Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJU5

FOXD3, Forkhead box protein D3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD3Q9UJU5 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
FOXD3Q9UJU5 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
FOXD3Q9UJU5 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
FOXD3Q9UJU5 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
FOXD3Q9UJU5 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
FOXD3Q9UJU5 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
FOXD3Q9UJU5 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
FOXD3Q9UJU5 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
FOXD3Q9UJU5 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
FOXD3Q9UJU5 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
FOXD3Q9UJU5 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
FOXD3Q9UJU5 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
FOXD3Q9UJU5 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
FOXD3Q9UJU5 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
FOXD3Q9UJU5 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
FOXD3Q9UJU5 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
FOXD3Q9UJU5 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
FOXD3Q9UJU5 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
FOXD3Q9UJU5 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
FOXD3Q9UJU5 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
FOXD3Q9UJU5 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
FOXD3Q9UJU5 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
FOXD3Q9UJU5 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
FOXD3Q9UJU5 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
FOXD3Q9UJU5 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
FOXD3Q9UJU5 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
FOXD3Q9UJU5 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
FOXD3Q9UJU5 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
FOXD3Q9UJU5 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
FOXD3Q9UJU5 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
FOXD3Q9UJU5 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
FOXD3Q9UJU5 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FOXD3Q9UJU5 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FOXD3Q9UJU5 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
FOXD3Q9UJU5 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
FOXD3Q9UJU5 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
FOXD3Q9UJU5 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
FOXD3Q9UJU5 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FOXD3Q9UJU5 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
FOXD3Q9UJU5 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
FOXD3Q9UJU5 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
FOXD3Q9UJU5 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
FOXD3Q9UJU5 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FOXD3Q9UJU5 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FOXD3Q9UJU5 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FOXD3Q9UJU5 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
FOXD3Q9UJU5 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FOXD3Q9UJU5 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FOXD3Q9UJU5 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
FOXD3Q9UJU5 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FOXD3Q9UJU5 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FOXD3Q9UJU5 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
FOXD3Q9UJU5 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
FOXD3Q9UJU5 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FOXD3Q9UJU5 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FOXD3Q9UJU5 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FOXD3Q9UJU5 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
FOXD3Q9UJU5 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
FOXD3Q9UJU5 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FOXD3Q9UJU5 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FOXD3Q9UJU5 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
FOXD3Q9UJU5 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FOXD3Q9UJU5 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FOXD3Q9UJU5 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
FOXD3Q9UJU5 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FOXD3Q9UJU5 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
FOXD3Q9UJU5 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FOXD3Q9UJU5 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FOXD3Q9UJU5 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FOXD3Q9UJU5 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FOXD3Q9UJU5 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FOXD3Q9UJU5 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FOXD3Q9UJU5 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FOXD3Q9UJU5 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
FOXD3Q9UJU5 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
FOXD3Q9UJU5 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FOXD3Q9UJU5 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FOXD3Q9UJU5 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
FOXD3Q9UJU5 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
FOXD3Q9UJU5 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
FOXD3Q9UJU5 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
FOXD3Q9UJU5 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FOXD3Q9UJU5 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FOXD3Q9UJU5 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FOXD3Q9UJU5 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
FOXD3Q9UJU5 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
FOXD3Q9UJU5 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
FOXD3Q9UJU5 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
FOXD3Q9UJU5 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
FOXD3Q9UJU5 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
FOXD3Q9UJU5 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
FOXD3Q9UJU5 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
FOXD3Q9UJU5 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
FOXD3Q9UJU5 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
FOXD3Q9UJU5 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
FOXD3Q9UJU5 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
FOXD3Q9UJU5 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
FOXD3Q9UJU5 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
FOXD3Q9UJU5 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
FOXD3Q9UJU5 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms