Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y256

RCE1, CAAX prenyl protease 2, humanhuman

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCE1Q9Y256 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RCE1Q9Y256 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RCE1Q9Y256 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
RCE1Q9Y256 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
RCE1Q9Y256 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RCE1Q9Y256 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RCE1Q9Y256 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RCE1Q9Y256 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RCE1Q9Y256 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RCE1Q9Y256 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RCE1Q9Y256 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RCE1Q9Y256 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RCE1Q9Y256 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RCE1Q9Y256 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RCE1Q9Y256 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RCE1Q9Y256 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RCE1Q9Y256 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RCE1Q9Y256 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RCE1Q9Y256 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RCE1Q9Y256 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RCE1Q9Y256 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RCE1Q9Y256 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RCE1Q9Y256 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
RCE1Q9Y256 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RCE1Q9Y256 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RCE1Q9Y256 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RCE1Q9Y256 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RCE1Q9Y256 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RCE1Q9Y256 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RCE1Q9Y256 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RCE1Q9Y256 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RCE1Q9Y256 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RCE1Q9Y256 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RCE1Q9Y256 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RCE1Q9Y256 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RCE1Q9Y256 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RCE1Q9Y256 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RCE1Q9Y256 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RCE1Q9Y256 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RCE1Q9Y256 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RCE1Q9Y256 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RCE1Q9Y256 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RCE1Q9Y256 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RCE1Q9Y256 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RCE1Q9Y256 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RCE1Q9Y256 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RCE1Q9Y256 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RCE1Q9Y256 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
RCE1Q9Y256 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RCE1Q9Y256 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RCE1Q9Y256 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RCE1Q9Y256 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RCE1Q9Y256 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RCE1Q9Y256 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RCE1Q9Y256 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RCE1Q9Y256 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RCE1Q9Y256 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
RCE1Q9Y256 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RCE1Q9Y256 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
RCE1Q9Y256 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
RCE1Q9Y256 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
RCE1Q9Y256 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RCE1Q9Y256 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RCE1Q9Y256 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RCE1Q9Y256 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RCE1Q9Y256 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RCE1Q9Y256 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RCE1Q9Y256 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RCE1Q9Y256 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RCE1Q9Y256 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RCE1Q9Y256 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RCE1Q9Y256 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
RCE1Q9Y256 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RCE1Q9Y256 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RCE1Q9Y256 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RCE1Q9Y256 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RCE1Q9Y256 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
RCE1Q9Y256 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RCE1Q9Y256 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RCE1Q9Y256 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RCE1Q9Y256 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RCE1Q9Y256 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RCE1Q9Y256 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
RCE1Q9Y256 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RCE1Q9Y256 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
RCE1Q9Y256 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RCE1Q9Y256 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RCE1Q9Y256 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RCE1Q9Y256 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RCE1Q9Y256 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RCE1Q9Y256 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RCE1Q9Y256 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RCE1Q9Y256 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
RCE1Q9Y256 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
RCE1Q9Y256 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RCE1Q9Y256 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RCE1Q9Y256 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RCE1Q9Y256 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RCE1Q9Y256 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RCE1Q9Y256 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms