Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBZ4

APEX2, DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase 2, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APEX2Q9UBZ4 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
APEX2Q9UBZ4 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
APEX2Q9UBZ4 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
APEX2Q9UBZ4 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
APEX2Q9UBZ4 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
APEX2Q9UBZ4 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
APEX2Q9UBZ4 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
APEX2Q9UBZ4 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
APEX2Q9UBZ4 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
APEX2Q9UBZ4 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
APEX2Q9UBZ4 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
APEX2Q9UBZ4 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
APEX2Q9UBZ4 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
APEX2Q9UBZ4 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC21.31■■□□□ 1
APEX2Q9UBZ4 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
APEX2Q9UBZ4 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
APEX2Q9UBZ4 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
APEX2Q9UBZ4 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
APEX2Q9UBZ4 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC21.31■■□□□ 1
APEX2Q9UBZ4 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
APEX2Q9UBZ4 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
APEX2Q9UBZ4 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
APEX2Q9UBZ4 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
APEX2Q9UBZ4 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
APEX2Q9UBZ4 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
APEX2Q9UBZ4 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
APEX2Q9UBZ4 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
APEX2Q9UBZ4 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
APEX2Q9UBZ4 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
APEX2Q9UBZ4 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
APEX2Q9UBZ4 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
APEX2Q9UBZ4 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
APEX2Q9UBZ4 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
APEX2Q9UBZ4 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
APEX2Q9UBZ4 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
APEX2Q9UBZ4 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC21.3■■□□□ 1
APEX2Q9UBZ4 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
APEX2Q9UBZ4 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC21.3■■□□□ 1
APEX2Q9UBZ4 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
APEX2Q9UBZ4 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
APEX2Q9UBZ4 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
APEX2Q9UBZ4 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
APEX2Q9UBZ4 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
APEX2Q9UBZ4 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
APEX2Q9UBZ4 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
APEX2Q9UBZ4 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
APEX2Q9UBZ4 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
APEX2Q9UBZ4 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
APEX2Q9UBZ4 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC21.29■■□□□ 1
APEX2Q9UBZ4 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
APEX2Q9UBZ4 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
APEX2Q9UBZ4 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
APEX2Q9UBZ4 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC21.29■■□□□ 1
APEX2Q9UBZ4 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC21.29■■□□□ 1
APEX2Q9UBZ4 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
APEX2Q9UBZ4 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC21.29■■□□□ 1
APEX2Q9UBZ4 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
APEX2Q9UBZ4 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
APEX2Q9UBZ4 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
APEX2Q9UBZ4 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
APEX2Q9UBZ4 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
APEX2Q9UBZ4 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC21.29■■□□□ 1
APEX2Q9UBZ4 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC21.29■■□□□ 1
APEX2Q9UBZ4 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
APEX2Q9UBZ4 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
APEX2Q9UBZ4 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
APEX2Q9UBZ4 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
APEX2Q9UBZ4 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC21.29■■□□□ 1
APEX2Q9UBZ4 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
APEX2Q9UBZ4 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
APEX2Q9UBZ4 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
APEX2Q9UBZ4 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
APEX2Q9UBZ4 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
APEX2Q9UBZ4 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
APEX2Q9UBZ4 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
APEX2Q9UBZ4 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
APEX2Q9UBZ4 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
APEX2Q9UBZ4 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
APEX2Q9UBZ4 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
APEX2Q9UBZ4 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
APEX2Q9UBZ4 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
APEX2Q9UBZ4 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
APEX2Q9UBZ4 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
APEX2Q9UBZ4 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
APEX2Q9UBZ4 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
APEX2Q9UBZ4 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
APEX2Q9UBZ4 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
APEX2Q9UBZ4 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
APEX2Q9UBZ4 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
APEX2Q9UBZ4 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
APEX2Q9UBZ4 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
APEX2Q9UBZ4 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
APEX2Q9UBZ4 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
APEX2Q9UBZ4 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
APEX2Q9UBZ4 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
APEX2Q9UBZ4 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
APEX2Q9UBZ4 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
APEX2Q9UBZ4 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
APEX2Q9UBZ4 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
APEX2Q9UBZ4 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms