Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT6

POLK, DNA polymerase kappa, humanhuman

Predictions only

Length 870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLKQ9UBT6 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
POLKQ9UBT6 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
POLKQ9UBT6 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
POLKQ9UBT6 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
POLKQ9UBT6 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
POLKQ9UBT6 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
POLKQ9UBT6 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
POLKQ9UBT6 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
POLKQ9UBT6 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
POLKQ9UBT6 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC26.52■■□□□ 1.84
POLKQ9UBT6 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
POLKQ9UBT6 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
POLKQ9UBT6 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
POLKQ9UBT6 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
POLKQ9UBT6 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
POLKQ9UBT6 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
POLKQ9UBT6 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
POLKQ9UBT6 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
POLKQ9UBT6 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
POLKQ9UBT6 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
POLKQ9UBT6 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
POLKQ9UBT6 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
POLKQ9UBT6 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
POLKQ9UBT6 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
POLKQ9UBT6 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
POLKQ9UBT6 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
POLKQ9UBT6 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
POLKQ9UBT6 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
POLKQ9UBT6 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
POLKQ9UBT6 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
POLKQ9UBT6 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
POLKQ9UBT6 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
POLKQ9UBT6 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
POLKQ9UBT6 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
POLKQ9UBT6 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
POLKQ9UBT6 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
POLKQ9UBT6 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
POLKQ9UBT6 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
POLKQ9UBT6 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
POLKQ9UBT6 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
POLKQ9UBT6 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
POLKQ9UBT6 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
POLKQ9UBT6 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
POLKQ9UBT6 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
POLKQ9UBT6 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
POLKQ9UBT6 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
POLKQ9UBT6 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
POLKQ9UBT6 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
POLKQ9UBT6 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
POLKQ9UBT6 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
POLKQ9UBT6 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
POLKQ9UBT6 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC26.49■■□□□ 1.83
POLKQ9UBT6 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
POLKQ9UBT6 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
POLKQ9UBT6 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
POLKQ9UBT6 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
POLKQ9UBT6 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
POLKQ9UBT6 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
POLKQ9UBT6 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
POLKQ9UBT6 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
POLKQ9UBT6 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
POLKQ9UBT6 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
POLKQ9UBT6 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
POLKQ9UBT6 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
POLKQ9UBT6 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
POLKQ9UBT6 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
POLKQ9UBT6 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
POLKQ9UBT6 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
POLKQ9UBT6 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
POLKQ9UBT6 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC26.47■■□□□ 1.83
POLKQ9UBT6 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC26.47■■□□□ 1.83
POLKQ9UBT6 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
POLKQ9UBT6 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
POLKQ9UBT6 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
POLKQ9UBT6 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
POLKQ9UBT6 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
POLKQ9UBT6 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
POLKQ9UBT6 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
POLKQ9UBT6 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
POLKQ9UBT6 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
POLKQ9UBT6 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
POLKQ9UBT6 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
POLKQ9UBT6 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
POLKQ9UBT6 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
POLKQ9UBT6 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
POLKQ9UBT6 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
POLKQ9UBT6 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
POLKQ9UBT6 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
POLKQ9UBT6 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
POLKQ9UBT6 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
POLKQ9UBT6 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
POLKQ9UBT6 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
POLKQ9UBT6 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
POLKQ9UBT6 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
POLKQ9UBT6 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
POLKQ9UBT6 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
POLKQ9UBT6 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
POLKQ9UBT6 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
POLKQ9UBT6 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
POLKQ9UBT6 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms