Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2M1

LRP2BP, LRP2-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP2BPQ9P2M1 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LRP2BPQ9P2M1 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LRP2BPQ9P2M1 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LRP2BPQ9P2M1 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LRP2BPQ9P2M1 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
LRP2BPQ9P2M1 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LRP2BPQ9P2M1 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LRP2BPQ9P2M1 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LRP2BPQ9P2M1 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LRP2BPQ9P2M1 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LRP2BPQ9P2M1 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LRP2BPQ9P2M1 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LRP2BPQ9P2M1 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LRP2BPQ9P2M1 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LRP2BPQ9P2M1 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LRP2BPQ9P2M1 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.42
LRP2BPQ9P2M1 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
LRP2BPQ9P2M1 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
LRP2BPQ9P2M1 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
LRP2BPQ9P2M1 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
LRP2BPQ9P2M1 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
LRP2BPQ9P2M1 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
LRP2BPQ9P2M1 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
LRP2BPQ9P2M1 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
LRP2BPQ9P2M1 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
LRP2BPQ9P2M1 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
LRP2BPQ9P2M1 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
LRP2BPQ9P2M1 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
LRP2BPQ9P2M1 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
LRP2BPQ9P2M1 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
LRP2BPQ9P2M1 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
LRP2BPQ9P2M1 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
LRP2BPQ9P2M1 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
LRP2BPQ9P2M1 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
LRP2BPQ9P2M1 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
LRP2BPQ9P2M1 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
LRP2BPQ9P2M1 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LRP2BPQ9P2M1 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LRP2BPQ9P2M1 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LRP2BPQ9P2M1 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
LRP2BPQ9P2M1 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LRP2BPQ9P2M1 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LRP2BPQ9P2M1 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LRP2BPQ9P2M1 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LRP2BPQ9P2M1 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LRP2BPQ9P2M1 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LRP2BPQ9P2M1 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LRP2BPQ9P2M1 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LRP2BPQ9P2M1 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LRP2BPQ9P2M1 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LRP2BPQ9P2M1 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LRP2BPQ9P2M1 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LRP2BPQ9P2M1 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LRP2BPQ9P2M1 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LRP2BPQ9P2M1 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LRP2BPQ9P2M1 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LRP2BPQ9P2M1 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LRP2BPQ9P2M1 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LRP2BPQ9P2M1 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LRP2BPQ9P2M1 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LRP2BPQ9P2M1 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LRP2BPQ9P2M1 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LRP2BPQ9P2M1 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LRP2BPQ9P2M1 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LRP2BPQ9P2M1 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LRP2BPQ9P2M1 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LRP2BPQ9P2M1 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LRP2BPQ9P2M1 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LRP2BPQ9P2M1 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LRP2BPQ9P2M1 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LRP2BPQ9P2M1 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LRP2BPQ9P2M1 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LRP2BPQ9P2M1 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LRP2BPQ9P2M1 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LRP2BPQ9P2M1 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LRP2BPQ9P2M1 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LRP2BPQ9P2M1 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LRP2BPQ9P2M1 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LRP2BPQ9P2M1 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LRP2BPQ9P2M1 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LRP2BPQ9P2M1 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
LRP2BPQ9P2M1 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LRP2BPQ9P2M1 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LRP2BPQ9P2M1 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LRP2BPQ9P2M1 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LRP2BPQ9P2M1 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LRP2BPQ9P2M1 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LRP2BPQ9P2M1 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LRP2BPQ9P2M1 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LRP2BPQ9P2M1 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LRP2BPQ9P2M1 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
LRP2BPQ9P2M1 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
LRP2BPQ9P2M1 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
LRP2BPQ9P2M1 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
LRP2BPQ9P2M1 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
LRP2BPQ9P2M1 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LRP2BPQ9P2M1 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
LRP2BPQ9P2M1 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LRP2BPQ9P2M1 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LRP2BPQ9P2M1 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms