Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPU9

SAMD4A, Protein Smaug homolog 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD4AQ9UPU9 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SAMD4AQ9UPU9 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SAMD4AQ9UPU9 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SAMD4AQ9UPU9 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SAMD4AQ9UPU9 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SAMD4AQ9UPU9 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SAMD4AQ9UPU9 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SAMD4AQ9UPU9 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SAMD4AQ9UPU9 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SAMD4AQ9UPU9 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SAMD4AQ9UPU9 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SAMD4AQ9UPU9 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SAMD4AQ9UPU9 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SAMD4AQ9UPU9 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SAMD4AQ9UPU9 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SAMD4AQ9UPU9 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SAMD4AQ9UPU9 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SAMD4AQ9UPU9 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SAMD4AQ9UPU9 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SAMD4AQ9UPU9 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SAMD4AQ9UPU9 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SAMD4AQ9UPU9 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SAMD4AQ9UPU9 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SAMD4AQ9UPU9 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SAMD4AQ9UPU9 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SAMD4AQ9UPU9 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SAMD4AQ9UPU9 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SAMD4AQ9UPU9 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SAMD4AQ9UPU9 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SAMD4AQ9UPU9 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SAMD4AQ9UPU9 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SAMD4AQ9UPU9 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SAMD4AQ9UPU9 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SAMD4AQ9UPU9 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SAMD4AQ9UPU9 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SAMD4AQ9UPU9 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SAMD4AQ9UPU9 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SAMD4AQ9UPU9 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SAMD4AQ9UPU9 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SAMD4AQ9UPU9 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SAMD4AQ9UPU9 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SAMD4AQ9UPU9 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SAMD4AQ9UPU9 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SAMD4AQ9UPU9 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SAMD4AQ9UPU9 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SAMD4AQ9UPU9 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SAMD4AQ9UPU9 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SAMD4AQ9UPU9 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SAMD4AQ9UPU9 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SAMD4AQ9UPU9 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SAMD4AQ9UPU9 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SAMD4AQ9UPU9 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SAMD4AQ9UPU9 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SAMD4AQ9UPU9 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SAMD4AQ9UPU9 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SAMD4AQ9UPU9 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SAMD4AQ9UPU9 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SAMD4AQ9UPU9 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SAMD4AQ9UPU9 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SAMD4AQ9UPU9 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SAMD4AQ9UPU9 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SAMD4AQ9UPU9 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SAMD4AQ9UPU9 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SAMD4AQ9UPU9 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SAMD4AQ9UPU9 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SAMD4AQ9UPU9 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SAMD4AQ9UPU9 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SAMD4AQ9UPU9 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SAMD4AQ9UPU9 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SAMD4AQ9UPU9 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SAMD4AQ9UPU9 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SAMD4AQ9UPU9 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SAMD4AQ9UPU9 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SAMD4AQ9UPU9 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SAMD4AQ9UPU9 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SAMD4AQ9UPU9 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SAMD4AQ9UPU9 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SAMD4AQ9UPU9 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SAMD4AQ9UPU9 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SAMD4AQ9UPU9 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SAMD4AQ9UPU9 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SAMD4AQ9UPU9 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SAMD4AQ9UPU9 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SAMD4AQ9UPU9 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SAMD4AQ9UPU9 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SAMD4AQ9UPU9 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SAMD4AQ9UPU9 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SAMD4AQ9UPU9 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SAMD4AQ9UPU9 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SAMD4AQ9UPU9 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SAMD4AQ9UPU9 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SAMD4AQ9UPU9 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SAMD4AQ9UPU9 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SAMD4AQ9UPU9 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SAMD4AQ9UPU9 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SAMD4AQ9UPU9 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SAMD4AQ9UPU9 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SAMD4AQ9UPU9 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SAMD4AQ9UPU9 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SAMD4AQ9UPU9 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.3 ms