3

NOP58, Nucleolar protein 58, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOP58Q9Y2X3 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NOP58Q9Y2X3 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NOP58Q9Y2X3 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NOP58Q9Y2X3 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NOP58Q9Y2X3 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NOP58Q9Y2X3 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NOP58Q9Y2X3 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
NOP58Q9Y2X3 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NOP58Q9Y2X3 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NOP58Q9Y2X3 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NOP58Q9Y2X3 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NOP58Q9Y2X3 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NOP58Q9Y2X3 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NOP58Q9Y2X3 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NOP58Q9Y2X3 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
NOP58Q9Y2X3 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NOP58Q9Y2X3 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NOP58Q9Y2X3 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NOP58Q9Y2X3 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NOP58Q9Y2X3 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NOP58Q9Y2X3 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NOP58Q9Y2X3 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NOP58Q9Y2X3 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NOP58Q9Y2X3 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NOP58Q9Y2X3 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NOP58Q9Y2X3 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NOP58Q9Y2X3 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NOP58Q9Y2X3 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NOP58Q9Y2X3 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NOP58Q9Y2X3 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NOP58Q9Y2X3 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NOP58Q9Y2X3 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NOP58Q9Y2X3 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
NOP58Q9Y2X3 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NOP58Q9Y2X3 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NOP58Q9Y2X3 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
NOP58Q9Y2X3 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NOP58Q9Y2X3 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NOP58Q9Y2X3 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NOP58Q9Y2X3 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NOP58Q9Y2X3 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NOP58Q9Y2X3 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NOP58Q9Y2X3 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NOP58Q9Y2X3 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NOP58Q9Y2X3 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NOP58Q9Y2X3 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NOP58Q9Y2X3 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NOP58Q9Y2X3 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NOP58Q9Y2X3 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NOP58Q9Y2X3 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NOP58Q9Y2X3 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NOP58Q9Y2X3 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NOP58Q9Y2X3 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NOP58Q9Y2X3 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NOP58Q9Y2X3 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NOP58Q9Y2X3 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NOP58Q9Y2X3 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NOP58Q9Y2X3 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NOP58Q9Y2X3 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NOP58Q9Y2X3 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
NOP58Q9Y2X3 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
NOP58Q9Y2X3 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NOP58Q9Y2X3 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NOP58Q9Y2X3 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
NOP58Q9Y2X3 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
NOP58Q9Y2X3 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
NOP58Q9Y2X3 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NOP58Q9Y2X3 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NOP58Q9Y2X3 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NOP58Q9Y2X3 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NOP58Q9Y2X3 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NOP58Q9Y2X3 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NOP58Q9Y2X3 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NOP58Q9Y2X3 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NOP58Q9Y2X3 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NOP58Q9Y2X3 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NOP58Q9Y2X3 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
NOP58Q9Y2X3 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
NOP58Q9Y2X3 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
NOP58Q9Y2X3 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NOP58Q9Y2X3 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
NOP58Q9Y2X3 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NOP58Q9Y2X3 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NOP58Q9Y2X3 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NOP58Q9Y2X3 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NOP58Q9Y2X3 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NOP58Q9Y2X3 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NOP58Q9Y2X3 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NOP58Q9Y2X3 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NOP58Q9Y2X3 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NOP58Q9Y2X3 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NOP58Q9Y2X3 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NOP58Q9Y2X3 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NOP58Q9Y2X3 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NOP58Q9Y2X3 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NOP58Q9Y2X3 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NOP58Q9Y2X3 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NOP58Q9Y2X3 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NOP58Q9Y2X3 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NOP58Q9Y2X3 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms