Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIS9

MBD1, Methyl-CpG-binding domain protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD1Q9UIS9 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
MBD1Q9UIS9 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
MBD1Q9UIS9 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
MBD1Q9UIS9 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
MBD1Q9UIS9 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
MBD1Q9UIS9 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
MBD1Q9UIS9 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
MBD1Q9UIS9 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
MBD1Q9UIS9 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
MBD1Q9UIS9 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
MBD1Q9UIS9 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
MBD1Q9UIS9 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
MBD1Q9UIS9 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
MBD1Q9UIS9 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
MBD1Q9UIS9 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
MBD1Q9UIS9 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
MBD1Q9UIS9 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
MBD1Q9UIS9 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC20■□□□□ 0.79
MBD1Q9UIS9 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
MBD1Q9UIS9 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
MBD1Q9UIS9 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
MBD1Q9UIS9 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
MBD1Q9UIS9 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
MBD1Q9UIS9 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
MBD1Q9UIS9 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
MBD1Q9UIS9 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
MBD1Q9UIS9 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
MBD1Q9UIS9 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
MBD1Q9UIS9 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
MBD1Q9UIS9 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
MBD1Q9UIS9 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
MBD1Q9UIS9 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
MBD1Q9UIS9 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
MBD1Q9UIS9 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
MBD1Q9UIS9 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
MBD1Q9UIS9 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
MBD1Q9UIS9 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
MBD1Q9UIS9 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
MBD1Q9UIS9 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
MBD1Q9UIS9 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
MBD1Q9UIS9 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
MBD1Q9UIS9 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
MBD1Q9UIS9 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
MBD1Q9UIS9 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
MBD1Q9UIS9 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
MBD1Q9UIS9 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
MBD1Q9UIS9 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
MBD1Q9UIS9 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
MBD1Q9UIS9 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
MBD1Q9UIS9 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
MBD1Q9UIS9 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
MBD1Q9UIS9 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
MBD1Q9UIS9 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
MBD1Q9UIS9 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
MBD1Q9UIS9 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
MBD1Q9UIS9 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
MBD1Q9UIS9 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
MBD1Q9UIS9 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
MBD1Q9UIS9 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
MBD1Q9UIS9 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
MBD1Q9UIS9 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
MBD1Q9UIS9 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
MBD1Q9UIS9 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
MBD1Q9UIS9 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
MBD1Q9UIS9 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
MBD1Q9UIS9 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
MBD1Q9UIS9 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
MBD1Q9UIS9 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
MBD1Q9UIS9 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
MBD1Q9UIS9 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
MBD1Q9UIS9 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
MBD1Q9UIS9 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
MBD1Q9UIS9 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
MBD1Q9UIS9 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
MBD1Q9UIS9 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
MBD1Q9UIS9 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
MBD1Q9UIS9 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
MBD1Q9UIS9 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
MBD1Q9UIS9 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
MBD1Q9UIS9 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
MBD1Q9UIS9 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
MBD1Q9UIS9 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
MBD1Q9UIS9 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
MBD1Q9UIS9 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
MBD1Q9UIS9 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
MBD1Q9UIS9 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
MBD1Q9UIS9 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
MBD1Q9UIS9 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
MBD1Q9UIS9 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
MBD1Q9UIS9 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
MBD1Q9UIS9 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
MBD1Q9UIS9 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
MBD1Q9UIS9 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
MBD1Q9UIS9 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
MBD1Q9UIS9 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
MBD1Q9UIS9 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC19.96■□□□□ 0.79
MBD1Q9UIS9 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
MBD1Q9UIS9 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
MBD1Q9UIS9 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
MBD1Q9UIS9 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms