Protein–RNA interactions for Protein: Q9UG63

ABCF2, ATP-binding cassette sub-family F member 2, humanhuman

Predictions only

Length 623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCF2Q9UG63 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
ABCF2Q9UG63 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ABCF2Q9UG63 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ABCF2Q9UG63 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ABCF2Q9UG63 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ABCF2Q9UG63 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ABCF2Q9UG63 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ABCF2Q9UG63 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ABCF2Q9UG63 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ABCF2Q9UG63 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ABCF2Q9UG63 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ABCF2Q9UG63 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ABCF2Q9UG63 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ABCF2Q9UG63 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ABCF2Q9UG63 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ABCF2Q9UG63 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
ABCF2Q9UG63 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
ABCF2Q9UG63 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ABCF2Q9UG63 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
ABCF2Q9UG63 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ABCF2Q9UG63 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ABCF2Q9UG63 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ABCF2Q9UG63 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ABCF2Q9UG63 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ABCF2Q9UG63 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ABCF2Q9UG63 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ABCF2Q9UG63 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ABCF2Q9UG63 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ABCF2Q9UG63 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ABCF2Q9UG63 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ABCF2Q9UG63 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ABCF2Q9UG63 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ABCF2Q9UG63 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ABCF2Q9UG63 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
ABCF2Q9UG63 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ABCF2Q9UG63 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ABCF2Q9UG63 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ABCF2Q9UG63 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ABCF2Q9UG63 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ABCF2Q9UG63 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ABCF2Q9UG63 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ABCF2Q9UG63 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ABCF2Q9UG63 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ABCF2Q9UG63 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ABCF2Q9UG63 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ABCF2Q9UG63 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ABCF2Q9UG63 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ABCF2Q9UG63 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ABCF2Q9UG63 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ABCF2Q9UG63 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ABCF2Q9UG63 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ABCF2Q9UG63 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ABCF2Q9UG63 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ABCF2Q9UG63 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ABCF2Q9UG63 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ABCF2Q9UG63 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ABCF2Q9UG63 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
ABCF2Q9UG63 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ABCF2Q9UG63 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ABCF2Q9UG63 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ABCF2Q9UG63 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ABCF2Q9UG63 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ABCF2Q9UG63 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ABCF2Q9UG63 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ABCF2Q9UG63 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ABCF2Q9UG63 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ABCF2Q9UG63 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ABCF2Q9UG63 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ABCF2Q9UG63 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ABCF2Q9UG63 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ABCF2Q9UG63 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ABCF2Q9UG63 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ABCF2Q9UG63 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ABCF2Q9UG63 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ABCF2Q9UG63 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ABCF2Q9UG63 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ABCF2Q9UG63 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ABCF2Q9UG63 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ABCF2Q9UG63 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ABCF2Q9UG63 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ABCF2Q9UG63 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ABCF2Q9UG63 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ABCF2Q9UG63 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ABCF2Q9UG63 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ABCF2Q9UG63 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
ABCF2Q9UG63 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ABCF2Q9UG63 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ABCF2Q9UG63 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ABCF2Q9UG63 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ABCF2Q9UG63 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ABCF2Q9UG63 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ABCF2Q9UG63 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ABCF2Q9UG63 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ABCF2Q9UG63 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ABCF2Q9UG63 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ABCF2Q9UG63 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
ABCF2Q9UG63 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ABCF2Q9UG63 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ABCF2Q9UG63 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ABCF2Q9UG63 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.1 ms