Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIW2

PLXNA1, Plexin-A1, humanhuman

Predictions only

Length 1,896 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXNA1Q9UIW2 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PLXNA1Q9UIW2 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PLXNA1Q9UIW2 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PLXNA1Q9UIW2 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PLXNA1Q9UIW2 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PLXNA1Q9UIW2 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PLXNA1Q9UIW2 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PLXNA1Q9UIW2 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PLXNA1Q9UIW2 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PLXNA1Q9UIW2 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PLXNA1Q9UIW2 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PLXNA1Q9UIW2 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PLXNA1Q9UIW2 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PLXNA1Q9UIW2 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PLXNA1Q9UIW2 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PLXNA1Q9UIW2 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PLXNA1Q9UIW2 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PLXNA1Q9UIW2 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PLXNA1Q9UIW2 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PLXNA1Q9UIW2 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PLXNA1Q9UIW2 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PLXNA1Q9UIW2 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PLXNA1Q9UIW2 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PLXNA1Q9UIW2 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PLXNA1Q9UIW2 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PLXNA1Q9UIW2 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PLXNA1Q9UIW2 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PLXNA1Q9UIW2 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PLXNA1Q9UIW2 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PLXNA1Q9UIW2 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PLXNA1Q9UIW2 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PLXNA1Q9UIW2 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PLXNA1Q9UIW2 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PLXNA1Q9UIW2 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PLXNA1Q9UIW2 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PLXNA1Q9UIW2 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PLXNA1Q9UIW2 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PLXNA1Q9UIW2 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PLXNA1Q9UIW2 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PLXNA1Q9UIW2 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PLXNA1Q9UIW2 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PLXNA1Q9UIW2 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PLXNA1Q9UIW2 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PLXNA1Q9UIW2 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PLXNA1Q9UIW2 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PLXNA1Q9UIW2 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PLXNA1Q9UIW2 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PLXNA1Q9UIW2 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PLXNA1Q9UIW2 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PLXNA1Q9UIW2 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PLXNA1Q9UIW2 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PLXNA1Q9UIW2 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PLXNA1Q9UIW2 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PLXNA1Q9UIW2 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PLXNA1Q9UIW2 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PLXNA1Q9UIW2 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PLXNA1Q9UIW2 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PLXNA1Q9UIW2 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PLXNA1Q9UIW2 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PLXNA1Q9UIW2 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PLXNA1Q9UIW2 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PLXNA1Q9UIW2 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PLXNA1Q9UIW2 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PLXNA1Q9UIW2 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PLXNA1Q9UIW2 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PLXNA1Q9UIW2 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PLXNA1Q9UIW2 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PLXNA1Q9UIW2 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PLXNA1Q9UIW2 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PLXNA1Q9UIW2 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PLXNA1Q9UIW2 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PLXNA1Q9UIW2 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PLXNA1Q9UIW2 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PLXNA1Q9UIW2 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PLXNA1Q9UIW2 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PLXNA1Q9UIW2 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PLXNA1Q9UIW2 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PLXNA1Q9UIW2 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PLXNA1Q9UIW2 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PLXNA1Q9UIW2 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PLXNA1Q9UIW2 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PLXNA1Q9UIW2 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PLXNA1Q9UIW2 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PLXNA1Q9UIW2 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PLXNA1Q9UIW2 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PLXNA1Q9UIW2 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PLXNA1Q9UIW2 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PLXNA1Q9UIW2 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PLXNA1Q9UIW2 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PLXNA1Q9UIW2 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PLXNA1Q9UIW2 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PLXNA1Q9UIW2 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PLXNA1Q9UIW2 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PLXNA1Q9UIW2 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PLXNA1Q9UIW2 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PLXNA1Q9UIW2 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PLXNA1Q9UIW2 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PLXNA1Q9UIW2 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PLXNA1Q9UIW2 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PLXNA1Q9UIW2 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms