Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ7

PDZRN3, E3 ubiquitin-protein ligase PDZRN3, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZRN3Q9UPQ7 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PDZRN3Q9UPQ7 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PDZRN3Q9UPQ7 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PDZRN3Q9UPQ7 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PDZRN3Q9UPQ7 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PDZRN3Q9UPQ7 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PDZRN3Q9UPQ7 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PDZRN3Q9UPQ7 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PDZRN3Q9UPQ7 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PDZRN3Q9UPQ7 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PDZRN3Q9UPQ7 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PDZRN3Q9UPQ7 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
PDZRN3Q9UPQ7 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PDZRN3Q9UPQ7 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PDZRN3Q9UPQ7 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PDZRN3Q9UPQ7 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PDZRN3Q9UPQ7 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PDZRN3Q9UPQ7 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PDZRN3Q9UPQ7 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PDZRN3Q9UPQ7 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PDZRN3Q9UPQ7 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PDZRN3Q9UPQ7 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PDZRN3Q9UPQ7 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PDZRN3Q9UPQ7 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
PDZRN3Q9UPQ7 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PDZRN3Q9UPQ7 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PDZRN3Q9UPQ7 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PDZRN3Q9UPQ7 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PDZRN3Q9UPQ7 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PDZRN3Q9UPQ7 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PDZRN3Q9UPQ7 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PDZRN3Q9UPQ7 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PDZRN3Q9UPQ7 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PDZRN3Q9UPQ7 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PDZRN3Q9UPQ7 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PDZRN3Q9UPQ7 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PDZRN3Q9UPQ7 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PDZRN3Q9UPQ7 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PDZRN3Q9UPQ7 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PDZRN3Q9UPQ7 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PDZRN3Q9UPQ7 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PDZRN3Q9UPQ7 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PDZRN3Q9UPQ7 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PDZRN3Q9UPQ7 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
PDZRN3Q9UPQ7 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PDZRN3Q9UPQ7 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
PDZRN3Q9UPQ7 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PDZRN3Q9UPQ7 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PDZRN3Q9UPQ7 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PDZRN3Q9UPQ7 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PDZRN3Q9UPQ7 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PDZRN3Q9UPQ7 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PDZRN3Q9UPQ7 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PDZRN3Q9UPQ7 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PDZRN3Q9UPQ7 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PDZRN3Q9UPQ7 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PDZRN3Q9UPQ7 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PDZRN3Q9UPQ7 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PDZRN3Q9UPQ7 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PDZRN3Q9UPQ7 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PDZRN3Q9UPQ7 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PDZRN3Q9UPQ7 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PDZRN3Q9UPQ7 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PDZRN3Q9UPQ7 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PDZRN3Q9UPQ7 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PDZRN3Q9UPQ7 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PDZRN3Q9UPQ7 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PDZRN3Q9UPQ7 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PDZRN3Q9UPQ7 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PDZRN3Q9UPQ7 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PDZRN3Q9UPQ7 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PDZRN3Q9UPQ7 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PDZRN3Q9UPQ7 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PDZRN3Q9UPQ7 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PDZRN3Q9UPQ7 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PDZRN3Q9UPQ7 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PDZRN3Q9UPQ7 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PDZRN3Q9UPQ7 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PDZRN3Q9UPQ7 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PDZRN3Q9UPQ7 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PDZRN3Q9UPQ7 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PDZRN3Q9UPQ7 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PDZRN3Q9UPQ7 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
PDZRN3Q9UPQ7 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PDZRN3Q9UPQ7 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PDZRN3Q9UPQ7 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PDZRN3Q9UPQ7 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PDZRN3Q9UPQ7 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PDZRN3Q9UPQ7 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PDZRN3Q9UPQ7 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PDZRN3Q9UPQ7 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
PDZRN3Q9UPQ7 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PDZRN3Q9UPQ7 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PDZRN3Q9UPQ7 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
PDZRN3Q9UPQ7 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PDZRN3Q9UPQ7 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PDZRN3Q9UPQ7 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PDZRN3Q9UPQ7 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PDZRN3Q9UPQ7 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PDZRN3Q9UPQ7 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms