Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL01

DSE, Dermatan-sulfate epimerase, humanhuman

Predictions only

Length 958 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSEQ9UL01 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
DSEQ9UL01 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
DSEQ9UL01 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
DSEQ9UL01 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
DSEQ9UL01 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
DSEQ9UL01 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
DSEQ9UL01 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
DSEQ9UL01 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
DSEQ9UL01 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
DSEQ9UL01 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
DSEQ9UL01 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
DSEQ9UL01 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
DSEQ9UL01 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
DSEQ9UL01 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
DSEQ9UL01 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
DSEQ9UL01 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
DSEQ9UL01 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
DSEQ9UL01 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
DSEQ9UL01 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
DSEQ9UL01 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
DSEQ9UL01 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
DSEQ9UL01 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
DSEQ9UL01 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
DSEQ9UL01 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
DSEQ9UL01 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC21.04■□□□□ 0.96
DSEQ9UL01 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
DSEQ9UL01 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
DSEQ9UL01 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
DSEQ9UL01 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC21.04■□□□□ 0.96
DSEQ9UL01 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
DSEQ9UL01 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC21.04■□□□□ 0.96
DSEQ9UL01 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
DSEQ9UL01 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
DSEQ9UL01 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
DSEQ9UL01 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
DSEQ9UL01 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
DSEQ9UL01 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
DSEQ9UL01 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
DSEQ9UL01 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
DSEQ9UL01 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
DSEQ9UL01 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
DSEQ9UL01 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
DSEQ9UL01 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
DSEQ9UL01 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
DSEQ9UL01 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
DSEQ9UL01 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
DSEQ9UL01 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
DSEQ9UL01 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
DSEQ9UL01 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
DSEQ9UL01 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
DSEQ9UL01 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
DSEQ9UL01 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
DSEQ9UL01 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
DSEQ9UL01 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
DSEQ9UL01 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC21.03■□□□□ 0.96
DSEQ9UL01 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
DSEQ9UL01 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
DSEQ9UL01 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC21.03■□□□□ 0.96
DSEQ9UL01 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
DSEQ9UL01 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
DSEQ9UL01 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
DSEQ9UL01 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
DSEQ9UL01 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
DSEQ9UL01 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
DSEQ9UL01 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
DSEQ9UL01 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
DSEQ9UL01 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
DSEQ9UL01 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
DSEQ9UL01 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
DSEQ9UL01 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
DSEQ9UL01 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
DSEQ9UL01 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
DSEQ9UL01 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
DSEQ9UL01 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
DSEQ9UL01 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
DSEQ9UL01 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
DSEQ9UL01 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
DSEQ9UL01 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
DSEQ9UL01 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
DSEQ9UL01 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
DSEQ9UL01 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC21.02■□□□□ 0.96
DSEQ9UL01 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
DSEQ9UL01 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
DSEQ9UL01 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
DSEQ9UL01 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
DSEQ9UL01 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
DSEQ9UL01 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
DSEQ9UL01 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
DSEQ9UL01 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
DSEQ9UL01 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
DSEQ9UL01 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
DSEQ9UL01 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
DSEQ9UL01 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
DSEQ9UL01 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
DSEQ9UL01 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
DSEQ9UL01 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
DSEQ9UL01 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
DSEQ9UL01 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
DSEQ9UL01 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
DSEQ9UL01 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms