Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBY8

CLN8, Protein CLN8, humanhuman

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN8Q9UBY8 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLN8Q9UBY8 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLN8Q9UBY8 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLN8Q9UBY8 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLN8Q9UBY8 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLN8Q9UBY8 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLN8Q9UBY8 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLN8Q9UBY8 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLN8Q9UBY8 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLN8Q9UBY8 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLN8Q9UBY8 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CLN8Q9UBY8 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLN8Q9UBY8 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLN8Q9UBY8 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLN8Q9UBY8 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CLN8Q9UBY8 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLN8Q9UBY8 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLN8Q9UBY8 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLN8Q9UBY8 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLN8Q9UBY8 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLN8Q9UBY8 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLN8Q9UBY8 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLN8Q9UBY8 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLN8Q9UBY8 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLN8Q9UBY8 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLN8Q9UBY8 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLN8Q9UBY8 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CLN8Q9UBY8 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLN8Q9UBY8 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CLN8Q9UBY8 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLN8Q9UBY8 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLN8Q9UBY8 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLN8Q9UBY8 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLN8Q9UBY8 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLN8Q9UBY8 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLN8Q9UBY8 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLN8Q9UBY8 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLN8Q9UBY8 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLN8Q9UBY8 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLN8Q9UBY8 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLN8Q9UBY8 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLN8Q9UBY8 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLN8Q9UBY8 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
CLN8Q9UBY8 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLN8Q9UBY8 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLN8Q9UBY8 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLN8Q9UBY8 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLN8Q9UBY8 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLN8Q9UBY8 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLN8Q9UBY8 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLN8Q9UBY8 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLN8Q9UBY8 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLN8Q9UBY8 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLN8Q9UBY8 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLN8Q9UBY8 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLN8Q9UBY8 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLN8Q9UBY8 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLN8Q9UBY8 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLN8Q9UBY8 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLN8Q9UBY8 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLN8Q9UBY8 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLN8Q9UBY8 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLN8Q9UBY8 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLN8Q9UBY8 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLN8Q9UBY8 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLN8Q9UBY8 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLN8Q9UBY8 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLN8Q9UBY8 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLN8Q9UBY8 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLN8Q9UBY8 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLN8Q9UBY8 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLN8Q9UBY8 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLN8Q9UBY8 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLN8Q9UBY8 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLN8Q9UBY8 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLN8Q9UBY8 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLN8Q9UBY8 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLN8Q9UBY8 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLN8Q9UBY8 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLN8Q9UBY8 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLN8Q9UBY8 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLN8Q9UBY8 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLN8Q9UBY8 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CLN8Q9UBY8 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CLN8Q9UBY8 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CLN8Q9UBY8 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLN8Q9UBY8 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLN8Q9UBY8 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CLN8Q9UBY8 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CLN8Q9UBY8 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CLN8Q9UBY8 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLN8Q9UBY8 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLN8Q9UBY8 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLN8Q9UBY8 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLN8Q9UBY8 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLN8Q9UBY8 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CLN8Q9UBY8 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLN8Q9UBY8 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLN8Q9UBY8 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLN8Q9UBY8 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms