Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKL3

CASP8AP2, CASP8-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,982 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP8AP2Q9UKL3 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CASP8AP2Q9UKL3 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CASP8AP2Q9UKL3 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CASP8AP2Q9UKL3 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CASP8AP2Q9UKL3 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CASP8AP2Q9UKL3 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
CASP8AP2Q9UKL3 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
CASP8AP2Q9UKL3 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.23
CASP8AP2Q9UKL3 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.23
CASP8AP2Q9UKL3 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CASP8AP2Q9UKL3 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CASP8AP2Q9UKL3 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CASP8AP2Q9UKL3 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CASP8AP2Q9UKL3 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CASP8AP2Q9UKL3 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CASP8AP2Q9UKL3 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CASP8AP2Q9UKL3 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CASP8AP2Q9UKL3 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CASP8AP2Q9UKL3 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CASP8AP2Q9UKL3 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CASP8AP2Q9UKL3 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CASP8AP2Q9UKL3 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CASP8AP2Q9UKL3 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CASP8AP2Q9UKL3 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CASP8AP2Q9UKL3 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CASP8AP2Q9UKL3 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CASP8AP2Q9UKL3 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CASP8AP2Q9UKL3 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CASP8AP2Q9UKL3 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CASP8AP2Q9UKL3 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CASP8AP2Q9UKL3 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CASP8AP2Q9UKL3 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CASP8AP2Q9UKL3 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CASP8AP2Q9UKL3 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CASP8AP2Q9UKL3 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CASP8AP2Q9UKL3 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CASP8AP2Q9UKL3 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CASP8AP2Q9UKL3 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CASP8AP2Q9UKL3 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CASP8AP2Q9UKL3 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CASP8AP2Q9UKL3 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CASP8AP2Q9UKL3 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CASP8AP2Q9UKL3 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CASP8AP2Q9UKL3 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CASP8AP2Q9UKL3 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CASP8AP2Q9UKL3 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CASP8AP2Q9UKL3 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CASP8AP2Q9UKL3 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CASP8AP2Q9UKL3 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CASP8AP2Q9UKL3 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CASP8AP2Q9UKL3 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CASP8AP2Q9UKL3 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CASP8AP2Q9UKL3 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CASP8AP2Q9UKL3 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CASP8AP2Q9UKL3 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CASP8AP2Q9UKL3 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CASP8AP2Q9UKL3 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CASP8AP2Q9UKL3 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CASP8AP2Q9UKL3 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CASP8AP2Q9UKL3 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CASP8AP2Q9UKL3 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CASP8AP2Q9UKL3 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CASP8AP2Q9UKL3 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CASP8AP2Q9UKL3 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CASP8AP2Q9UKL3 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CASP8AP2Q9UKL3 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CASP8AP2Q9UKL3 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CASP8AP2Q9UKL3 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CASP8AP2Q9UKL3 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CASP8AP2Q9UKL3 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CASP8AP2Q9UKL3 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CASP8AP2Q9UKL3 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CASP8AP2Q9UKL3 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CASP8AP2Q9UKL3 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CASP8AP2Q9UKL3 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CASP8AP2Q9UKL3 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CASP8AP2Q9UKL3 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CASP8AP2Q9UKL3 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CASP8AP2Q9UKL3 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CASP8AP2Q9UKL3 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CASP8AP2Q9UKL3 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CASP8AP2Q9UKL3 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CASP8AP2Q9UKL3 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CASP8AP2Q9UKL3 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CASP8AP2Q9UKL3 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CASP8AP2Q9UKL3 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CASP8AP2Q9UKL3 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CASP8AP2Q9UKL3 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CASP8AP2Q9UKL3 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CASP8AP2Q9UKL3 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CASP8AP2Q9UKL3 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CASP8AP2Q9UKL3 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CASP8AP2Q9UKL3 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CASP8AP2Q9UKL3 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CASP8AP2Q9UKL3 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CASP8AP2Q9UKL3 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CASP8AP2Q9UKL3 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CASP8AP2Q9UKL3 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CASP8AP2Q9UKL3 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CASP8AP2Q9UKL3 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms